Литва расположена в Балтийском регионе, где соседствуют народы двух языковых семей: индоевропейской и финно-угорской ветви уральской (Эстония). Предыдущие генетические исследования охарактеризовали популяцию литовцев как частично изолированную, сохраняющую древнюю генетическую композицию и генетическую уникальность в европейском контексте. Первые жители этой территории появились около 11 тысяч лет назад, это были охотники-собиратели, пришедшие из Западной Европы. Около 6000-5000 лет назад на восточном побережье Балтики появились финно-угорские племена. Археологические, лингвистические и генетические данные говорят о влиянии финно-угров на балтов; наряду с этим влияние на них оказывали соседние славяне.

В работе исследованы геномы 425 литовцев. Образцы ДНК были генотипированы на панели Illumina HumanOmniExpress-12v1.1, проанализированы 532 836 аутосомных SNP. В анализе использованы также аутосомные геномные данные из Северо-Восточной Европы (Латвия, Эстония, Беларусь, Центральная Россия, Южная Россия, Финляндия, Польша, саамы, кольские саамы, Словакия и Словения) и Западной Сибири (ханты, манси).

В анализ главных компонент по 105,853 SNP включили 579 геномов. На графике литовцы образовали кластер вместе с латышами, близко к белорусам и эстонцам. Саамы из Швеции и с Кольского полуострова сгруппировались с финнами. Манси оказались разбросаны на графике широко, и некоторые их образцы тяготеют к балтийским и славянским популяциям.

По данным анализа ADMIXTURE при k = 5 литовцы отличаются доминирующим генетическим компонентом (31%), который велик также у латышей (23,4%) и меньше выражен у эстонцев (12%), белорусов (10%) и поляков (13,9%). На графике он обозначен синим цветом. В остальных изученных популяциях этот компонент очень невелик (от 1% до 6%) и отсутствует у саамов и хантов.

Далее авторы вычислили время разделения между изученными популяциями, используя величину эффективного размера популяции Ne и генетические расстояния FST, и по этим данным построили филогенетическое дерево. Время разделения между литовцами, популяциями Западной Сибири и саамами они оценили в 9090 и 6500 лет назад, соответственно. Отделение от популяций Восточной Европы произошло около 1000 лет назад, а от популяций Северо-Восточной Европы – около 700 лет назад. Самое древнее разделение – между хантами и популяциями Балтики, произошло 12 250 лет назад, манси и ханты образуют самую раннюю отделившуюся субкладу, за ними следует ветвь саамов. Как и ожидалось, три балтийских популяции формируют отдельную ветвь, наиболее близкую к славянам. Таким образом, порядок отделения ветвей популяций соответствует их географическому расположению.

При сравнении геномов литовцев с геномами других популяций авторы выявили сигналы недавнего положительного отбора в нескольких генах, они нашли такие сигналы в 24 регионах, 21 из которых ранее не был описан. Самый сильный сигнал найден в гене TYRP1, вовлеченном в светлую пигментацию кожи у европейцев. Обнаружены также сигналы отбора в нескольких генах, ассоциированных с заболеваниями: болезнью Альцгеймера, гипертонией и другими.

Таким образом, исследование на полногеномной панели выявило генетическую близость литовцев к окружающим популяциям (латыши, эстонцы, белорусы) и частичную близость к западным славянам (поляки, словаки, словенцы), при, тем не менее, определенных генетических различиях. Близость некоторых образцов манси в пространстве РСА к балтийским популяциям, а также к словакам и словенцам можно объяснить потоками генов между предковыми популяциями манси и охотниками-собирателями Северо-Восточной Европы, которые происходили от 6,6 до 8 тысяч лет назад. Генетические расстояния указывают на умеренный генетический дрейф между хантами и популяциями Северо-Восточной и Восточной Европы.

Генетическая индивидуальность литовцев выражается в преобладании у них специфического генетического компонента (синий цвет на ADMIXTURE). Предположительно, этот компонент отражает наследие первых поселенцев в балтийском регионе, которое сохраняется в генофонде литовцев.

По ранее полученным данным, литовцы несут наибольшую долю предкового компонента западноевропейских охотников-собирателей по сравнению с другими европейскими популяциями. Результаты согласуются с данными (Kushniarevich et al. (2015)), что славяне разделяют некоторые общие генетические компоненты с окружающими балтийскими популяциями. Подтверждается также умеренное влияние финно-угорских популяций на литовцев и латышей.

