Расовая антропология
3.28K subscribers
6.11K photos
10 videos
3 files
2.92K links
Расово-антропологическая школа, новости генетики, теория эволюции, расовые различия, наследственность
Download Telegram
Тибетцы унаследовали от денисовских людей ген, спасающий от гипоксии

Ген EPAS1 — транскрипционный фактор, который включается при недостатке кислорода. Он регулирует давление в сосудах, развитие и работу сердечной мышцы. У тибетцев, как выяснилось, работают специфические аллели этого гена, которые, помимо всего, увеличивают количество гемоглобина в крови. Это — адаптация к высокогорным условиям с пониженным количеством кислорода. Такие специфические «тибетские» аллели чрезвычайно редки: из всей мировой базы данных по геномам разных народов они встретились только у двух представителей китайских народностей. Но самое интересное, что эти же «тибетские» аллели найдены в ископаемом образце денисовского человека. Значит, тибетцы сохранили наследие денисовских людей, доставшееся им от потомства от смешанных пар. Генетики обсуждают эту находку на страницах журнала Nature.
Раскопки в Денисовой пещере велись десятилетиями, археологи за это время собрали обширную коллекцию орудий, артефактов древних обитателей или посетителей пещеры. Среди 80 тысяч палеонтологических и археологических находок имелись и знаменательные: пара зубов, косточка от стопы и косточка фаланги мизинца древнейших людей. Зуб (один или оба) и стопа, вероятно, неандертальского происхождения, а вот мизинчик, как оказалось, принадлежал девочке непонятного роду-племени. За дело взялись генетики, до того потратившие не меньше десятилетия, чтобы изобрести и усовершенствовать методы расшифровки ископаемых геномов. Косточка от мизинчика, как показала расшифровка, принадлежала не сапиенсам и не неандертальцам, а особым денисовским людям. По особенностям геномов они оказались ближе к эректусам и к неандертальцам, чем к современным людям (см. Геном денисовского человека отсеквенирован с высокой точностью, «Элементы», 06.09.2012).

С генной подписи нового члена человеческого рода начался следующий этап исследований денисовских обитателей, который должен был утвердить их место среди остальных человеческих сородичей. Сравнивая частоту тех или иных аллелей, ученые определили, что денисовцы оставили заметное генетическое наследство южно-азиатским народам Меланезии, и что его след у жителей Европы, Африки, Индии, Пакистана и североамериканских индейцев существенно ниже (см. Нашествие денисовцев). По частоте специфичных нуклеотидных замен в Х- и Y-хромосомах сложилось представление, что денисовские кавалеры с успехом выбирали жен из племени сапиенсов, оставляя жизнеспособное потомство; обратное — денисовские женщины в паре с сапиентными мужьями — оказывалось не столь удачным вариантом.

И вот теперь в этой сюжетной линии появилось новое звено — адаптивная роль привнесенных денисовских генов. Различные чужеродные аллели (часто говорят просто «гены») добавляются в геном в результате скрещиваний. Так добавились в геном сапиенсов и гены денисовцев (и неандертальцев). Дальнейшая судьба новых вариантов может быть различна, она зависит от случайного дрейфа, от адаптивной пользы привнесенного аллеля и от его взаимодействия с новым генетическим окружением. Чаще всего генетики предполагают случайный дрейф, наложенный на миграционную активность популяций. Но бывают и случаи адаптивного закрепления. Так, среди приобретенных неандертальских аллелей нашлись такие, которые укрепили иммунную защиту человека, определили цвет кожи, структуру волос (см. Между сапиенсами и неандертальцами существовала частичная репродуктивная изоляция, «Элементы», 03.02.2014); эти гены были поддержаны отбором. Теперь в арсенале антропологов имеется еще один, безупречный по своей доказательности и наглядности случай очевидного адаптивного закрепления гена денисовцев в геноме современных людей. Он описан командой генетиков из 20 научных лабораторий пяти стран под руководством Расмуса Нильсена (Rasmus Nielsen) из Центра эволюционной геномики Калифорнийского университета в Беркли.

Речь идет о гене EPAS1. Это транскрипционный фактор, который включается, когда снижается уровень кислорода. Он регулирует давление в сосудах, развитие и работу сердечной мышцы. У тибетцев, как выяснилось, работают редкие аллели этого гена, которые, помимо всего, увеличивают количество гемоглобина в крови. Число эритроцитов остается при этом прежним. Носители «тибетских» вариантов имеют повышенный уровень гемоглобина, где бы они ни жили. Для «тибетских» аллелей выявлен ряд специфических нуклеотидных замен EPAS1. Ясно, что «тибетские» варианты выработались как приспособление к высокогорным условиям, где количество кислорода снижено по сравнению с низовьями на 40%. Ведь другой путь адаптации к гипоксии — увеличивать число самих эритроцитов — чреват осложнениями, так как при этом сильно возрастает риск тромбозов. Найдутся ли эти высокогорные аллели у других народов?
К тибетцам наиболее близки (и территориально, и исторически) китайцы. Поэтому ученые выделили участок ДНК с геном EPAS1 из 40 образцов тканей китайцев (хань) и сравнили с соответствующей выборкой 40 тибетцев. Разница между набором нуклеотидных замен китайцев и тибетцев оказалась огромной, нашелся и такой мотив, которого не было ни у одного (!) представителя китайцев из выборки. Это удивительный результат при такой внушительной выборке. Тогда ученые взяли данные по этому гену (точнее, по целому участку с этим геном, где собраны специфические нуклеотидные замены) из мировых баз по представителям разных рас (1000 Genomes Project и NCBI Sequence Read Archive). Тут улов был хоть и ненулевым, но ничтожным: из всех имеющихся последовательностей только в двух (представители северных и южных китайцев) обнаружился уникальный тибетский мотив. Ни у кого другого его не было. Хотя, нет — нашелся, и тут нужно бы поставить большой восклицательный знак. Геном с четкой тибетской росписью принадлежал не современному человеку, а знаменитому денисовцу, тому, от которого остался только мизинец. Таким образом, у современных тибетцев и древних денисовцев была общая адаптация к высокогорной гипоксии.

