В Nature празднуют 250-летие со дня рождения Жан-Батиста Жозефа Фурье, который родился 21 марта 1768 в городке Осер (Auxerre).
Writing to a friend 229 years ago, he lamented his lack of achievement up to that point: “Yesterday was my 21st birthday; at that age Newton and Pascal had already acquired many claims to immortality.”
Nature
Fourier’s transformational thinking
The mathematics of Joseph Fourier, born 250 years ago this week, shows the value of intellectual boldness.
и тебя отсеквенируем
Все дороги ведут в … … иммунологию. Специальный выпуск Science на этой неделе посвящён иммунотерапии рака. Идея мобилизовать иммунную систему для борьбы с раком не нова, но сейчас, похоже, мы накопили достаточно знаний и опыта для того, чтобы активно применять…
Конечно же, всё сложнее и интереснее: где иммунотерапия, там и опасность аутоиммунных реакций. Про аутоиммунность как ахиллесову пяту иммунотерапии рака подробно расписано, например, вот в этой заметке в Nature.
Nature
Is autoimmunity the Achilles' heel of cancer immunotherapy?
Nature Medicine - In this Perspective, June, Bluestone and Warshauer discuss potential cellular and molecular explanations for the autoimmunity often associated with immunotherapy, and propose...
и тебя отсеквенируем
Конечно же, всё сложнее и интереснее: где иммунотерапия, там и опасность аутоиммунных реакций. Про аутоиммунность как ахиллесову пяту иммунотерапии рака подробно расписано, например, вот в этой заметке в Nature.
… а апдейт про успехи в лечении аутоиммунных заболеваний — вот тут.
Nature
The battle to tame autoimmunity
A more tolerant immune system could alleviate, or even prevent, autoimmune disorders such as type 1 diabetes and multiple sclerosis, as well as the rejection of transplanted organs.
- Что делаешь?
- Читаю.
- А что ты читаешь?..
- Мураками.
https://www.nature.com/articles/s41593-018-0109-1
- Читаю.
- А что ты читаешь?..
- Мураками.
https://www.nature.com/articles/s41593-018-0109-1
Nature
A three-dimensional single-cell-resolution whole-brain atlas using CUBIC-X expansion microscopy and tissue clearing
Nature Neuroscience - The authors developed a CUBIC tissue clearing and expansion method to generate an editable, point-based single-cell-resolution brain atlas. This atlas, termed CUBIC-Atlas, can...
Forwarded from Data Science by ODS.ai 🦜
Chemical synthesis with MCTS, neural nets and symbolic AI.
An AI system finds correct sequence of steps to synthesize complex organic molecules -- a task much more complex than the game of Go. 95% success in 13 seconds on ordinary hardware.
https://www.nature.com/articles/nature25978.epdf
https://arxiv.org/abs/1708.04202
An AI system finds correct sequence of steps to synthesize complex organic molecules -- a task much more complex than the game of Go. 95% success in 13 seconds on ordinary hardware.
https://www.nature.com/articles/nature25978.epdf
https://arxiv.org/abs/1708.04202
Nature
Planning chemical syntheses with deep neural networks and symbolic AI
Deep neural networks and Monte Carlo tree search can plan chemical syntheses by training models on a huge database of published reactions; their predicted synthetic routes cannot be distinguished from those a human chemist would design.
Когда жгут не книги, а статьи, но это во благо...
Полезное чтиво, хотя оно и не затрагивает всех сложностей нового формата публикаций, каким бы он ни был.
https://www.theatlantic.com/science/archive/2018/04/the-scientific-paper-is-obsolete/556676/
UPD. Обсуждение на HackerNews: https://news.ycombinator.com/item?id=16764321.
Полезное чтиво, хотя оно и не затрагивает всех сложностей нового формата публикаций, каким бы он ни был.
https://www.theatlantic.com/science/archive/2018/04/the-scientific-paper-is-obsolete/556676/
UPD. Обсуждение на HackerNews: https://news.ycombinator.com/item?id=16764321.
The Atlantic
The Scientific Paper Is Obsolete
Here's what's next.
и тебя отсеквенируем
Вот в 2013 году The Verge писали о стартапе Transcriptic, которые пытаются реализовать некоторые протоколы, вроде ELISA и qPCR, в виде облачного сервиса — с использованием роботов, конечно же. Интересно, насколько эта область продвинулась за пять лет?..
Ага!