Источник: http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=34736

Переход к мясной диете, вероятно, не сыграл роли в эволюции человека

Ученые опровергли гипотезу о том, что причиной появления многих анатомических особенностей, присущих современным людям, стал переход предков на мясную диету. Этот ошибочный вывод мог быть сделан из-за повышенного внимания специалистов к определенным этапам истории нашего вида.

Многие черты, присущие современному человеку, появились еще у его предка Homo erectus практически два миллиона лет назад. Этот эволюционный переход археологи часто связывали с изменением рациона — переходом на мясное питание. Однако новое исследование ученых из Университета Джорджа Вашингтона поставило под сомнение такую гипотезу. По мнению авторов статьи, опубликованной в Proceedings of the National Academy of Sciences, множество археологических свидетельств перехода Homo erectus на мясную диету связано с повышенным вниманием исследователей к этому периоду человеческой истории.

Homo erectus — человек прямоходящий — предок Homo sapiens, появившийся на территории Африки около двух миллионов лет назад. Кроме прямохождения, ему были свойственны и другие черты современного человека — ранее ученые связывали это с изменением питания. Несмотря на более древние свидетельства плотоядности человека, Homo erectus считался первым видом Homo, перешедшим на полностью мясную диету, которая и стала причиной увеличения размеров мозга и тела, а также изменила строение кишечника.

Для проверки гипотезы ученые проанализировали данные, собранные на девяти археологических памятниках в Восточной Африке, 59 исследованных участков датировались 2,6-1,2 миллиона лет назад. Исследователи подсчитали, как часто там встречались сохранившиеся кости животных со следами порезов, сделанных каменными орудиями, — доказательства плотоядности древних людей. Они также проследили зависимость количества таких костей от возраста слоя, в котором те были найдены.

Оказалось, число доказательств плотоядности древних людей зависит от количества самих образцов, а также от тщательности раскопок на участке. При поправке на количество образцов увеличения числа свидетельств плотоядности между 2,6 и 1,2 миллиона лет назад вообще не наблюдается. Таким образом, множество доказательств мясного питания Homo erectus связано лишь с повышенным вниманием ученых к этому виду, а не с реальным изменением поведения.

По мнению авторов статьи, их результаты дают совершенно новое прочтение археологической летописи и подчеркивают важность вопросов эволюции нашего вида. Теперь археологам потребуются новые объяснения того, почему у человека возникли определенные анатомические и поведенческие черты, сохранившиеся до сих пор. Возможно, причина кроется в использовании огня или приготовлении пищи. Однако пока ни одно возможных объяснений не нашло точного подтверждения в археологических данных.

Источник:https://naked-science.ru/article/anthropology/perehod-k-myasnoj-diete-veroyatno-ne-sygral-roli-v-evolyutsii-cheloveka?utm_source=inarticle&utm_medium=inarticle&utm_campaign=inarticle

Социолог объяснил, почему мигранты не боятся убивать русских
#мультирасовое_общество_РА

Председатель Следственного комитета России Александр Бастрыкин сегодня заявил о росте числа преступлений, совершённых мигрантами. Социолог Александр Прудник подтвердил это, и назвал две причины, почему приезжие грабят и убивают русских. Александр Бастрыкин считает, что лучшим средством для борьбы с мигрантами-преступниками должно стать совершенствование миграционных процессов. "Для борьбы с растущей преступностью среди приезжающих в Россию на заработки нужно совершенствовать миграционные процессы", - считает Бастрыкин.

По его мнению, в настоящий момент нужны принципиально новые подходы в решении проблемы преступлений, которые совершают трудовые мигранты, так как зачастую их вербуют в террористические и преступные группировки сразу по приезде в Россию.

"В основном это молодые люди из центральноазиатских республик, которые нередко становятся объектом такой вербовки", - отметил Бастрыкин.

Вопрос преступлений мигрантов назрел уже очень давно, уверен социолог Александр Прудник. Действительно, с каждым годом число преступлений, которые совершаются мигрантами, увеличивается, и это становится проблемой, подтвердил он. В разговоре с Царьградом Александр Прудник назвал два источника этой проблемы:

"Первый источник - это само миграционное законодательство, которое не ставит никаких барьеров перед теми людьми, которые склонны и к совершению преступлений, противоправных действий, и плюс к тому, которые заражены идеями радикального исламизма. Слишком широко открыты двери в нашу страну.