Ученые попытались понять, как так получилось, что денисовский вариант EPAS1 достался только тибетцам. Тут есть три возможности. Во-первых, это наследие общего предка денисовцев и сапиенсов, который у всех сапиенсов исчез по тем или иным причинам. Во-вторых, денисовцы скрещивались с общими предками китайцев и тибетцев, у китайцев после отделения от общего ствола этот ген практически исчез, оставив лишь реликтовый след. В-третьих, это случайный дрейф генов. Все эти возможности были смоделированы, были рассчитаны вероятности частот «тибетских» аллелей у различных современных народов, родственных и далеких тибетцам. Тут учитывались данные по денисовской примеси у других народностей и оценочное время их расхождения. Расчеты показали, что наибольшую вероятность имеет второй сценарий, согласно которому денисовцы скрещивались с предками хан и тибетцев и оставили смешанное потомство, в одной из ветвей которого в силу адаптивного преимущества остались аллели гена EPAS1 денисовцев. Напомню, что генетическое разнообразие денисовцев, как стало понятно не так давно, очень низкое. Вероятно, и полиморфизм гена EPAS1 был совсем невысок.

Таким образом, мы теперь определенно знаем, что денисовцы, жившие в Алтайских горах, скрещивались с жителями южно-азиатских нагорий. Позже потомки этих народностей, несущие варианты денисовских высокогорных аллелей EPAS1, разделились на китайцев и тибетцев. Первые в основном утеряли эти аллели за ненадобностью, вторые, напротив, сохранили как ценнейшее наследство. Впрочем, возможно, что у китайцев небольшая примесь тибетских аллелей была привнесена в исторические времена: все же две народности не отделены друг от друга совершенно. Так что датировки скрещивания денисовцев с предками тибетцев очень приблизительные, и, вероятнее всего, будут существенно уточнены. Предстоит еще немалая работа для подтверждения именно интрогрессии, а не параллельного конвергентного появления специфических мотивов. Вероятностный подход для доказательств, как становится понятно из последних исследований (см. Электрические органы у разных групп рыб регулируются сходными генами, «Элементы», 01.07.2014), может оказаться не совсем надежным.

Нам же этот случай интересен не оценками времени расхождения двух народов, а иллюстрацией эволюционных судеб отдельных генов. Нам интересно и важно видеть, как эволюционная сила работает с генетическим материалом и насколько адекватно она им распоряжается.

Источник: https://elementy.ru/novosti_nauki/432286/Tibettsy_unasledovali_ot_denisovskikh_lyudey_gen_spasayushchiy_ot_gipoksii
Со смертью грузинского тирана закончилась эпоха геноцида европейского сельского населения СССР
#история_РА

Как после смерти Сталина тут же с крестьян начали снимать непосильный налоговый гнёт. На примере Мордовии («Экономическая история», №2, 2012).

К 1953 году дошло до того, что крестьянин со своего личного хозяйства платил примерно 70% от выращенного на нём.
Неуплата налогов каралась строго. Вот официальные цифры по Мордовии за 1948 год: «осуждены к выселению – 602 чел., утверждено приговоров райисполкомами – 529, отправлены в места расселения – 651 чел., включая 166 членов семей «указников», предупреждены были о выселении – 644 чел.». (выселяли в самые жуткие места в Сибирь и на север).

И вот 1 июля 1953 года вышел указ о снижении налогов для крестьян. Два примера.
Расовая антропология
Со смертью грузинского тирана закончилась эпоха геноцида европейского сельского населения СССР #история_РА Как после смерти Сталина тут же с крестьян начали снимать непосильный налоговый гнёт. На примере Мордовии («Экономическая история», №2, 2012). К 1953…
«Так, колхозница А.Афанаскина из колхоза им. Ленина, Ковылкинского района, имеющая в хозяйстве корову, одну овцематку, поросенка и приусадебный земельный участок площадью 0,30 га, в 1952 г. уплатила сельскохозяйственный налог в размере 1721 руб., в 1953 г. – 817 руб., а в 1954 г. – только 270 руб. Сумма налога, уплачиваемого хозяйством колхозника И.Березкина, проживающего в Ичалковском районе МАССР, уменьшилась в 1954 г. по сравнению с 1953 г. в 4 раза, а по сравнению с 1952 г. – в 7 раз».

