Santry's Singularity blog
2.18K subscribers
222 photos
20 videos
4 files
374 links
Авторский блог техноредактора. Научная журналистика, инсайды и нерегулярные записки о приближении сингулярности.

По всем вопросам (кроме рекламы):
@santry

#наука #технологии #будущее #футурология #сингулярность
Download Telegram
​​(Н)и рыба, (н)и мясо, (н)и злак

Мы вступаем в золотой век инженерной биологии. Предвестник этого странного времени - мясной рис, выращенный в лаборатории Университета Ёнсей в Южной Корее.

Чтобы приготовить это блюдо, ученые взяли обычные рисовые зерна, покрыли их рыбьим желатином, засеяли говяжьими миобластами и стволовыми клетками, полученными из жировой ткани. Затем подождали 11 дней, чтобы клетки успели "прорасти", и попробовали получившийся розовый рис на вкус.

«При приготовлении рис сохраняет традиционный внешний вид, но обладает уникальным сочетанием ароматов, в том числе легкой ореховой ноткой и нотками умами, которые характерны для мяса», - рассказал журналистам The Guardian профессор Джинки Хонг - руководитель проекта. «Хотя он не в точности повторяет вкус говядины, он предлагает приятный и новый вкус», - добавил он.

Критики проекта отмечают, что такой гибридный рис содержит всего на 8% больше белка и на 7% больше жира, - не такая уж и большая разница, чтобы говорить об альтернативе обычному мясу.

Создатели уверены, что эти показатели можно улучшить, а я обращу внимание на другой момент - рисовые зерна здесь выступили в роли каркаса, среды для развития животных клеток. Это упрощает производство по сравнению с попытками вырастить мясо в биореакторах с нуля. Так что подобные гибридные продукты перспективны с точки зрения фудтеха.

#ученые #биотех #будущее #future #scinse #НаучныеНовости #ТехноИнсайды #НаучныеТренды #БудущееТехнологий #Сингулярность #Инновации
​​Будущее проступает пятнами. Пока поблизости происходят вещи, которые не должны происходить, на другой стороне глобуса, будто в другой вселенной. Там судят 80-летнего владельца ранчо, который клонировал гигантского барана, чтобы вывести гибридную породу суперовец.

Washington post описывает многолетний заговор, который начался в 2013 году, когда неизвестный убил на территории Кыргызстана краснокнижного архара - это крупнейший из доживших до наших дней видов баранов (до двух метров в длину, 120 см в холке и до 180 кг веса). Охотник отобрал образцы и тайком привез ткани животного в США, из них в лаборатории создали более 150 клонированных эмбрионов. Они были подсажены овцам на ранчо Артура "Джека" Шубарта, подобно тому, как ученые поступили с арктическим волком. Так в штатах родился чистокровный клонированный Архар по кличке Montana Mountain King, которого вы видите на фотографии ниже.

В 2019 году Шубарт заплатил 400 долларов охотнику за яички толсторога, другого крупного барана, обитающего в Скалистых горах. Он использовал свежий биоматериал для скрещивания толсторога с потомством Горного Короля. Целью заводчика было создание породы гибридных гигантских баранов, пригодных для трофейной охоты. Шубарт полагал, что сумеет продать их владельцам американских охотничьих угодий. К тому времени за потомков клонированного архара ему уже платили по 10 тыс. долларов.

В итоге Шубарт оказался в суде, но не из-за биологических экспериментов, а за торговлю дикими животными, завоз инвазивных видов и подделку ветеринарных сертификатов. Он признал себя виновным и ожидает вынесения приговора 11 июля 2024 года по двум обвинениям, каждое из которых влечет за собой максимальное наказание в виде пяти лет тюрьмы и штрафа в 250 тыс. долларов.

#биотех #будущее
​​ИИволюция в биотехе случилась шесть лет назад

В 2018 году DeepMind показала AlphaFold — алгоритм машинного обучения, берущий последовательность аминокислот и реконструирующий белок, который из них получится. К 2022 году эта компания смоделировала 200 миллионов всевозможных белков для открытой базы. Некоторые из них я даже использовал в опытах с молекулярной визуализацией.