А второй источник - это уже наша внутренняя проблема, полагает социолог. Он объяснил, что мигранты - из бывших республик СССР, то есть из стран, где русские подвергались и подвергаются давлению, откуда русских изгоняли и где русские становились объектом агрессии.

Где русские - это образ жертвы. Причём жертвы бесправной. Они приезжают сюда с точно такой же психологией. И поэтому для них нет никаких внутренних преград, для того чтобы снова совершать преступления против русских, которых они уже привыкли воспринимать именно в таком формате", - не стал скрывать эксперт.

"Поэтому мы должны решать этот вопрос с двух сторон, - уверен Прудник. - Первое - это контроль на внешнем входе. И второе - это жёсткое позиционирование по отношению к мигрантам, что в любых конфликтах интересы местных жителей, интересы жителя России всегда будут стоять на первом месте по сравнению с интересами мигрантов".

Источник: https://m.tsargrad.tv/news/sociolog-objasnil-pochemu-migranty-ne-bojatsja-ubivat-russkih-jeto-obraz-zhertvy_477212

Монументальный проект по секвенированию генома каждого сложного вида на Земле

Проект "Биогеном Земли" - глобальный консорциум, цель которого - за десять лет составить последовательность геномов всех сложных живых организмов на Земле (около 1,8 миллиона описанных видов) - набирает обороты.

Истоки, цели и ход проекта подробно описаны в двух статьях с участием многих авторов, опубликованных 18 января 2022 года. После завершения проекта он навсегда изменит методы проведения биологических исследований.

В частности, исследователи больше не будут ограничены несколькими "модельными видами" и смогут изучать базу данных последовательности ДНК любого организма, демонстрирующего интересные характеристики. Эта новая информация поможет нам понять, как развивалась сложная жизнь, как она функционирует и как можно защитить биоразнообразие.

Впервые проект был предложен в 2016 году. В настоящее время он находится в процессе перехода от начальной стадии к полномасштабному производству.

Цель первой фазы - секвенировать по одному геному из каждого таксономического семейства на Земле, а их около 9400. К концу 2022 года должна быть выполнена треть этих видов. На втором этапе будет проведено секвенирование представителей всех 180 000 родов, а на третьем этапе будет завершена работа над всеми видами.

Главная цель проекта "Биогеном Земли" - составить последовательность геномов всех 1,8 миллионов описанных видов сложной жизни на Земле. Сюда входят все растения, животные, грибы и одноклеточные организмы с настоящим ядром (то есть все "эукариоты").

Хотя такие модельные организмы, как мыши, плодовые мушки и нематоды, сыграли огромную роль в нашем понимании функций генов, огромное преимущество заключается в возможности изучать другие виды, которые могут работать несколько иначе.

Многие важные биологические принципы были получены в результате изучения малоизвестных организмов. Например, гены были открыты Грегором Менделем в горохе, а правила, которые ими управляют, были обнаружены в красной хлебной плесени.

ДНК была впервые обнаружена в сперме лосося, а наши знания о некоторых системах, обеспечивающих ее сохранность, появились благодаря исследованию тардиград. Хромосомы впервые были обнаружены у мучных червей, а половые хромосомы - у жука (действие и эволюция половых хромосом также изучались у рыб и утконосов). А теломеры, которые закрывают концы хромосом, были обнаружены в прудовых слизях.

Сравнение близко/далеко родственных видов дает огромные возможности для обнаружения того, что делают гены и как они регулируются. Например, в другой статье PNAS, по совпадению также опубликованной 18 января обнаружено, что австралийские ящерицы-драконы регулируют половую функцию не самой последовательностью ДНК, а соседством хромосом с половым геном.

Ученые также используют сравнение видов, чтобы проследить гены и регуляторные системы до их эволюционного происхождения, что позволяет выявить удивительную сохранность функций генов на протяжении почти миллиарда лет. Например, одни и те же гены участвуют в развитии сетчатки глаза у человека и фоторецепторов плодовой мушки. А ген BRCA1, мутировавший при раке молочной железы, отвечает за восстановление разрывов ДНК у растений и животных.

Геном животных также гораздо более консервативен, чем предполагалось ранее. Например возраст хромосом животных составляет 684 миллиона лет.

Будет интересно исследовать "темную материю" генома и выяснить, как последовательности ДНК могут играть роль в функционировании и эволюции генома.

Еще одной важной целью проекта "Биогеном Земли" является природоохранная геномика. Эта область использует секвенирование ДНК для выявления видов, находящихся под угрозой исчезновения, к которым относится около 28% сложных организмов мира, что помогает нам следить за их генетическим здоровьем и давать рекомендации по управлению.