Резко выросла плата за трудодни. В последние годы жизни Сталина в Мордовии она была в среднем 50 копеек и 300 грамм соломы за трудодень, в 1955 году – 2 рубля и 2 кг соломы, 400 грамм зерна.
Последние годы жизни Сталина, особенно после 1947 года, были усилением советского гнета во всех сферах общества, но особенно сильно они прошлись по крестьянству, вогнав его в полную нищету. Тем более что деревня была обескровлена и погибшими в ВОВ мужчинами (домой не вернулось до 60-70% призванных, ещё 10-20% пришли инвалидами).

https://tttttt.me/tolk_tolk

Смерть Джугашвили и начало правления Хрущёва стало первым периодом в советской истории, когда закончился геноцид русского населения, начатый коммунистами с 1917 года.

«Превратить крестьянина в колхозного раба»
Как Сталин и советская власть уничтожили миллионы крестьян, а оставшихся превратили в рабов. Как сопротивлялась деревня, но была сломлена и уничтожена.
https://vk.com/@rasantro-prevratit-krestyanina-v-kolhoznogo-raba

Советское рабство в колхозах. Как при Сталине русские сельские жители работали за трудодни, за копейки, а кавказские и среднеазиатские колхозники получали в десятки большие зарплаты.
1950ый год " В Калужской области 1 трудодень — 9 копеек, у таджиков — 11 руб. 50 копеек"

При средней выработке 269 трудодней в году получают:
В Таджикистане 3144 рубля в год.
В Грузии 1350 рублей.
В РСФСР 161 рубль.
(В черноземных областях СССР и 45-50 рублей в год иногда выходит)
Средняя зарплата в СССР в 1950 г. - 650 рублей (это до хрущёвский реформы, надо делить 10 эту сумму, чтобы сравнить с 1960-80 гг).
https://vk.com/wall-47041459_350510
https://vk.com/wall-47041459_426935
http://istmat.org/files/uploads/36696/rgae_1562.33.187_32-43.pdf

При немецкой оккупации сверхсмертность нееврейского населения была в 1.5 раза ниже чем на территориях которые контролировались большевиками и были не затронуты войной.
https://vk.com/wall-47041459_309905
«Игра престолов» у японских макак
#социобиология_РА #разум_животных_РА

Макака по кличке Якэй совершила настоящий «переворот» и теперь возглавляет стаю из 677 обезьян в природном зоологическом саду Такасакияма (Япония). Анабазис Якэй удивил ученых и сотрудников зоологического сада, потому что она стала первой самкой-лидером отряда за 70-летнюю историю парка.
Как сообщает новостной портал Live Science, девятилетняя самка Якэй стала главной самкой в стае после нападения на собственную мать, а затем она, что обычно не свойственно японским макакам, решила возглавить всю стаю Якэй повергла четырех высокопоставленных самцов, и заняла положение лидера. Вообще враждебные действия со стороны агрессивных самок исключительно редки в обществе макак (macaca fuscata), так как состязания за статус происходят почти исключительно между самцами. Теперь новой «королеве» обезьян противостоит 18-летний самец по кличке Луффи. Зоологи с интересом следят за дальнейшим развитием событий в обществе японских макак. Если Якэй победит у исследователей появится уникальная возможность изучить, как живут японские макаки в состояние матриархата.

Источник: https://naked-science.ru/community/392756
Как Амазон построил мощную машину по борьбе против privacy
#левые_РА

Данные пользователей - фундамент развития самых важных продуктов Amazon в будущем. Без данных о покупках и интересу к товарам не сможет жить мощный рекламный бизнес компании, без биометрических данных с микрофонов умных колонок и камер - не выживет Alexa, виртуальный ассистент.

В среднем только Alexa собирает 70 записей в сутки, и туда же подтягиваются данные из Kindle (даже отметки в тексте), данные фитнес-трекеров, записи и имена из календарей, поиск на сайте. Но как быть, если недовольство пользователей и регуляторов растёт с каждым годом и угрожает потерей данных?
Расовая антропология
Как Амазон построил мощную машину по борьбе против privacy #левые_РА Данные пользователей - фундамент развития самых важных продуктов Amazon в будущем. Без данных о покупках и интересу к товарам не сможет жить мощный рекламный бизнес компании, без биометрических…
Безос начал действовать решительно в 2015 году. Он создал пиар-лоббистский блок и нанял легенду. Главой блока стал Джей Карни, экс-пиарщик Байдена и пресс-секретарь Обамы. Забавный факт - Карни был тем, кто в NY Times освещал в прямом эфире развал Советского Союза. Перед Джеем поставили чёткую цель - "Блокировать или уничтожать любые privacy-инициативы в США и Европе". Спустя 6 лет можно сказать, что Карни блестяще справился.

Функция была настолько важной для Amazon, что он подчинялся напрямую Безосу. Блок вырос с 20 человек до 250. На его счету - отмена или серьёзное изменение 36 законов в 25 штатах. Официально они работают с 180 лоббистами в 44 штатах. Карни действовал смело и решительно.