Darpa Awards Ginkgo Bioworks and Transcriptic $9.5M to Bring AI into the Lab
https://synbiobeta.com/darpa-awards-ginkgo-bioworks-and-transcriptic/
Darpa Awards Ginkgo Bioworks and Transcriptic $9.5M to Bring AI into the Lab
https://synbiobeta.com/darpa-awards-ginkgo-bioworks-and-transcriptic/
Так выглядит один маленький кусочек будущего науки: https://twitter.com/DrySci/status/986042017787662336 (микроскоп с дополненной реальностью, размечающий образец в реальном времени).
Twitter
Jonathan Dry
Amazing stuff from @GoogleAI at #AACR2018 - new microscope augmenting reality for pathologists by real-time labeling tumor images while you look at them.... I had a go - it's real !!
Forwarded from Медтех
#oncotech #pathology #ai #google
Сегодня новость по моей любимой теме — AI в онкологии. На ежегодной конференции AACR (American Association for Cancer Research) команда Google AI представила 🔬 с дополненной реальностью для патологов.
https://research.googleblog.com/2018/04/an-augmented-reality-microscope.html
Ребята взяли обычный серийный оптический микроскоп и вставили между окуляром и объективом два модуля. Один отражает изображение на фотоматрицу и второй потом совмещает реальное изображение в окуляре с проецируемым. Изображение с фотоматрицы обрабатывается алгоритмом на глубокой сверточной нейросети (https://goo.gl/M8jS4W). Алгоритм способен работать с разными типами опухолей, но разработчики сконцентрировались на патологических картинах 2х типов опухолей — метастазах РМЖ в сигнальных лимфатических узлах и РПЖ. Для обучения хватило датасета из 399 сканов гистологий mts РМЖ и 285 картин тканей предстательной железы
Алгоритм в реальном времени “обводит” подозрительные области, помогая патологу сразу обратить внимание на подозрительные структуры. Наглядно это показано на видео https://www.youtube.com/watch?v=ejMe4k3e2WQ
Кому интересно детальнее ознакомиться с технологией — https://drive.google.com/file/d/1WRBCqJItaGly-9PDSMlwQ5Ldhc8lB0lf/view Если будет время, в ближайшее время сделаем детальный разбор технологической части на нашем медиуме. Stay tuned
Сегодня новость по моей любимой теме — AI в онкологии. На ежегодной конференции AACR (American Association for Cancer Research) команда Google AI представила 🔬 с дополненной реальностью для патологов.
https://research.googleblog.com/2018/04/an-augmented-reality-microscope.html
Ребята взяли обычный серийный оптический микроскоп и вставили между окуляром и объективом два модуля. Один отражает изображение на фотоматрицу и второй потом совмещает реальное изображение в окуляре с проецируемым. Изображение с фотоматрицы обрабатывается алгоритмом на глубокой сверточной нейросети (https://goo.gl/M8jS4W). Алгоритм способен работать с разными типами опухолей, но разработчики сконцентрировались на патологических картинах 2х типов опухолей — метастазах РМЖ в сигнальных лимфатических узлах и РПЖ. Для обучения хватило датасета из 399 сканов гистологий mts РМЖ и 285 картин тканей предстательной железы
Алгоритм в реальном времени “обводит” подозрительные области, помогая патологу сразу обратить внимание на подозрительные структуры. Наглядно это показано на видео https://www.youtube.com/watch?v=ejMe4k3e2WQ
Кому интересно детальнее ознакомиться с технологией — https://drive.google.com/file/d/1WRBCqJItaGly-9PDSMlwQ5Ldhc8lB0lf/view Если будет время, в ближайшее время сделаем детальный разбор технологической части на нашем медиуме. Stay tuned
Google AI Blog
An Augmented Reality Microscope for Cancer Detection
Posted by Martin Stumpe, Technical Lead and Craig Mermel, Product Manager, Google Brain Team (Updated Aug 12, 2019: The work described in ...
и тебя отсеквенируем
#oncotech #pathology #ai #google Сегодня новость по моей любимой теме — AI в онкологии. На ежегодной конференции AACR (American Association for Cancer Research) команда Google AI представила 🔬 с дополненной реальностью для патологов. https://research.…
YouTube
Detecting cancer in real-time with machine learning
Learn more about our research efforts to create a machine learning and augmented reality-powered microscope for real-time detection of cancer, helping to make pathologists more efficient and ultimately to save patient lives.