До недавнего времени на секвенирование больших геномов уходили годы и многие миллионы долларов. Но в настоящее время произошли огромные технические достижения, которые позволяют проводить секвенирование и сборку больших геномов за меньшие ресурсы. Весь проект "Биогеном Земли" обойдется в сегодняшних долларах дешевле, чем проект "Геном человека", общая стоимость которого составила около 3 миллиардов долларов США.

В прошлом исследователям приходилось определять порядок четырех оснований химическим путем на миллионах крошечных фрагментов ДНК, а затем снова склеивать всю последовательность. Сегодня они могут регистрировать различные основания на основе их физических свойств или путем связывания каждого из четырех оснований с различным красителем. Новые методы секвенирования могут сканировать длинные молекулы ДНК, которые привязаны в крошечных трубках или продавлены через крошечные отверстия в мембране.

Но почему бы не сэкономить время и деньги, секвенировав только ключевые репрезентативные виды?

Дело в том, что весь смысл проекта "Биогеном Земли" заключается в том, чтобы использовать различия между видами для проведения сравнений.

Существует также страх упустить что-то новое. Например, если из 70 000 видов нематод мы изучим только 69 999, мы можем упустить тот, который раскроет секреты того, как нематоды могут вызывать заболевания у животных и растений.

В настоящее время над проектом "Биогеном Земли" работают 44 дочерних учреждения в 22 странах. Кроме того, существует 49 дочерних проектов, включая такие грандиозные проекты, как Калифорнийский проект геномики сохранения природы, проект "10 000 геномов птиц" и британский Дарвиновский проект "Древо жизни", а также множество проектов по отдельным группам, таким как летучие мыши и бабочки.

Источник: https://scitechdaily.com/monumental-project-underway-to-sequence-the-genome-of-every-complex-species-on-earth/

Антропологи определили районы, в которых наши древние предки скрещивались с неизвестными видами людей

Анализ и сравнение ДНК современных людей уже показал, что наши далекие предки, покинув Африку, встретились с другими видами людей — неандертальцами, денисовцами, — долгое время сосуществовали и даже скрещивались с ними. Особенно активно эти процессы развивались на островах Юго-Восточной Азии, где сохранились генетические следы скрещивания еще как минимум с двумя видами родственников, пока неизвестных.

Ученые из Университета Аделаиды сообщают об этом в статье, опубликованной в журнале PNAS. Алан Купер (Alan Cooper) и Жуан Тексейра (João Teixeira) провели анализ предыдущих работ в области генетики и палеоботаники, показав, что пути сапиенсов и неидентифицированных «вымерших гоминин № 1» пересеклись на юге Азии. Позднее состоялась встреча с «вымершими гомининами № 2» в районе Филиппин, Явы, Борнео и Суматры.

«Мы понимали, что история выхода из Африки не так проста, но она оказывается еще более запутанной, чем можно было ожидать, — говорит Жуан Тексейра. — Очевидно, островная Юго-Восточная Азия была населена несколькими архаичными группами людей, возможно, живших в изоляции друг от друга вплоть до прихода современного человека. Судя по времени, их появление быстро приводило к упадку архаичных популяций».

Источник: https://naked-science.ru/article/biology/antropologi-opredelili-rayony-v?utm_source=inarticle&utm_medium=inarticle&utm_campaign=inarticle

Фатьяновцы: вооружены и агрессивны
Археологи в Подмосковье вырыли топор войны

В декабре 2018 года подмосковная экспедиция Института археологии РАН проводила археологические исследования перед строительством частной школы в Истринском районе. В первых семи шурфах ничего не было найдено. Уже казалось, что в этом месте нет культурных слоев и можно смело приступать к строительству, но в последнем, восьмом шурфе были обнаружены остатки средневековой керамики, а в более раннем слое — каменные топоры эпохи средней бронзы. Четыре с половиной тысячи лет назад на этом месте был могильник, в котором были похоронены люди, принадлежащие к фатьяновской культуре — одной из самых редких археологических культур на территории Подмосковья.

«Мы получили настоящий подарок к 100-летию российской академической археологии, — говорит руководитель подмосковной археологической экспедиции Ася Энговатова. — С одной стороны, мы открыли редкий памятник: последний раз фатьяновский некрополь на территории Подмосковья находили четверть века назад. С другой стороны, мы получили не просто редкие находки — мы получили возможность исследовать их на принципиально новом научном уровне и по-новому взглянуть на историю заселения Волго-Окского междуречья и шире — всей территории Русской равнины».