"Мы хотим, чтобы законодатели и журналисты боялись нас. Мы - сила, которая делает добро, создаёт рабочие места и развивает экономику. И нас должны уважать".

Из внутренних документов Amazon

Большинство битв были вокруг биометрии и ассистента Alexa. Главные вещи, которые им удалось убить в законах - это ограничение на постоянную запись в умных устройствах. Законодатели хотели принудить всегда спрашивать разрешение, но почти везде это сделать не удалось. Мол, это снизит удобство для пользователя. Другим доводом Amazon была помощь их устройств людям с ограниченными возможностями, которая начнёт работать заметно хуже.

Также Amazon удалось зарубить идею о том, что конкретный пользователь может подать на них в суд за свою приватность и её нарушение. Где не удавалось заблокировать закон целиком, Amazon добивался максимально расплывчатого определения терминов "сбор данных" и "privacy".

Стоит отдать должное - Карни действует красиво. Он построил целую data-driven систему работы с политиками. Её называли "Поливать наши цветочки". Политики были были внесены в базу, сегментированы по уровню влияния, посчитаны все взаимодействия, у каждого сотрудника была цель по количеству контактов. Разработали даже мобильное приложение, которое выдавали политику и тот видел на своём телефоне данные "вот сколько сотрудников Амазон работает в конкретно вашем выборном округе".

Теперь все эти усилия стали известны публике благодаря расследователям. Интересно, скажется ли это на поведении потребителя - я уверен, что да. Вообще, я постоянно пишу про усилия популистов в ограничении сбора данных, но стоит смотреть и на их могучих оппонентов. Уверен, в России крупные игроки из телекома или банкинга также работают с определениями в законах, чтобы оставить себе максимально удобные "дверцы" для сбора данных. На самом деле, у них просто нет выбора - настолько сбор данных важен для развития новых продуктов и экосистем.

Источник: https://pikabu.ru/story/myi_khotim_chtobyi_zakonodateli_i_zhurnalistyi_boyalis_nas_kak_amazon_postroil_moshchnuyu_mashinu_po_borbe_protiv_privacy_8678848
Женщина из австрийской Штирии оказалась на 300 лет старше древнего Этци

В 1909 году в пещере Йозефинен (Штирия, Австрия) нашли кости женщины. Вход в пещеру обнаружили случайно, во время расчистки завалов. Войдя в нее, люди увидели несколько костей человека и животных, а также черепки керамики, заметно выступающие из частично спеченного глиняного пола. В результате проведенных раскопок в пещере нашли череп бурого медведя, кости серны, лопатку коровы, костяное орудие, черепки керамики, а также множество человеческих костей (включая череп), принадлежащих одному и тому же человеку. Сейчас скелет хранится в Универсальном музее Йоханнема в Граце (Австрия).
Расовая антропология
Женщина из австрийской Штирии оказалась на 300 лет старше древнего Этци В 1909 году в пещере Йозефинен (Штирия, Австрия) нашли кости женщины. Вход в пещеру обнаружили случайно, во время расчистки завалов. Войдя в нее, люди увидели несколько костей человека…
Антрополог Сильвия Ренхарт (Silvia Renhart) и археолог Даниэль Модль (Daniel Modl) провели новое исследование костей «штирийской женщины». Об этом рассказывают в пресс-релизе музея. Ученые объединили данные, полученные с помощью метода радиоуглеродного датирования и методов физической антропологии, и не только узнали возраст женщины на момент смерти, но и существенно уточнили время, когда она жила.

Они определили уровень концентрации пентозидина в дентине зуба. «С помощью этой методики, которая была использована в проекте с немецкими исследователями Стефани Ритц-Тимме и Ниной Софи Малке из Института судебной медицины Дюссельдорфского университета на исторических образцах костей и в судебной экспертизе недавних находок трупов, возраст на момент смерти может быть определен точно в 52,8 года», — рассказывается в релизе. Для того времени, когда она жила, это вполне солидный возраст.

Кроме того, реконструкция мягких тканей позволила увидеть лицо женщины и ее фигуру. Она была невысокой, крепкой и сильной. Возрастные изменения костей указывают на хорошо развитую мускулатуру и высокую выносливость. Следы крепления мышц на верхней части тела, особенно на черепе и костях плеча и надплечья, говорят о том, что у дамы были хорошо натренированы мышцы шеи — видимо, в результате переноса тяжестей. Это относится и к костям голени, что тоже свидетельствует о больших нагрузках на организм и преодолении больших расстояний в течение жизни.

Помимо этого, анализ костей показал многочисленные свидетельства частых периодов недоедания из-за голода или сезонной нехватки пищи с почти постоянным недостатком витамина С, минералов и белка, что привело к ослаблению организма. Это, в свою очередь, стало причиной высокой восприимчивости к инфекционным заболеваниям и цинге.

Кроме определения физических характеристик «штирийской женщины», а также ее возраста на момент смерти, ученые провели дополнительное исследование по радиоуглеродному методу. И здесь их ждал настоящий сюрприз. Оказалось, женщина жила во времена неолита, в промежутке между 3630 и 3380 годами до нашей эры, — то есть была старше знаменитого Этци: если верна первая дата (3630 год до нашей эры), то на целых 300 лет.

