И The New Reddit Journal of Science замечательный.

Взгляд на биосенсоры от The Verge.
Сенсор из бактерий для определения кровотечений в желудке или кишечнике? Check.
Биодеградируемый имплант для измерения биомеханических показателей ткани после операции? Check.
Наклейка на зуб, анализирующая слюну? Check.

What a wonderful time to live in!
#bionics

В Помпеях в этом сезоне было сделано уже несколько интересных открытий — в частности, останки хромого человека, который не успел уйти из гибнущего города, и взнузданную лошадь. Подробно о находках рассказывает журналистка Юлия Штутина

https://meduza.io/feature/2018/06/02/v-pompeyah-snova-nachalis-raskopki-tam-nashli-ostanki-cheloveka-hromogo-i-s-dengami-loshad-dom-i-dazhe-ulitsu?utm_source=telegram&utm_medium=live&utm_campaign=live

Spencer: How long do you have?
Thirteen: Maybe a little more than you. Maybe a little less. I'll race you.

Тринадцатая — персонаж популярного сериала «Доктор Хаус». У Реми Хедли (много ли поклонников сериала помнят полное имя Тринадцатой?) диагностируют заболевание, унесшее жизни её матери и брата, — хорею Гентингтона. И хотя с момента выхода последней серии House M.D. прошло уже шесть лет, как справляться с болезнью Гентингтона, всё ещё не ясно.

Болезнь Гентингтона имеет определённую генетическую причину. Если в гене HTT, кодирующем белок гентингтин, мутаций в виде повтора CAG, кодирующего глутамин, слишком много (>35 повторов), некоторые типы нейронов умирают быстрее, чем в норме. Гантингтин выполняет различные функции, включая участие в транскрипции, клеточных взаимодействиях, внутриклеточном транспорте, синаптической передаче и контроле клеточной смерти, — неудивительно, что молекулярные основы заболевания остаются загадкой.

... Newnham concluded that he needed to know his status with respect to Huntington’s disease. “We didn’t want to have a child without that certainty,” he says. The result was not what he had hoped for. Like his father, he carries the mutated gene.

Один из потенциальных способов лечения болезни Гентингтона основан на использовании антисмысловых олигонуклеотидов (АСО). В клинических испытаниях синтезированную цепь из 15 – 25 нуклеотидов вводят пациентам в цереброспинальную жидкость. Лекарство затем проникает в головной мозг и уменьшает содержание белка гентингтина в нейронах, не вызывая при этом побочных эффектов. Третью фазу клинических испытаний Roche начнёт проводить уже в этом году.

Дизайн АСО нетривиален: последовательность нуклеотидов для синтеза задаётся такой, чтобы она была комлементарна мРНК нужного гена. Связываясь с мишенью, АСО подавляют трансляцию и способствуют деградации мРНК. Чтобы использовать АСО как лекарство, связывание с мишенью должно быть специфичным, а сами олигонуклеотиды должны избежать деградации нуклеазами. Поэтому лекарства на основе АСО представляют собой не просто цепочку нуклеотидов, но цепочку модифицированных нуклеотидов. В случае болезни Гентингтона нужно подавить экспрессию копии гена с большим количеством повторов CAG, что усложняет задачу. Одно из возможных решений — использовать различия между копиями гена: если во вредной копии гена есть хотя бы один полиморфизм (SNP), можно синтезировать олигонуклеотид, который будет связываться именно с ней. В 30% случаев, однако, такого полиморфизма у пациентов найти не удаётся. На этом трудности использования АСО не заканчиваются: так, нужно регулярно, возможно, на протяжении десятилетий, доставлять АСО в цереброспинальную жидкость...

Конечно же, для лечения хореи тестируют и CRISPR/Cas9, точнее KamiCas9 — с инактивацией через короткое время. (И здесь есть свои проблемы.)


- Nature Outlook: Huntington’s disease
- How the gene behind Huntington’s disease could be neutralized
- CRISPR takes on Huntington’s disease
- Improved metrics for Huntington’s disease trials
- Living under the shadow of Huntington’s disease
- When Huntington’s disease comes early

Напоминание, что у The New York Times приятные заметки: https://www.nytimes.com/2018/06/11/health/men-y-chromosome.html

Вышел мой текст на @knifemedia о том, как гены могут определять исход лекарственной терапии. Это такой небольшой занимательный дайджест из истории фармакогенетики: как в 50-ых всё начиналось с введения в клиническую практику миорелаксанта суксаметония и у некоторых людей он вызывал паралич дыхательных мышц на несколько часов, что было чревато смертельным исходом; а ещё история про препарат дебризохин и последующее открытие роли ферментов-цитохромов в метаболизме лекарственных средств.