Несмотря на громкие заголовки, in silico и in vivo не одно и то же. Предсказания AlphaFold приходится тщательно проверять, но тогда машинное обучение начало серьезно менять биологию. Теперь оно, вероятно, спасет человечество как минимум от одного экзистенциального риска — бактерий, устойчивых к антибиотикам.

От таких бактерий умирает больше миллиона человек в год, к 2050 году эта цифра может достигнуть 10 миллионов. В то время как на открытие одного нового антибиотика уходит около десяти лет. Точнее, уходило.

В начале месяца биофизики рассказали, как при помощи машинного обучения проанализировали десятки тысяч микробных геномов из еще одной открытой базы данных. В результате алгоритм нашел более 800 тысяч фрагментов ДНК, которые кодируют потенциальные антимикробные соединения. Более 90% из них не были описаны прежде. Три из 100 соединений, синтезированных исследователями, действительно вылечили лабораторных мышей. Осталось проверить еще 799 900 — работы хватит на всю жизнь.

Машинное обучение позволило буквально перетряхнуть все известное микробное разнообразие в поисках нужных соединений, но самое удивительное, что мы не ограничены живущими сейчас организмами. Похожим образом антибиотики ищут, например, в иммунной системе неандертальцев.

Синтезом найденных соединений пока что занимаются люди, но Science уже пишет о создании шести автоматизированных лабораторий. Такие системы будут оперативно проверять результаты работы нейросетей. Этот подход уже используют для создания светоизлучающих материалов. Биотех и фармацевтика на очереди.

К тому же, согласно первым исследованиям, препараты, открытые ИИ, показывают 80-90% успешности на первой фазе испытаний, по сравнению с обычными 40-60%. Вероятно, по крайней мере в среднесрочной перспективе, будет открыто больше успешных терапевтических препаратов, чем во всей истории биотехнологий.

На фото: метициллинрезистентный золотистый стафилококк, от которого точно стоит избавиться.

#футурология #биотех #машинное_обучение #будущее #ИИ #технологии #антибиотики
Личный биореактор

10 июля Nature написал, что ученые отредактировали гены кишечных бактерий в желудке живой мыши. Думал репостнуть новость и прокомментировать, но даже узкотематические каналы обошли вниманием эту статью. И зря.

Итак, биотехнологи разработали новый инструмент для редактирования генов, "base editor" с системой доставки на основе компонентов бактериофагов. Он изменил целевой ген, ответственный за устойчивость к антибиотикам более чем в 90% колонии Escherichia coli в кишечнике мыши, без побочных эффектов и риска неконтролируемого распространения биоинженерной ДНК.

Ближайшая цель — борьба с кишечными заболеваниями, однако потенциальные применения этой технологии шире. Состав микробиоты влияет на развитие многих состояний: от атеросклероза до расстройств аутистического спектра. Метаболизирующие желчные кислоты бактерии, по-видимому, помогают людям жить дольше. Кишечные микроорганизмы могут синтезировать витамины, а могут — этиловый спирт. Вечно молодой-вечно пьяны-ы-ый…

У нас внутри есть личный биореактор, и, возможно, однажды появится возможность свободно настраивать и модифицировать эту фабрику. Сразу хочется наладить внутри производство сверхэффективных ферментов и лекарств. И эти перспективы открываются без вмешательства в человеческий геном, с которым связано так много этических вопросов.
#биотех #исследования #гмо
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Домашнее производство лекарств и кустарный биотех несут очевидные риски, но мне импонируют эти начинания. 4 Thieves Vinegar демонстрирует потенциал открытых технологий и сотрудничества в решении глобальных проблем. Возможно, в будущем подобные инициативы приведут к переосмыслению системы разработки и распространения лекарств. Это еще один шаг к будущему, где талантливым и увлеченным людям по всему миру доступны возможности, которые есть только у лабораторий с миллионными бюджетами.
#DIY #биотех #биохакинг #фарма