Напомним, в 1991 году пара немецких туристов случайно нашла в Эцтальских Альпах в Тироле мумию, вмороженную в лед. По не вполне ясным причинам итальянские власти не отреагировали на сообщение о находке, и тогда извлечением мумии изо льда и ее дальнейшим исследованием занялись специалисты из Инсбрукского университета (Австрия).

Им удалось установить, что Этци (как назвали мумию) — останки мужчины, погибшего в возрасте около 45 лет. Причем родился и жил он, скорее всего, не в горах, а в долине, к югу от главного хребта Альпийских гор. Причины смерти до конца не ясны: выдвигались самые разные гипотезы — от замерзания в горах до гибели от ран после тяжелого боя и попытки эвакуации тела товарища. В 2011 году ученые расшифровали геном Этци и выяснили, где жили его предки: по линии отца — на Тирренском побережье и Сардинии, по линии матери — местные, с Тирольских Альп.

Мумия Этци считается самой древней в Европе. Когда эта информация появилась в прессе, итальянские власти уточнили место находки и объявили, что Этци нашли по их сторону границы. Они потребовали от Австрии вернуть мумию в Италию — правда, разрешили ученым закончить исследования. Сейчас останки Этци находятся в Археологическом музее Южного Тироля в Италии

Источник: https://naked-science.ru/article/anthropology/steiermark-otzi
Дискуссия о происхождении индоевропейских языков из миграции ямной культуры на запад

Достижения и сложности. В двух работах, опубликованных в «Nature» (Haak et al. 2015; Allentoft et al. 2015), исследователи проанализировали древнюю ДНК из археологических памятников и пришли к выводу о мощной миграции на переходе от неолита к бронзовому веку. Они предположили, что эта миграция привела индоевропейские языки из степей в остальную Европу. Степная ямная (Pit-Grave) культура была определена как ареал протоиндоевропейского языка, а производные от него языки (греческий, германские, славянские, кельтские и др.), как связанные с культурами шнуровой керамики. Этот вывод совпадает со степной («курганной») гипотезой о происхождении индоевропейцев. Однако в науке существует ряд конкурирующих гипотез.

Ученые, предлагающие предковый статус ямной культуры, чувствуют это сомнение и часто оговаривают свои выводы: возможно, это не все индоевропейские языки происходят из ямной культуры, а только некоторые из них.
Расовая антропология
Дискуссия о происхождении индоевропейских языков из миграции ямной культуры на запад Достижения и сложности. В двух работах, опубликованных в «Nature» (Haak et al. 2015; Allentoft et al. 2015), исследователи проанализировали древнюю ДНК из археологических…
Однако если некоторые из них, то тогда это не протоиндоевропейская колыбель, а лишь очаг одной из дочерних языковых семей. И тогда степная гипотеза происхождения индоевропейцев подменяется гипотезой о происхождении одной из таких семей, скажем, индоиранской. Это вполне реалистично, но было бы странно предполагать ее распространение на северную Европу! А уж индоиранский не проявляется в большинстве европейских языков.

Вместе со многими другими археологами я сомневаюсь, что обсуждаемые открытия отражают миграцию из ямной к культурам шнуровой керамики.

Я не раз копал степные курганы с погребениями ямной культуры (однажды даже показывал их Туру Хейердалу, посетившему мою экспедицию). Я хорошо представляю эти погребения – обычно основные в курганах или впущенные позже, с мощными костяками, лежащими на спине, с поднятыми коленями, густо посыпанные охрой. Мужчины и женщины похоронены одинаково. Керамика лепная круглодонная – небольшие яйцевидные сосудики, иногда со шнуровым орнаментом. В погребениях часто присутствуют роговые молоточковидные булавки и редко каменные топоры-молоты, также медные копьевидные ножи и шилья. Культура эта широко распространена по степям, в западной части ареала она – смешанная: сохраняя свой способ погребения, сочетает его с совершенно другой, местной керамикой.

Я также много занимался и культурами шнуровой керамики и боевого топора, поскольку выводил из них Донецкую катакомбную культуру, более позднюю, чем ямная. Это культуры, заметно отличающиеся от ямной. Часть их – бескурганные, погребенные лежат в иных позах, мужчины иначе, чем женщины, керамика совершенно иная, основные типы – амфоры и кубки, вооружение – каменные боевые топоры-молоты. Культуры эти распространены по лесным и лесостепным пространствам Европы, в степь не заходят.

Я сомневаюсь, что люди ямной культуры говорили на протоиндоевропейском языке. Здесь я обсуждаю эту проблему, опираясь на последние археологические данные, и предлагаю искать решение спора, используя как генетические, так и археологические данные.

