Еще про диагностику
Лабораторное подтверждение COVID-19 проводится путем определения РНК вируса методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в биоматериале, взятом, как правило, из дыхательных путей. Рекомендовано проводить исследование, как минимум, мазка из носоглотки и ротоглотки у амбулаторных пациентов и/или проб биоматериала из нижних отделов дыхательных путей у пациентов с тяжелым течением болезни. На практике, в определение показаний к специальному обследованию вносят коррективы следующие моменты - симптоматика ОРВИ может отражать неспецифичность клинических проявлений в начале COVID-19. Симптомы можно спутать с заражениями другими вирусами, например, гриппом, риновирусом (вирусом обычной простуды), метапневмовирусом человека (HmPV), респираторно-синцитиальным вирусом (RSV) и другими.
https://www.youtube.com/watch?v=ThG_02miq-4
Тем не менее, эпидемиологические признаки (контакт с больными и носителями COVID-19), а также характерные изменения в легких на КТ свидетельствуют о высокой вероятности COVID-19.
Лабораторное подтверждение COVID-19 проводится путем определения РНК вируса методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в биоматериале, взятом, как правило, из дыхательных путей. Рекомендовано проводить исследование, как минимум, мазка из носоглотки и ротоглотки у амбулаторных пациентов и/или проб биоматериала из нижних отделов дыхательных путей у пациентов с тяжелым течением болезни. На практике, в определение показаний к специальному обследованию вносят коррективы следующие моменты - симптоматика ОРВИ может отражать неспецифичность клинических проявлений в начале COVID-19. Симптомы можно спутать с заражениями другими вирусами, например, гриппом, риновирусом (вирусом обычной простуды), метапневмовирусом человека (HmPV), респираторно-синцитиальным вирусом (RSV) и другими.
https://www.youtube.com/watch?v=ThG_02miq-4
Тем не менее, эпидемиологические признаки (контакт с больными и носителями COVID-19), а также характерные изменения в легких на КТ свидетельствуют о высокой вероятности COVID-19.
YouTube
Coronavirus Test: Real time RT-PCR - Animation video
I make animations in biology with PowerPoint, this animation video is about the standard coronavirus test, real time RT-PCR method, which is a laboratory technique combining reverse transcription of RNA into complementary DNA, and amplification of specific…
Основной способ передачи SARS-CoV-2 от источника инфекции, согласно ВОЗ, - капельно-контактный, следовательно, “вирусная нагрузка” для заражения может быть небольшой. Это объясняет проблемы с диагностикой: концентрация вируса в разных биологических жидкостях больного может быть недостаточной для его обнаружения… Эффективность диагностики зависит от выбранной локализации для забора материала на той или иной стадии инфекции, качества взятия, предела чувствительности теста, присутствия ингибиторов ПЦР. Инфекционисты отмечают, что у пациентов с диагностированной пневмонией результат ПЦР-теста может быть отрицательным - материал из носо- ротоглотки с несостоявшейся колонизацией вируса, не всегда информативен. Это и было в моем случае (при двукратном анализе с интервалом 5 дней), когда инфекция, не вызывая значимой катаральной реакции, аносмии - с верхних дыхательных путей опустилась в легкие… Спустя 3 дня, при поступлении в стационар, мазок для определения вирусной РНК методом ПЦР мне уже не делали, а из готового результата серологического исследования я уже знал о наличии специфических для антигенов SARS-CoV-2 антителах с пограничным значением IgМ, характеризующим острую фазу и со значимым уровнем IgG, характеризующим активность гуморального иммунитета.
https://www.uptodate.com/contents/coronavirus-disease-2019-covid-19-diagnosis
https://www.uptodate.com/contents/coronavirus-disease-2019-covid-19-diagnosis
Uptodate
COVID-19: Diagnosis - UpToDate
Coronaviruses are important human and animal pathogens. At the end of 2019, a novel coronavirus was identified as the cause of a cluster of pneumonia cases in W
Про антитела
Доктор Игорь Соколов из Москвы любезно согласился на цитирование из его популярной публикации по антителам при коронавирусной инфекции:
“Все антитела при коронавирусной инфекции, независимо от класса, и М, и G, и А начинают синтезироваться почти одновременно(!), на 4-5 день болезни. И оказалось, что уровень антител А рос значительно быстрее ранних М и на 6 день (!) становится положительным при тестировании, значительно превышая концентрацию антител М класса. Первичные выводы, которые можно делать по результатам исследований:
1. До 6-го дня болезни вероятность положительного результата ЛЮБОГО теста на антитела призрачно мала. Поэтому в качестве диагностики должны применяться ПЦР и антигенные тесты.