Найти памятник фатьяновской культуры в Подмосковье — большая удача. Дело в том, что на раннем этапе носители этой культуры не возводили курганы: они хоронили покойников в глубоких могильных ямах, которые укрепляли деревянными плахами, лубом или берестой. На сегодняшний день археологи не располагают методикой и технологиями, способными определить точное местоположение таких могильников, и большинство некрополей могут быть найдены либо при проведении историко-культурной экспертизы перед строительством, либо непосредственно при проведении строительных работ.

Фатьяновские комплексы в Подмосковье являются самыми древними памятниками эпохи бронзы в регионе. Это редкая культура для наших мест: фатьяновские памятники составляют лишь 0,3% от всех археологических памятников Московской области. Всего на карте Подмосковья отмечено 15 могильников, 21 поселение и одна сезонная стоянка. Могильники располагаются в основном в долине Москвы-реки, Рузы и Истры, окрестностях Тростенского озера. Но на территории современной России ареал распространения памятников фатьяновской культуры охватывает довольно большую площадь: в нее входят Тверская, Ярославская, Ивановская, Костромская, Московская, Калужская, Смоленская, Владимирская, Новгородская области.

В свою очередь, фатьяновская культура вписана в более широкий контекст европейских археологических культур шнуровой керамики и боевых топоров и является их самым восточным ответвлением. Свое название эти культуры получили по традиции класть в мужские погребения боевые топоры и украшать керамику узорами, которые получались из оттисков веревок и шнуров на сырой глине. Они были распространены в Центральной и Восточной Европе, от современной Швеции на севере до Дуная и Карпат на юге и до Рейна на западе. Предполагается, что их носители были древними индоевропейцами, а появление этой культуры маркирует ту позднюю стадию индоевропейской общности, когда происходит распад на отдельные языки и культуры. Как полагают исследователи, фатьяновцы говорили на языке, относящемся к периоду германо-балто-славянского единства, но эту гипотезу невозможно проверить.

До сих пор неизвестно, почему в середине III тысячелетия до нашей эры часть представителей культур боевых топоров переместилась из Центральной и Северо-Восточной Европы в лесную зону Восточной Европы. Возможно, причиной миграции стали конфликты между группами и необходимость расширить свою территорию или природные катаклизмы. Так или иначе, представители культуры боевых топоров приходят на Русскую равнину, где в это время обитали племена волосовской культуры — рыболовы и собиратели.

Фатьяновцы, пришедшие на Русскую равнину, умели многое и были «крепкими хозяйственниками». Они стали первыми людьми на территории лесной зоны современной Европейской России, которые уже освоили производящее хозяйство и металлургию меди и бронзы. Они разводили скот, в основном свиней, коров и лошадей, на что указывают найденные многочисленные остатки костей и зубов этих животных. Они умели изготавливать молочные продукты, о чем свидетельствуют найденные на фатьяновских поселениях керамические сосуды с небольшими отверстиями, сделанными в сырой глине в придонной части. Такие сосуды могли использоваться для приготовления и хранения кисломолочных продуктов. Фатьяновцы знали земледелие. Об этом говорят найденные на днищах сосудов отпечатки зерен культурных злаков — ячменя или пшеницы. И, разумеется, они были хорошими охотниками.

Так, среди погребального инвентаря, найденного в могильнике «Павловская слобода», большую долю составляют кремневые наконечники копий и стрел.

В некрополе, получившем название «Павловская слобода», была найдена представительная коллекция прекрасно сохранившегося погребального инвентаря: два боевых каменных сверленых топора, три кремневых топора-клина, кремневые наконечники стрел и копий и погребальные керамические сосуды. Боевые топоры сделаны из габбро-диорита и представляют собой фактически копии металлических бронзовых топоров — настолько точные, что сымитировано даже выступающее ребро, которое образуется на топорах из металла в местах соприкосновения форм для литья.

Фатьяновское общество было уже социально неоднородным: судя по тому, как были организованы могильники, в нем выделялись люди с более высоким статусом, причем им могли обладать как мужчины, так и женщины, а также рядовые члены общества. В мужских погребениях, кроме каменных топоров, археологи находят топоры-тесла, наконечники стрел и копий, погребальные сосуды. Вероятно, в них была ритуальная пища, а также украшения из зубов диких зверей — медведей, кабанов, волков.