Распад индоевропейского протоязыка. На основании глоттохронологии и кладистики все признанные датировки распада протоиндоевропейского языка помещаются в пределах 7 – 5 тыс. до н. э.: медианная дата по Грэю и Эткинсону – 6700 BC, Букерту – 5500, Сводешу – ранее 5000, Дыбо и Касьян (по Старостину с модификацией) – 5000, по Старостину – 4670, по Чангу и др. — 4500 (Gray and Atkinson 2003; Boukaert et al. 2012/2013; Swadesh 1955; Kushniarevich A. et al. 2015; Starostin 2007; Chang et al. 2015). [Даже если мы расширим диапазоны добавкой доверительных интервалов, это не омолодит даты существенно – на тысячелетия.]
Исчезновение ямной культуры. Ямная культура ныне хорошо датирована по калиброванной радиоуглеродной хронологии (Николова 2012; Черных и Орловская 2004a). Она начинается (!) от силы ок. 30-го века до н.э., а большинство ее дат падает на вторую треть III тыс до н. э. В согласии с этим В. Хейд (Heyd 2011) датирует ямную на западе (Венгрия и т. п.) первой половиной III тыс.
Вдобавок нужно принять во внимание, что производные культуры (с производными языками) могли отколоться от материнской не раньше этого времени, а скорее много позже. Более того, нужно соотнести распад искомого протоязыка не с началом некой культуры (допустим, ямной), а с ее распадом, с концом ее существования, ее заменой новыми культурами, сформировавшимися на базе ямной – с теми, которыми могли быть производными от нее. В этой ситуации можно назвать полтавкинскую культуру, катакомбные культуры.

Полтавкинская культура начинается ок. 2600 г. до н. э. (Моргунова 2013), катакомбные культуры – также ок. 2600 г., но если мы расширим доверительный интервал до двух сигм то рубеж попадет на ок. 2900 (Черных и Орловская 2004b). Это очень далеко даже от ближайшей даты распада языка – 4500.
Расовая антропология
Дискуссия о происхождении индоевропейских языков из миграции ямной культуры на запад Достижения и сложности. В двух работах, опубликованных в «Nature» (Haak et al. 2015; Allentoft et al. 2015), исследователи проанализировали древнюю ДНК из археологических…
Таким образом, разрыв между распадом языка и разделением культуры (рис. 1) достигает около 2,5 тысячелетий (и минимум 1,6 тысячелетий). Нужно добавить, что распад языка должен следовать не непосредственно за разделением общества. Так что лакуна должна быть еще шире.

Вывод ясен. Язык, на котором говорило население ямной культуры, не может быть протоиндоевропейским: провал во времени между распадом протоиндоевропейского языка и распадом ямной культуры слишком велик.

Начало культур шнуровой керамики. Идея миграции из степей в остальную Европу подразумевает, что одна из схожих культур должна быть существенно раньше другой. Генетики, о которых речь, и прежде всего археологи их команды подразумевают, что ямная культура существенно раньше, чем культуры шнуровой керамики, распространенные в Центральной, Северной и Восточной Европе (включая европейскую Россию). Так ситуация мыслилась в ХХ веке (активистами степной гипотезы происхождения индоевропейцев Гимбутас, Мэллори, Энтони и др.). Ныне мы имеем уйму радиоуглеродных дат, которые изменили это представление. Я уже приводил даты ямной культуры. Обратимся к датам культур шнуровой керамики. Все они начинаются с началом III тыс. – с ок. 3000 г. до н. э. (Stöckli 2001; Furholt 2003a; 2003b). Они практически одновременны с ямной культурой.

Начало ямной культуры: новые идеи. В последние десятилетия появились предложения углубить начало ямной культуры (Иванова 2006; Моргунова 2013; и др.). Иванова (2004), специализировавшаяся по ямной культуре, принимает эти инновации, но она заметила важную вещь: основной корпус ямной культуры (на Украине) не имеет столь ранних дат, тогда как они сосредоточены на обоих концах ямного ареала – на самом западе и на самом востоке. Но происхождение культуры не может распространяться от концов к середине! Какая-то из двух ранних датировок должна оказаться ложной, а если ложна одна, то и вторая сомнительна.

Источник на Севере? Я уже обращал внимание пропонентов идеи степного происхождения культур шнуровой керамики (Клейн 2015a, 2015b, 2015c) на то, как странно распределен «степной» генетический вклад у шнуровиков и их преемников (см. Haak et al. 2015): очень богатый на Севере Европы и всё более и более слабый по мере приближения к Югу, к Венгрии, где как раз расположен западный край ямного ареала. Это распределение представляется странным, если предполагать, что источник вклада в геном шнуровиков – ямная культура на юго-востоке, но это самое распределение оказывается естественным, если предположить, что общий источник генетических сходств расположен не вблизи ямной культуры, а на Севере Европы (рис. 2). Карта показывает, что «ямный» генетический компонент – вряд ли ямный по происхождению; скорее это более древний компонент, возникший у населения Северной Европы, откуда он распространился как в степи, так и в культуры Центральной Европы и в другие места.

Известный украинский археолог Л. Л. Зализняк предложил (2005) передвинуть время протоиндоевропейского языка к позднему мезолиту – раннему неолиту (6-е – 5-е тысячелетия до н. э.), чтобы оно лучше соответствовало упомянутым глоттохронологическим датам. На археологических и физико-антропологических основаниях он реконструирует сдвиг населения Ютландии и Юго-Восточной Балтики эпохи Маглемозе и пост-Маглемозе (Эртебёлле-Эллербек) в бассейны Днепра и Донца [(рис. 3)]. Вследствие этого сдвига большие территории (от Балтики до Днепра) были заселены людьми со схожими археологическими, физико-антропологическими и вероятно генетическими характеристиками – по Зализняку, это и есть колыбель индоевропейских народов.