2. С 6-го дня прогрессивно растет вероятность определения антител класса А (! и это важно), антитела класса М тоже растут, но значительно в меньшем титре. Вероятность положительного результат в промежуток 6-12 дней от начала болезни выше по тесту на антитела А. Поэтому, если вы хотите подтвердить болезнь ранним анализом крови, то Ваш выбор – антитела А, которые на 7 сутки заболевания дает правильную оценку у 75% заболевших, увеличиваясь к 100% на 10-12 день.
3. С 12 по 21 день болезни будут определяться и М, и А, и G. Далее, антитела класса М при коронавирусе могут оставаться в крови до 2 месяцев (!), и это зарегистрировано. Поэтому не удивляйтесь, что у некоторых (не у всех) антитела этого класса определяются весьма продолжительное время. Это не является никаким признаком болезни или основанием для карантина”.
Прежде, чем представить уровни и прогнозируемую динамику IgM b IgG из моего анализа при поступлении, уточню, что наиболее иммуногенными белками вируса SARS-CoV-2 являются спайковый и нуклеокапсидный белки, а антитела к ним и ИХ ДИНАМИКА очень сильно отличаются по тому КАКИЕ это антитела, грубо - к нуклеопротеину или спайку. Так вот IgM к нуклеопротеину уходят очень быстро, даже вернее не так: появляются в очень низком титре, потому что организм СРАЗУ продуцирует IgG, они лучше, они спасительнее... В моем случае определяли нуклеопротеиновые антитела...
Доктор Игорь Соколов из Москвы любезно согласился на цитирование из его популярной публикации по антителам при коронавирусной инфекции:
“Все антитела при коронавирусной инфекции, независимо от класса, и М, и G, и А начинают синтезироваться почти одновременно(!), на 4-5 день болезни. И оказалось, что уровень антител А рос значительно быстрее ранних М и на 6 день (!) становится положительным при тестировании, значительно превышая концентрацию антител М класса. Первичные выводы, которые можно делать по результатам исследований:
1. До 6-го дня болезни вероятность положительного результата ЛЮБОГО теста на антитела призрачно мала. Поэтому в качестве диагностики должны применяться ПЦР и антигенные тесты.
2. С 6-го дня прогрессивно растет вероятность определения антител класса А (! и это важно), антитела класса М тоже растут, но значительно в меньшем титре. Вероятность положительного результат в промежуток 6-12 дней от начала болезни выше по тесту на антитела А. Поэтому, если вы хотите подтвердить болезнь ранним анализом крови, то Ваш выбор – антитела А, которые на 7 сутки заболевания дает правильную оценку у 75% заболевших, увеличиваясь к 100% на 10-12 день.
3. С 12 по 21 день болезни будут определяться и М, и А, и G. Далее, антитела класса М при коронавирусе могут оставаться в крови до 2 месяцев (!), и это зарегистрировано. Поэтому не удивляйтесь, что у некоторых (не у всех) антитела этого класса определяются весьма продолжительное время. Это не является никаким признаком болезни или основанием для карантина”.
Прежде, чем представить уровни и прогнозируемую динамику IgM b IgG из моего анализа при поступлении, уточню, что наиболее иммуногенными белками вируса SARS-CoV-2 являются спайковый и нуклеокапсидный белки, а антитела к ним и ИХ ДИНАМИКА очень сильно отличаются по тому КАКИЕ это антитела, грубо - к нуклеопротеину или спайку. Так вот IgM к нуклеопротеину уходят очень быстро, даже вернее не так: появляются в очень низком титре, потому что организм СРАЗУ продуцирует IgG, они лучше, они спасительнее... В моем случае определяли нуклеопротеиновые антитела...
Плюс 1⃣4⃣ день (стационар)
💊💉🌡🩺
Ночь не отличалась от предыдущей… около четырех проснулся от стеснения за грудиной… Это становилось системой. Сатурация была 88-92%, подключал кислород и переходил в “прон-позицию”, проветривал палату, пытался заснуть... Решил просить врача о назначении снотворного. День проходил с аналогично. По показателям, значимой динамики не отмечал. Спонтанная сатурация не изменялась, индуцированная - с кислородом в прон-позиции достигала 97%. Аппетит улучшился, но больше, чем приносили есть не хотелось. Несмотря на ингаляции, приступы сухого кашля сохранялись. Беспокоила тахикардия в ортостазе до 120 в минуту. Был эпизод повышения артериального давления до 152/102 мм рт ст – принял Каптоприл. Во время обхода врач отметила дальнейшее уменьшение зоны хрипов над легкими. Мне было известно, что в клинике развивали методику УЗИ легких. Я знал заведующую диагностическим отделением по работе. Согласовал с лечащим врачом это обследование.