Фатьяновцев, вероятно, было трудно назвать мирным народом (если таковые вообще могли быть в эту эпоху). Прекрасны каменные топоры, которые были найдены в некрополе «Павловская слобода». Они были грозным оружием и предназначались только для боевых действий: ими проламывали голову врагу. Существует ряд работ как отечественных, так и европейских ученых, доказывающих, что проникновение фатьяновцев в восточные земли было фактически захватом территории. Именно поэтому воинам-мужчинам в могилу клали боевые топоры — этот обычай был призван подчеркнуть статус воина. Но есть и другой важный момент, связанный также с высоким уровнем агрессии общества культуры боевых топоров. Так, немецкий антрополог Курт Альт описал историю гибели целого поселения общности культуры боевых топоров на территории современной Германии. Здесь были убиты почти все жители, и убили их, скорее всего, соплеменники, конкурирующие с ними из-за недостатка места. Схожая находка была обнаружена в 2011 году на юге Польши, возле деревни Кошица: здесь было обнаружено массовое захоронение 15 человек, которые, по данным генетического анализа, оказались близкими родственниками, членами одной семьи. Основой причиной смерти, как показало исследование, были многочисленные удары по голове. Среди погребенных были останки только одного взрослого мужчины, остальными были женщины и дети. Как полагают исследователи, эта семья, которая относилась к общности культуры шаровидных амфор, была захвачена и убита в тот момент, когда основная часть мужчин отсутствовала (возможно, была на охоте). Вероятно, эти люди стали жертвами конкурирующих племен культуры шнуровой керамики, которые обитали в то же самое время в этих же местах. Не исключено, что такие «дружеские» отношения между различными группами внутри этой культуры и послужили причиной миграции в восточные регионы.

Археологи не находят большого количества следов военных конфликтов между фатьяновским и волосовским населением, но очевидно, что соседство не всегда было мирным. В могильнике фатьяновской культуры Николо-Перевоз на реке Дубне, который находится недалеко от открытого на Истре нового некрополя, было обнаружено захоронение фатьяновцев, у которых, как полагали исследователи, между позвоночными и реберными костями застряли наконечники волосовских стрел. Однако в связи с находками на памятнике «Павловская слобода» утверждение о том, что волосовские стрелы являлись орудием убийства фатьяновцев, может быть опровергнуто. Другие исследователи полагают, что волосовцы перенимали у фатьяновцев навыки ведения хозяйства и что отношения между племенами не были враждебными.

Существуют разные версии того, как складывалась дальнейшая судьба фатьяновцев.

По одной версии, это население было ассимилировано другими племенами, по другой (скорее фантастической) — фатьяновцы и волосовцы массово вымирали в результате обмена инфекционными заболеваниями, но пока все это лишь гипотезы, требующие дальнейших подтверждений.

Важность открытия некрополя «Павловская слобода» заключается в том, что находки из него дали ученым новые возможности. Предыдущие исследования на подмосковных памятниках по большей части были проведены в 50–60-х годах ХХ века, когда наука еще не располагала таким сложным и точным инструментарием, как радиоуглеродный анализ или исследование палео-ДНК. Сейчас ученые располагают только десятью датировками подмосковных памятников фатьяновской культуры, полученными методом радиоуглеродного датирования. На некрополе «Павловская слобода» были найдены фрагменты кости и зубной эмали, а также остатки деревянных погребальных конструкций. Современные методы археологического датирования по очень небольшим частицам остатков органики позволяют определить с точностью до 25 лет, когда жил этот человек или росло это дерево. Полученные данные ученые смогут сопоставить с европейской базой данных культур шнуровой керамики и боевых топоров и уточнить, какое место в этой общности занимала фатьяновская культура и когда ее представители начали движение в сторону Русской равнины. Исследование палео-ДНК, возможно, даст шанс определить место фатьяновцев в родстве с археологическими культурами Евразии.

Ася Энговатова: «Фатьяновская культура, несмотря на неплохую изученность, остается крайне загадочной. До сих пор нет точных датировок, непонятны ни ее отношения с сопредельными культурами, ни причины ее миграции на территории Русской равнины. Основная часть некрополей фатьяновской культуры на территории Подмосковья была найдена давно — в XIX и в первой половине ХХ века. Находки на памятнике „Павловская слобода“ позволят ученым на новом, современном научном уровне интерпретировать эту культуру и впервые точно датировать фатьяновский памятник на территории России».