Learn more: https://research…
Learn more: https://research…
Очень правильная статья со взешенным взглядом на будущее AI. В ней же — про IA и II.
https://medium.com/@mijordan3/artificial-intelligence-the-revolution-hasnt-happened-yet-5e1d5812e1e7
And, while one can foresee many problems arising such a system — involving privacy issues, liability issues, security issues, etc — these problems should properly be viewed as challenges, not show-stoppers.
https://medium.com/@mijordan3/artificial-intelligence-the-revolution-hasnt-happened-yet-5e1d5812e1e7
Medium
Artificial Intelligence — The Revolution Hasn’t Happened Yet
Artificial Intelligence (AI) is the mantra of the current era. The phrase is intoned by technologists, academicians, journalists and…
Теперь Teardrop в ДНК!
https://knife.media/dna-album/
https://www.ethz.ch/content/dam/ethz/news/eth-news/2018/04/180420-mezzanine-on-dna/teardrop-short.mp3
https://knife.media/dna-album/
https://www.ethz.ch/content/dam/ethz/news/eth-news/2018/04/180420-mezzanine-on-dna/teardrop-short.mp3
Нож
Massive Attack к 20-летию альбома Mezzanine закодировали его в ДНК
Mezzanine — третий студийный и самый успешный альбом бристольского трио. В этом году пластинке исполнилось 20 лет — теперь она будет храниться практически вечно.
Всем биологии, господа! И сна.
http://www.pnas.org/content/early/2018/05/01/1720719115
http://www.pnas.org/content/early/2018/05/01/1720719115
PNAS
Simulated night shift work induces circadian misalignment of the human peripheral blood mononuclear cell transcriptome
Night shift work is associated with adverse health effects, including diabetes, cardiovascular disease, and cancer. Understanding the molecular mechanisms that underlie this association is instrumental in advancing the diagnosis, prevention, and treatment…
Очень приятно видеть, как точные науки вроде современной генетики и биологии вообще подбираются ближе к самому обществу. А у NYT приятные лонгриды!
https://www.nytimes.com/2018/04/23/health/genes-mutation-foxg1-brain.html
https://www.nytimes.com/2018/04/23/health/genes-mutation-foxg1-brain.html
Nytimes
Infinitesimal Odds: A Scientist Finds Her Child’s Rare Illness Stems From the Gene She Studies
When it comes to studying the genetics of the brain, Soo-Kyung Lee is a star, yet she was stunned to discover the cause of her daughter’s devastating disabilities.
Сразу две забавных статьи за последнее время: про механизмы памяти и про внеземное происхождение жизни (или части жизни).
Несколько дней назад в журнале eNeuro вышла статья, в которой авторы заявляют о передаче памяти между улитками с помощью инъекции РНК. Её осветили много изданий, например The Guardian. Прекрасный повод для оживлённых дискуссий!
А вот здесь авторы говорят о том, что головоногие на самом деле пришельцы! В обсуждении на HN есть ссылки на освещение статьи в новостных изданиях.
Обе статьи так или иначе связаны с проблемой разума и интеллекта, обеим статьям читатели не очень-то и поверили, но обе напоминают о том, что в этой важной и интригующей области биологии есть широкий простор для великих открытий.
Несколько дней назад в журнале eNeuro вышла статья, в которой авторы заявляют о передаче памяти между улитками с помощью инъекции РНК. Её осветили много изданий, например The Guardian. Прекрасный повод для оживлённых дискуссий!
А вот здесь авторы говорят о том, что головоногие на самом деле пришельцы! В обсуждении на HN есть ссылки на освещение статьи в новостных изданиях.
Обе статьи так или иначе связаны с проблемой разума и интеллекта, обеим статьям читатели не очень-то и поверили, но обе напоминают о том, что в этой важной и интригующей области биологии есть широкий простор для великих открытий.
eNeuro
RNA from Trained Aplysia Can Induce an Epigenetic Engram for Long-Term Sensitization in Untrained Aplysia
The precise nature of the engram, the physical substrate of memory, remains uncertain. Here, it is reported that RNA extracted from the central nervous system of Aplysia given long-term sensitization (LTS) training induced sensitization when injected into…
Товарищи из Salk'а дифференцируют фибробласты в нейроны и ухитряются находить в них следы старения. И возрастные изменения в митохондриях тоже сохраняются.
И пресс-релизы у Salk'а замечательные.
И пресс-релизы у Salk'а замечательные.