Начали ступенчатое снижение дексазона (с этого дня вводили по 4 мг утром и вечером).
Еще одно назначение – меласон на ночь.
Из новостей – узнал, что отменили плановый прием в поликлиниках…Кривая заболеваемости все еще была в экспоненциальной фазе.
Коллеги, с которыми общался по телефону рассказывали о повторных заражениях.
Моего соседа из бокса напротив перевели в отделение интенсивной терапии – не удерживал сатурацию в ортостазе…
💊💉🌡🩺
Ночь не отличалась от предыдущей… около четырех проснулся от стеснения за грудиной… Это становилось системой. Сатурация была 88-92%, подключал кислород и переходил в “прон-позицию”, проветривал палату, пытался заснуть... Решил просить врача о назначении снотворного. День проходил с аналогично. По показателям, значимой динамики не отмечал. Спонтанная сатурация не изменялась, индуцированная - с кислородом в прон-позиции достигала 97%. Аппетит улучшился, но больше, чем приносили есть не хотелось. Несмотря на ингаляции, приступы сухого кашля сохранялись. Беспокоила тахикардия в ортостазе до 120 в минуту. Был эпизод повышения артериального давления до 152/102 мм рт ст – принял Каптоприл. Во время обхода врач отметила дальнейшее уменьшение зоны хрипов над легкими. Мне было известно, что в клинике развивали методику УЗИ легких. Я знал заведующую диагностическим отделением по работе. Согласовал с лечащим врачом это обследование.
Начали ступенчатое снижение дексазона (с этого дня вводили по 4 мг утром и вечером).
Еще одно назначение – меласон на ночь.
Из новостей – узнал, что отменили плановый прием в поликлиниках…Кривая заболеваемости все еще была в экспоненциальной фазе.
Коллеги, с которыми общался по телефону рассказывали о повторных заражениях.
Моего соседа из бокса напротив перевели в отделение интенсивной терапии – не удерживал сатурацию в ортостазе…
О патогенезе
Патогенез COVID-19 до конца не изучен. Коронавирус может проникать в организм человека различными способами. Самым распространенным считается аэрогенный механизм передачи. Возбудители колонизируют эпителиоциты носо- и ротоглотки, где активно размножаются, разрушая клетки, определяя характерную клиническую картину с не тяжелым течением. В клетку SARS-CoV-2 попадает с помощью белка-«шипа» (spike, S-белок). С его помощью происходит прикрепление к рецептору на поверхности клетки-хозяина. Рецептор - ангиотензин-превращающий фермент 2 (АПФ2/ACE2). Эти рецепторы широко представлены в организме
Патогенез COVID-19 до конца не изучен. Коронавирус может проникать в организм человека различными способами. Самым распространенным считается аэрогенный механизм передачи. Возбудители колонизируют эпителиоциты носо- и ротоглотки, где активно размножаются, разрушая клетки, определяя характерную клиническую картину с не тяжелым течением. В клетку SARS-CoV-2 попадает с помощью белка-«шипа» (spike, S-белок). С его помощью происходит прикрепление к рецептору на поверхности клетки-хозяина. Рецептор - ангиотензин-превращающий фермент 2 (АПФ2/ACE2). Эти рецепторы широко представлены в организме
N.J. Matheson, P.J. Lehner. Science 2020;369:510-511
https://science.sciencemag.org/content/369/6503/510
https://science.sciencemag.org/content/369/6503/510
Schematic of SARS-CoV-2 targeting of ACE2 receptor and entry in infected cell. P. Ryan, N. Caplice. Open Heart 2020;7:e001302
https://openheart.bmj.com/content/7/1/e001302
https://openheart.bmj.com/content/7/1/e001302
У части заболевших коронавирусы опускаются из верхних дыхательных путей в нижние, прикрепляется к альвеолярному эпителию. SARS-CoV-2 использует АПФ2 не только для проникновения в клетку, он также угнетает дальнейшую экспрессию этого белка, что приводит к прекращению его органопротективного действия.