Мои заметки не имеют намерения преуменьшить блестящие достижения генетиков. Я лишь пытаюсь откорректировать возможные огрехи в их интерпретации.

Источник: http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=28008&cpage=1#comment-26369
Геногеографический атлас ДНК-маркеров, контролирующих цвет глаз и волос человека. Часть 1
#генетика_РА

Исследователи, ранее разработавшие панель из 31 SNP маркера для предсказания цвета глаз и волос по ДНК в населении Северной Евразии, изучили распространение этих генетических вариантов в популяциях России и сопредельных стран. Для этого генотипировали 1152 образца из 22 популяций. На основе полученных аллельных частот создали картографический атлас, который включил карты распространения 62 аллелей, а также карты чувствительности предикции фенотипа по генотипу. Картографический и статистический анализы выявили три основные закономерности генетического ландшафта маркеров пигментации. Во-первых, основным паттерном большинства карт является градиент изменений частот в направлении “восток–запад”. В большинстве случаев к западу нарастает частота аллеля, определяющего светлую пигментацию глаз и волос (но есть и исключения).
Расовая антропология
Геногеографический атлас ДНК-маркеров, контролирующих цвет глаз и волос человека. Часть 1 #генетика_РА Исследователи, ранее разработавшие панель из 31 SNP маркера для предсказания цвета глаз и волос по ДНК в населении Северной Евразии, изучили распространение…
Во-вторых, отсутствует связь между величиной генетического вклада ДНК-маркера в пигментацию и его межпопуляционной изменчивостью. В-третьих, обнаружено генетическое своеобразие популяций Кавказа и Урала, у которых частоты генетических маркеров пигментации несводимы ни к “западному”, ни к “восточному” типу. Карты чувствительности предикции пигментации выявили также своеобразие русских популяций.

Степень пигментации, определяющая цвет глаз и волос человека, находится под контролем многих генов. Основные аллели хорошо известны, но все время добавляются новые, также вносящие вклад в эти фенотипические признаки. Они появляются за счет накопления больших выборок, а также за счет изучения разнообразия человечества по генетике пигментации. Так, показано, что наборы аллелей, ассоциированных с цветом глаз, в популяциях Европы, Южной и Восточной Азии могут различаться. С цветом кожи дело обстоит еще сложнее – разнообразие вовлеченных в него аллелей велико даже в Африке южнее Сахары.

Информация о генетических вариантах, ассоциированных с пигментацией, дает возможность предсказывать внешность человека по его ДНК – она крайне важна для ДНК-идентификации, прежде всего, для целей криминалистики. С этой целью были созданы три панели ДНК-маркеров: IrisPlex (для цвета глаз), HIris-Plex (для цвета глаз и волос) и HIrisPlex-S (для цвета глаз, волос и кожи). Но есть проблема – эти панели были разработаны преимущественно на образцах из голландской популяции, и неизвестно, насколько они информативны для населения других регионов мира. Для населения России эта проблема особенно актуальна, так как генофонды разных коренных народов России генетически значительно отличаются не только от населения Западной Европы, но и друг от друга. Для повышения точности определения пигментации по генотипу необходимо исследовать связь ДНК-маркеров и признаков внешности в разных популяциях населения России и сопредельных стран.

Коллективом лаборатории геномной географии Института общей генетики РАН и лаборатории популяционной генетики человека Медико-генетического научного центра под руководством профессора РАН О.П.Балановского и профессора Е.В.Балановской была проведена проверка работы системы HIrisPlex на популяциях России и сделан вывод, что точность ее удовлетворительна, хотя и несколько снижена (по признакам цвета глаз и волос она составляет 0,9 для Западной Европы и 0,8 для России). Особенное расхождение наблюдается для оценки цвета глаз в популяциях Сибири. Специалисты провели полноэкзомное секвенирование (включающее интроны генов) для трехсот образцов представителей разных популяций России и сопредельных стран, для которых они также определили фенотипы пигментации. По его результатам сформировали панель из 31 ДНК-маркеров, из которых 18 ранее не связывали с признаками пигментации, они оказались эффективными именно для населения России.

В работе того же коллектива, результаты которой опубликованы в журнале «Генетика», была поставлена задача изучить распространение этих ДНК-маркеров, вошедших в российскую панель, в популяциях Северной Евразии и создать картографический атлас генетического контроля пигментации в коренном населении России и сопредельных стран.

Атлас генетического контроля пигментации построен на основе ДНК-профилей 1152 образцов из множества популяций, охватывающих основное генетическое разнообразие коренного населения России и сопредельных стран. Эти образцы получены из Биобанка Северной Евразии, они были собраны по строгим критериям, принятым в популяционной генетике.