Источник: https://elementy.ru/nauchno-populyarnaya_biblioteka/434730/Fatyanovtsy_vooruzheny_i_agressivny

В геномах жителей островов Юго-Восточной Азии нет иных примесей, кроме неандертальских и денисовских. Часть 1
#генетика_РА

Судя по археологическим данным, на островах Юго-Восточной Азии до прихода сапиенсов жили как минимум три вида древних людей: Homo erectus на Яве, H. floresiensis на Флоресе и H. luzonensis на Лусоне. Предки нынешних обитателей региона теоретически могли скрещиваться с кем-то из них. Международный коллектив генетиков попытался найти соответствующие «сверхархаичные» примеси в геномах местных аборигенов, но безуспешно. Зато подтвердилась повышенная доля денисовской ДНК в геномах коренных филиппинцев и жителей островов Индонезии к востоку от линии Уоллеса. При этом археологических следов присутствия денисовцев в регионе пока не найдено. Генетические и археологические данные было бы легче всего примирить друг с другом, если бы оказалось, что H. floresiensis и H. luzonensis — это потомки денисовцев, некогда приплывших на острова и сильно изменившихся в условиях островной изоляции.

Впрочем, столь смелая гипотеза вряд ли найдет поддержку у антропологов.

Палеогенетики к настоящему времени разработали целый арсенал методов поиска в современных человеческих геномах так называемых «архаичных» примесей. Термин крайне неудачен, потому что неандертальцы и денисовцы, оставившие эти примеси в наших геномах, жили одновременно с сапиенсами, с которыми скрещивались, и на тот момент не были «архаичнее» их ни в каком разумном смысле. Разве что в смысле культурного развития, но и это — только гипотеза (да и то какая-то слишком сапиентоцентричная). Тем не менее, термин прижился. Если же речь идет о генетических следах скрещивания с людьми, отделившимися от предков сапиенсов раньше, чем неандертальцы и денисовцы (то есть раньше, чем 500–700 тысяч лет назад), то такие примеси называют «сверхархаичными».

«Сверхархаичные» примеси, указывающие на гибридизацию с азиатскими эректусами или другими рано обособившимися человеческими популяциями, найдены в геномах неандертальцев и денисовцев (см.: Предки неандертальцев и денисовцев скрещивались с потомками древних евразийских эректусов, «Элементы», 25.02.2020).

В геномах современных людей недавно удалось найти «сверхархаичные» фрагменты, которые попали к нам окольным путем — в составе денисовских кусочков ДНК (M. J. Hubisz et al., 2020. Mapping gene flow between ancient hominins through demography-aware inference of the ancestral recombination graph). Это был ожидаемый результат, раз уж в современных геномах есть денисовские фрагменты, а у денисовцев была «сверхархаичная» примесь.

Есть ли в современных геномах «сверхархаичные» примеси, полученные напрямую, без денисовских и неандертальских посредников? Ведь по идее, если предки денисовцев и неандертальцев скрещивались с азиатскими эректусами и им подобными, то могли это делать и сапиенсы.

Внятного ответа пока нет, вопрос остается спорным. Например, в геномах аборигенов Андаманских островов вроде бы нашлись «сверхархаичные» примеси (M. Mondal et al., 2016. Genomic analysis of Andamanese provides insights into ancient human migration into Asia and adaptation). Но этот результат был очень жестко оспорен группой ведущих специалистов во главе с Дэвидом Райхом (P. Skoglund et al., 2018. No evidence for unknown archaic ancestry in South Asia).

Рис. 1. Распределение денисовских примесей у современных жителей Юго-Восточной Азии, Уоллесии и Сахула. Круговые диаграммы показывают долю денисовской ДНК в разных популяциях по сравнению с аборигенами Австралии и Новой Гвинеи, у которых эта доля максимальна. Видно, что в азиатских материковых популяциях (включая острова, соединявшиеся с материком во время оледенений) денисовская примесь невелика. Намного больше денисовской ДНК у обитателей островов, расположенных между линиями Уоллеса и Лидеккера. Эти острова в прошлом не соединялись ни с Сундой, ни с Сахулом. На карте отмечены следы присутствия древних людей, населявших эти края до прихода сапиенсов: каменные орудия и кости Homo floresiensis на острове Флорес и H. luzonensis на острове Лусон. Изображения буйволов и комодского варана символизируют представителей островной мегафауны, которым удалось уцелеть после прихода сапиенсов, хотя сапиенсам вообще-то свойственно быстро истреблять крупных животных на новооткрытых островах. Но в данном случае крупные животные, возможно, успели заранее приспособиться к повадкам двуногих хищников. На карте показана береговая линия при уровне моря на 50 м ниже современного. Примерно такой она была во время прихода сапиенсов около 50 тысяч лет назад. «Линия Уоллеса» на карте — это на самом деле комбинация линий Уоллеса и Гексли. До островов к востоку от нее можно было добраться только по морю. Рисунок из обсуждаемой статьи в Nature Ecology & Evolution