https://science.sciencemag.org/content/367/6485/1444
https://medach.pro/post/2328
https://www.nature.com/articles/s41564-020-0688-y
https://microbiol.elpub.ru/jour/article/view/871?locale=ru_RU
https://science.sciencemag.org/content/367/6485/1444
https://medach.pro/post/2328
https://www.nature.com/articles/s41564-020-0688-y
https://microbiol.elpub.ru/jour/article/view/871?locale=ru_RU
Science
Structural basis for the recognition of SARS-CoV-2 by full-length human ACE2
Scientists are racing to learn the secrets of severe acute respiratory syndrome–coronavirus 2 (SARS-CoV-2), which is the cause of the pandemic disease COVID-19. The first step in viral entry is the binding of the viral trimeric spike protein to the human…
N.J. Matheson, P.J. Lehner. Science 2020;369:510-511
https://science.sciencemag.org/content/369/6503/510
https://science.sciencemag.org/content/369/6503/510
После того, как рецептор-узнающий белок Spike связывается с рецептором, вирусная частица попадает внутрь клетки путем эндоцитоза и реплицируются. Eсли рассматривать подробно, жизненный цикл SARS-CoV в клетках-хозяевах может выглядеть так. Вирус проникает в клетки-мишени через эндосомный путь. S-белок сначала связывается с клеточным рецептором, и комплекс “ACE2-вирус” перемещается в эндосомы, где S-белок расщепляется эндосомными протеазами. Вирусный геном высвобождается и транслируется в полипротеины вирусной репликазы pp1a и 1ab, которые затем расщепляются вирусными протеиназами на небольшие продукты. Субгеномные матрицы с отрицательной цепью синтезируются из прерывистой транскрипции на геноме с положительной цепью и служат в качестве матриц для синтеза мРНК. Полноразмерный шаблон с отрицательной цепью делается в качестве шаблона для геномной РНК. Вирусные нуклеокапсиды собираются из геномной РНК и N белка в цитоплазме с последующим отрастанием в просвет эндоплазматического ретикулума (ER) - промежуточный компартмент Гольджи. Затем вирионы высвобождаются из клетки посредством экзоцитоза...
Nature
The spike protein of SARS-CoV — a target for vaccine and therapeutic development
Nature Reviews Microbiology - The outbreaks of severe acute respiratory syndrome (SARS) between 2002 and 2004 killed hundreds of people. Vaccines against the SARS coronavirus (SARS-CoV) could...
В дальнейшем возникает пропотевание жидкости с белками в ткань легкого, разрушение сурфактанта, коллапс альвеол, снижение эффективной поверхности газообмена. Таким образом, вирус может размножаться в альвеолярном эпителии, непосредственно повреждая легочную ткань – у заболевшего человека могут появляться симптомы тяжелой пневмонии…
N.J. Matheson, P.J. Lehner. Science 2020;369:510-511
https://science.sciencemag.org/content/369/6503/510
https://science.sciencemag.org/content/369/6503/510
При этом, на фоне снижения Т-лимфоцитов, что приводит к иммуносупрессии, может происходить выброс провоспалительных цитокинов (ИЛ-6, ФНО-альфа и др.), определяющий тяжесть течения заболевания – крайний вариант которой обусловлен “цитокиновым штормом”. Это защитный механизм организма: он борется с инфекцией, выбрасывая медиаторы воспаления, но вместо борьбы получается массивное повреждение тканей легких с развитием острого респираторного дистресс-синдрома…
Плюс 1⃣5⃣ день (стационар)
💊💉🌡🩺
Хотя и принимал на ночь Меласон, адекватный сон длился не более 4-5 часов. dДва раза просыпался от стеснения за грудиной, приступа сухого кашля… Сатурация была 90-92%, снова подключал кислород и переходил в “прон-позицию”, проветривал палату, пытался заснуть... День был похож на фотографию вчерашнего. По показателям, значимой динамики не отмечал. Спонтанная сатурация была около 94%, индуцированная - с кислородом в прон-позиции достигала 96-97%. Приступы сухого кашля сохранялись. Беспокоила тахикардия в ортостазе до 118 в минуту. Снова было однократное повышение артериального давления до 164/98 мм рт ст. Так как принимал Лористу, в составе которой Лозартан – антагонист рецепторов ангиотензина 2, с превращающим ферментом которого (АПФ2) взаимодействует коронавирус, решил на эту тему посмотреть литературу. Пока ждал консультации кардиолога, нужно было для себя разобраться – увеличивать дозу Лористы, либо добавлять еще один препарат (например бета-блокатор).
На обходе дежурный доктор поинтересовался моими показателями и хронологией заболевания, после чего дал благоприятный прогноз.
Звонили с работы, справлялись о состоянии, спрашивали когда выйду…также сообщили, что заболело еще несколько сотрудников. Поинтересовался у местного персонала, как у них обстоят дела с заболеваемостью. Было сказано, что научились работать по всем правилам еще во время первой волны, и несмотря на то, что вторая мощнее, заболеваемость среди медперсонала относительно невысокая.