Пожалуй, ярче всего суть фармакогенетики раскрывается на примере историй про неконтролируемый приём психоактивных веществ. Поэтому за основу текста взята история парня Курта, которому в 96-ом году был назначен новый и очень популярный в то время антидепрессант прозак (он же флуоксетин). На фоне приёма прозака Курт без каких-либо мотивов расстрелял отца и был осуждён на 60 лет строго режима. Но на этом дело не получило своей финальной точки и в свете новых клинических исследований и фармакогенетических открытий в нулевых лишь приобрело большую этическую сложность и неоднозначность.

https://knife.media/dark-alleles/

Изумительно прекрасное уже сегодня: John Oliver рассказывает о том, что CRISPR значит для человечества и какие проблемы может нести.
https://www.youtube.com/watch?v=AJm8PeWkiEU
Конечно же, больше упора на социальный аспект и этику, чем на биологию, но качество сторителлинга и адекватность на высоте.

В верном направлении движемся: препринты теперь индексируются в Europe PMC.
http://blog.europepmc.org/2018/07/preprints.html

Тут в Nature пишут интересное: ⚡️Осталось всего ~10 лет, чтобы найти какую-то замену литий-ионным аккумуляторам перед началом заметного кризиса в этой индустрии, так как редкие ресурсы вроде кобальта и никеля которые в них используются — ограничены и исчезнут в 2030+ году.

За последние несколько десятков лет, литий-ионные батареи стали в 3 раза вместимее и в 30 раз дешевле — несмотря на это, темпы развития технологии замедляются, поскольку приблизились к фундаментальным ограничениям — к законам физики. Количество заряда, который может храниться в кристаллических структурах электродных материалов, приближается к теоретическому максимуму.

И это при том, что с каждым годом спрос на аккумуляторы растет, так как устройств которые их используют с каждым годом становится всё больше.

Хуже того, материалы, используемые в аккумуляторах — редкие металлы, такие как кобальт и никель, становятся все дороже и реже. За последние два года производство аккумуляторных батарей увеличилось почти в четыре раза, что сказалось на цене за килограмм кобальта — за те же два года цена выросла с 22$ до 81$, никель хоть и дешевле — но с 2015 года тоже подорожал с 9$ долларов до 14$.

Как утверждают авторы статьи на Nature, необходимо срочно разработать альтернативные типы электродов на основе дешевых, обычных металлов, таких как железо и медь, а так же повысить приоритет таким исследованиям.

Статья читается легко, но оставляет легкий привкус паники — так как срочно нужно что-то делать и хоть и есть уже какие-то примеры аккумуляторов где используются обычное железо и медь, пока они уступают технологии на кобальте и стоят в 2 раза дороже, поэтому исследователи просят государства и компании-производителей электрокаров спонсировать разработку нового вида аккумуляторов.

Мое обывательское мнение такое, что аккумуляторы нового типа, это буквально то, что дало бы новый качественный скачок технологическому прогрессу, они ведь сейчас повсюду и все что нужно пользователю, постоянный рост емкости.

https://www.nature.com/articles/d41586-018-05752-3

В продолжение истории.
https://www.theverge.com/2018/8/15/17685634/germany-car-industry-battery-cells

Иллюстрация из исследования чешских зоологов, которые решили проверить, будут ли синички больше бояться ястреба-перепелятника, если поменять ему расположение головы относительно туловища и хвоста 🤷‍♀️

Оказалось, что нет: присутствие вблизи кормушки чучела ястреба отпугивало синичек в равной мере независимо от того, где находилась голова. А вот чучело голубя совершенно синичек не страшило 🐦
Статья: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0376635717303017

Больше геномов:
https://www.sanger.ac.uk/news/view/newly-sequenced-golden-eagle-genome-will-help-its-conservation

мегагранты вышли на плато, на картинке примерное число публикаций в год (WoS)

причем самая цитируемая работа вовсе не у 5-100, а у подзабытого АУСПб. Какая-то прога\алгоритм от команды Певзнера. 2176 ссылок, но это по WoS. по пабмеду уже 4000+ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22506599

Северные олуши (Morus bassanus) охотятся на флегматичную рыбу.

Фото: R.Shucksmith, победитель конкурса Bird Photographer of the Year 2018 в категории «Поведение птиц»

Meta стала доступна!
Если вы делаете рисёч или просто следите за статьями, то это может стать полезным инструментом, чтобы находить публикации и делиться ими.

https://beta.meta.org/account/sign-up

Видео о том, чем занимаются разработчики в ведущем европейском исследовательском центре по вычислительной биологии.
https://youtu.be/gXDLvQgF8Hw

В Японии явно легализовали вмешательство в гены эмбриона на начальной стадии развития. Раньше у них вообще не было про это регуляции, теперь явно разрешили, правда пока только для экспериментов - о выращивании генно-модифицироанных людей речи не идёт.

Такими темпами киберпанк, как и предсказывали классики, начнется именно в Японии. https://www.nature.com/articles/d41586-018-06847-7