Острова Юго-Восточной Азии — один из перспективных регионов в плане поиска «сверхархаичных» примесей. Ведь сапиенсы, пришедшие сюда более 50 тысяч лет назад, могли встретиться как минимум с двумя рано отделившимися человеческими популяциями.

Это, во-первых, флоресские хоббиты Homo floresiensis (см.: Новые древние остатки людей с острова Флорес говорят о родстве «хоббитов» с эректусами, «Элементы», 08.06.2016). Хоббиты жили на Флоресе 60–90 тысяч лет назад. Во-вторых, это недавно открытые лусонские люди Homo luzonensis, жившие на Лусоне 50–67 тысяч лет назад (см.: Древних людей с острова Лусон отнесли к новому виду, «Элементы», 15.04.2019). Флорес и Лусон лежат к востоку от линий Уоллеса и Гексли (рис. 1). Это значит, что они всегда были отделены от Азии морскими проливами.

Кроме того, на Яве, которая в периоды оледенений соединялась с Азией, жили поздние Homo erectus. Но они, похоже, вымерли, не дождавшись прихода сапиенсов. Самые поздние следы их присутствия, по современным датировкам, имеют возраст 117–108 тысяч лет. Скорее всего, сапиенсов на Яве тогда еще не было (см.: Происхождение человечества в свете новых данных палеоантропологии и генетики, «Элементы», 15.02.2021).

Статья большого коллектива генетиков и антропологов из Австралии, Индонезии, Великобритании и Новой Зеландии, опубликованная в журнале Nature Ecology & Evolution, рассказывает о самой серьезной на сегодняшний день попытке найти «сверхархаичные» примеси в современных геномах.

Авторы проанализировали 426 геномов со всего мира, включая 214 геномов жителей островов Юго-Восточной Азии и Новой Гвинеи. Для поиска «архаичных» и «сверхархаичных» фрагментов ДНК применялись три независимых метода. Два из них нацелены на поиск примесей, полученных предками современных людей от древних популяций, по которым есть палеогенетические данные (например, от неандертальцев и денисовцев). Первый метод, HMM, основан на скрытых марковских моделях и описан в статье A. Seguin-Orlando et al., 2014. Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years. Второй метод, ChromoPainter (CP), описан в статье D. J. Lawson et al., 2012. Inference of population structure using dense haplotype data.

Третий метод, HMMarchaic, отличается от первых двух тем, что он не использует конкретные древние геномы в качестве образца для поиска. Поэтому его можно применять для выявления фрагментов ДНК, полученных предками изучаемых индивидов от популяций, по которым у нас нет никаких палеогенетических данных. Например, от хоббитов, азиатских эректусов или каких-то вовсе неизвестных гоминид. О таких методах «Элементы» уже рассказывали (см.: Предки китайцев и японцев скрещивались с двумя разными популяциями денисовцев, «Элементы», 19.03.2018; Предки неандертальцев и денисовцев скрещивались с потомками древних евразийских эректусов, «Элементы», 25.02.2020). Метод HMMarchaic описан в статье L. Skov et al., 2018. Detecting archaic introgression using an unadmixed outgroup.

Сначала авторы нашли в 426 геномах «архаичные» и «сверхархаичные» фрагменты ДНК при помощи метода HMMarchaic. Затем при помощи методов HMM и CP в тех же геномах были найдены неандертальские и денисовские фрагменты. Идея была в том, чтобы из примесей, найденных методом HMMarchaic (который, напомним, «не знает», чьи именно это примеси), вычесть всё, что будет найдено методами HMM и CP, то есть кусочки ДНК неандертальского и денисовского происхождения. Если бы после этого среди находок HMMarchaic осталось что-то существенное, то можно было бы говорить о гибридизации сапиенсов с какими-то древними людьми, не родственными неандертальцам и денисовцам.

Источник: https://elementy.ru/novosti_nauki/433796/V_genomakh_zhiteley_ostrovov_Yugo_Vostochnoy_Azii_net_inykh_primesey_krome_neandertalskikh_i_denisovskikh