💊💉🌡🩺
Хотя и принимал на ночь Меласон, адекватный сон длился не более 4-5 часов. dДва раза просыпался от стеснения за грудиной, приступа сухого кашля… Сатурация была 90-92%, снова подключал кислород и переходил в “прон-позицию”, проветривал палату, пытался заснуть... День был похож на фотографию вчерашнего. По показателям, значимой динамики не отмечал. Спонтанная сатурация была около 94%, индуцированная - с кислородом в прон-позиции достигала 96-97%. Приступы сухого кашля сохранялись. Беспокоила тахикардия в ортостазе до 118 в минуту. Снова было однократное повышение артериального давления до 164/98 мм рт ст. Так как принимал Лористу, в составе которой Лозартан – антагонист рецепторов ангиотензина 2, с превращающим ферментом которого (АПФ2) взаимодействует коронавирус, решил на эту тему посмотреть литературу. Пока ждал консультации кардиолога, нужно было для себя разобраться – увеличивать дозу Лористы, либо добавлять еще один препарат (например бета-блокатор).
На обходе дежурный доктор поинтересовался моими показателями и хронологией заболевания, после чего дал благоприятный прогноз.
Звонили с работы, справлялись о состоянии, спрашивали когда выйду…также сообщили, что заболело еще несколько сотрудников. Поинтересовался у местного персонала, как у них обстоят дела с заболеваемостью. Было сказано, что научились работать по всем правилам еще во время первой волны, и несмотря на то, что вторая мощнее, заболеваемость среди медперсонала относительно невысокая.
Взаимодействие между COVID-19 и ренин-ангиотензин-альдостероновой системой – по данным литературы, представленной здесь:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32142651/
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/10/3474/html
https://kodelife.ru/ingibitory-apf-ne-uxudshayut-techenie-covid-19-no-eto-delaet-muzhskoj-pol/
https://pharmznanie.ru/article/coronavirus/ispolzovanie-gipotenzivnykh-preparatov-vo-vremya-pandemii-covid-19
https://microbiol.elpub.ru/jour/article/view/871?
https://medach.pro/post/2328
Ренин-ангиотензин-альдостероновая система (РААС) – система вазоактивных пептидов, активно влияющая на физиологические процессы в организме
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32142651/
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/10/3474/html
https://kodelife.ru/ingibitory-apf-ne-uxudshayut-techenie-covid-19-no-eto-delaet-muzhskoj-pol/
https://pharmznanie.ru/article/coronavirus/ispolzovanie-gipotenzivnykh-preparatov-vo-vremya-pandemii-covid-19
https://microbiol.elpub.ru/jour/article/view/871?
https://medach.pro/post/2328
Ренин-ангиотензин-альдостероновая система (РААС) – система вазоактивных пептидов, активно влияющая на физиологические процессы в организме
PubMed
SARS-CoV-2 Cell Entry Depends on ACE2 and TMPRSS2 and Is Blocked by a Clinically Proven Protease Inhibitor - PubMed
The recent emergence of the novel, pathogenic SARS-coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in China and its rapid national and international spread pose a global health emergency. Cell entry of coronaviruses depends on binding of the viral spike (S) proteins to cellular…
Ангиотензин 2 (Анг2) - это ключевое звено РААС. Он поддерживает баланс в состоянии мускулатуры бронхов, фибробластов в легких, в регуляции апоптоза альвеолярных эпителиаль¬ных клеток, проницаемости сосудов в легочной ткани, взаимодействуя как с рецептором первого типа (AT1Р), так и при связывании с рецептором второго типа (AT2Р).
Ангиотензинпревращающий фермент 2 (АПФ2) – реализует гидролиз ангиотензина II в ангиотензин-(1-7), который через Mas-рецепторы, ослабляет его эффекты на вазоконстрикцию, задержку натрия и процессы фиброзирования, вызывая вазодилатацию, снижение артериального давления, подобно при связывании Aнг2 с AT2Р
Ангиотензинпревращающий фермент 2 (АПФ2) – реализует гидролиз ангиотензина II в ангиотензин-(1-7), который через Mas-рецепторы, ослабляет его эффекты на вазоконстрикцию, задержку натрия и процессы фиброзирования, вызывая вазодилатацию, снижение артериального давления, подобно при связывании Aнг2 с AT2Р
Механизм действия ангиотензина 2 (в модификации)
https://tabletix.ru/polezno-znat/opasnost-koronavirusa-dlya-bolnyh-saharnym-diabetom-1-i-2-tipov/?amp
https://tabletix.ru/polezno-znat/opasnost-koronavirusa-dlya-bolnyh-saharnym-diabetom-1-i-2-tipov/?amp