Для целей данного исследования авторы выделили 22 метапопуляции, охватывающие основное генетическое разнообразие населения Северной Евразии (Камчатка, Амур, Тунгусы, Южная Сибирь, Алтае-Саяны, Монголия, Угры, Кахахстан, Таджикистан, Западный Кавказ, Восточный Кавказ, Закавказье, Русский Север, Русские (центральные), Зарубежная Европа, Западные финно-угры, Восточные славяне, Мордовия, Тюрки Приуралья, Марий Эл, Пермь, Южный Урал). Из коллекций биобанка отбирались образцы, относящиеся к каждой метапопуляции, чтобы каждая выборка составила около 50 образцов.
Расовая антропология
Геногеографический атлас ДНК-маркеров, контролирующих цвет глаз и волос человека. Часть 1 #генетика_РА Исследователи, ранее разработавшие панель из 31 SNP маркера для предсказания цвета глаз и волос по ДНК в населении Северной Евразии, изучили распространение…
Для охвата наибольшего разнообразия в метапопуляцию включали образцы не одной, а нескольких этнических или субъэтнических групп. Предпочтение отдавалось образцам, для которых в биобанке имелись не только биологические образцы, но и антропологические фотографии для определения фенотипа.

Генотипирование проводили на платформе iScan (Illumina). Из 31 ДНК-маркера, используемого в отечественной панели, 15 маркеров наиболее важны, а 16 имеют меньший вес при расчете вероятности того или иного фенотипа. 13 маркеров из 31 присутствуют в зарубежных криминалистических панелях. Половина из этих маркеров связывалась в зарубежных панелях только с генетическим контролем цвета кожи, однако показан их вклад в генетический контроль цвета глаз и волос в популяциях Северной Евразии. На основании полученных генотипов были рассчитаны частоты встречаемости каждого маркера в каждой метапопуляции. Для каждого аллеля авторы вычислили его генетический вклад в пигментацию глаз (CE), волос (СH) и рыжины волос (CR), а также суммарный вклад (C) во все три признака.

Всю основную работу по биоинформатическому анализу генетического контроля признаков пигментации в населении России выполнял И.О. Горин. Программное обеспечение по геногеографическому анализу создано в сотрудничестве с професссиональным картографом С.М. Кошелем.

В атлас вошли 62 карты распространения частот 62 аллелей 31 ДНК-маркеров, используемых для предикции цвета глаз и волос. Семь ДНК-маркеров, о которых пойдет речь ниже, вносят высокий вклад в генетический контроль пигментации.

Из них наибольший вклад вносят два ДНК-маркера, оба относящиеся к гену HERC2, оба включены в криминалистическую панель HIrisPlex-S, оба отвечают за светлый цвет глаз и волос (рис. 1,а, б). При этом HERC2_rs1129038_T действует в три раза сильнее, чем HERC2_rs12913832_G. Вместе с тем, карты их распространения практически неотличимы. Минимальные частоты (1 ≤ q ≤ 6%) охватывают коренное население Дальнего Востока, Монголии и Южной Сибири. В Алтае-Саянах, в Казахстане и Таджикистане они несколько выше (13 ≤ q ≤ 17%). Еще выше частоты “осветления” на Кавказе, в Закавказье и в степях Южного Урала (27 ≤ q ≤ 38%). С частотой выше средней они обнаружены у обских угров (q = 46%) и славяноязычных македонцев Южной Европы (q = 49%). Еще выше их частота у чувашей, марийцев и коми-пермяков (62 ≤ q ≤ 74%). Максимальные значения охватывают ареал от Мордовии (q = 78%) до западных финноязычных популяций карел и ижоры (q = 93%). Популяции всех восточных славян занимают промежуточное положение (79 ≤ q ≤ 85%) между западными и приуральскими финно-уграми. Третий ДНК-маркер этого гена – HERC2_rs12916300_T – обладает только вкладом в формирование светлых глаз, но не в цвет волос. Однако карта его распространения неотличима от двух предыдущих.

Четвертый ДНК-маркер гена HERC2, HERC2_rs2238289_A (рис. 2a) вносит несколько меньший вклад в пигментацию, хотя он входит в панель HIrusPlex, и отвечает только за осветление волос. Размах изменчивости его частоты вдвое ниже (56 ≤q ≤100%) и в пять раз меньше межпопуляционное разнообразие. Его карта окрашена в красноватые цвета высоких частот, указывающие на повсеместное распространение. В целом сохраняется общий для всех маркеров, связанных со светлой пигментацией, градиент увеличения частоты с востока на запад. ДНК-маркер SLC45A2_rs35407_G (рис. 2 b) оказывает влияние на все три признака пигментации: и на осветление волос, и на осветление глаз, и даже небольшое влияние на рыжину волос. Его карта распространения похожа на карты маркеров гена HERC2, но есть и отличия в особенностях перехода от низких значений частоты к высоким.

Следующие два маркера отличаются низкой изменчивостью. ДНК-маркер TP63_rs6804480_T (рис. 3,а) оказывает влияние и на осветление волос , и на осветление глаз. Его межпопуляционная изменчивость GST ниже почти в десять раз по сравнению с маркерами гена HERC2, что отражено в сглаженном генетическом рельефе. Обращает на себя внимание, что коми-пермяки входят в кластер популяций с высокими частотами, превосходя по частоте и русские популяции, и мордовские.