А как насчёт кожи, создаваемой в лаборатории, (http://www.modernmeadow.com/our-technology/, http://www.fastcoexist.com/3061337/world-changing-ideas/real-leather-grown-in-a-lab-is-moving-closer-to-you-closet, https://science.dirty.ru/innovatsii-v-kozhevennom-proizvodstve-1127445/) и робота с крысиными кардиомиоцитами (http://science.sciencemag.org/content/353/6295/158)? XXI век всё-таки.
Modern Meadow
Our Technology - Modern Meadow
Biofabrication is Modern Meadow’s way of building with biology—a means for making materials inspired by nature and grown of life’s essential elements.
Работа из лаборатории Джорджа Чёрча интересна с точки зрения потециальных возможностей синтетической биологии.
А когда генетический код сделают неизбыточным, можно будет создавать штаммы, использующие нестандартные аминокислоты, закодированные у них в геноме.
http://science.sciencemag.org/content/353/6301/819
А когда генетический код сделают неизбыточным, можно будет создавать штаммы, использующие нестандартные аминокислоты, закодированные у них в геноме.
http://science.sciencemag.org/content/353/6301/819
Science
Design, synthesis, and testing toward a 57-codon genome
By recoding bacterial genomes, it is possible to create organisms that can potentially synthesize products not commonly found in nature. By systematic replacement of seven codons with synonymous alternatives for all protein-coding genes, Ostrov et al. recoded…
Немного небольших новостей:
- Эффект некоторых ингибиторов HDAC (деацетилаз гистонов) напоминает эффект от физических упражнений.
В Quartz: http://qz.com/783958/scientists-have-created-a-drug-that-replicates-the-health-benefits-of-exercise/
В Cell Reports (PDF): http://www.cell.com/cell-reports/pdf/S2211-1247(16)31051-8.pdf
- То, насколько оптимально подобраны кодоны в геноме (codon usage bias и вот это всё), определяет селективную трансляцию мРНК при недостатке аминокислот.
В RNA: http://rnajournal.cshlp.org/content/early/2016/09/09/rna.058180.116.short
- Обзор по динамике развития клеток зародышевой линии (germline) <человека и мыши> и эпигенетическим изменениям в них.
В Nature: http://www.nature.com/nrg/journal/v17/n10/full/nrg.2016.88.html
- Эффект некоторых ингибиторов HDAC (деацетилаз гистонов) напоминает эффект от физических упражнений.
В Quartz: http://qz.com/783958/scientists-have-created-a-drug-that-replicates-the-health-benefits-of-exercise/
В Cell Reports (PDF): http://www.cell.com/cell-reports/pdf/S2211-1247(16)31051-8.pdf
- То, насколько оптимально подобраны кодоны в геноме (codon usage bias и вот это всё), определяет селективную трансляцию мРНК при недостатке аминокислот.
В RNA: http://rnajournal.cshlp.org/content/early/2016/09/09/rna.058180.116.short
- Обзор по динамике развития клеток зародышевой линии (germline) <человека и мыши> и эпигенетическим изменениям в них.
В Nature: http://www.nature.com/nrg/journal/v17/n10/full/nrg.2016.88.html
Quartz
Scientists have created a drug that replicates the health benefits of exercise
Researchers have made the breakthrough of couch potatoes’ dreams.
- Статья про тихоходок Ramazzottius varieornatus в Nature Communications: http://www.nature.com/articles/ncomms12808 (http://www.nature.com/articles/ncomms12808.pdf). На The Verge в честь этого опубликовали соответствующий материал: http://www.theverge.com/2016/9/20/12990274/tardigrade-extreme-water-bears-genome-sequence.
- Очередная статья про FoldIt. И тоже в Nature Communications: http://www.nature.com/articles/ncomms12549 (http://www.nature.com/articles/ncomms12549.pdf). Заметку об этом написали в Engadget: https://www.engadget.com/2016/09/19/gamers-beat-scientists-to-protein-discovery/.
- Очередная статья про FoldIt. И тоже в Nature Communications: http://www.nature.com/articles/ncomms12549 (http://www.nature.com/articles/ncomms12549.pdf). Заметку об этом написали в Engadget: https://www.engadget.com/2016/09/19/gamers-beat-scientists-to-protein-discovery/.
Nature
Extremotolerant tardigrade genome and improved radiotolerance of human cultured cells by tardigrade-unique protein
Nature Communications - Tardigrades are resistant to extreme environmental conditions including dehydration, radiation and the vacuum of space. Here the authors present a high-quality genome which...
Side note: о канцерогенности EtBr (спойлер: всё ок).
http://blogs.sciencemag.org/pipeline/archives/2016/04/18/the-myth-of-ethidium-bromide
http://blogs.sciencemag.org/pipeline/archives/2016/04/18/the-myth-of-ethidium-bromide
Science
The Myth of Ethidium Bromide
Ethidium bromide is found in pretty much every molecular biology lab around. Ask most biologists about handling it, and you're get a fearful expression and advice to use gloves, etc. That's because the compound is used to make DNA fluoresce when running gels…
Посмотрим, про что пишут в последнее время.
Заметки:
- Совет по биоэтике в Лондоне в своём 130-страничном отчёте заявил, что применение технологий редактирования генома на человеческих эмприонах и на домашнем скоте требует дальнейшего рассмотрения (http://www.nature.com/news/uk-bioethicists-eye-designer-babies-and-crispr-cows-1.20713).
- Ёсинори Осуми, который в 2012 году получил $626,000 в юанях за свои работы по аутофагии, на этот раз получил $940,000 в кронах (http://www.nature.com/news/medicine-nobel-for-research-on-how-cells-eat-themselves-1.20721).
- О том, как GitHub связан с развитием науки, (http://www.nature.com/news/democratic-databases-science-on-github-1.20719) с примерами по-настоящему открытых данных (https://github.com/cmrivers/ebola).
- Презентация программы по покорению Марса вызвала много дискуссий. В публикации The Verge, например, есть интересная мысль: есть много биологических проблем, которые предстоить решить человечеству на пути к multi-planet species (http://www.theverge.com/2016/9/28/13086980/spacex-elon-musk-mars-plan-problems-breathing-radiation-death).
Заметки:
- Совет по биоэтике в Лондоне в своём 130-страничном отчёте заявил, что применение технологий редактирования генома на человеческих эмприонах и на домашнем скоте требует дальнейшего рассмотрения (http://www.nature.com/news/uk-bioethicists-eye-designer-babies-and-crispr-cows-1.20713).
- Ёсинори Осуми, который в 2012 году получил $626,000 в юанях за свои работы по аутофагии, на этот раз получил $940,000 в кронах (http://www.nature.com/news/medicine-nobel-for-research-on-how-cells-eat-themselves-1.20721).
- О том, как GitHub связан с развитием науки, (http://www.nature.com/news/democratic-databases-science-on-github-1.20719) с примерами по-настоящему открытых данных (https://github.com/cmrivers/ebola).
- Презентация программы по покорению Марса вызвала много дискуссий. В публикации The Verge, например, есть интересная мысль: есть много биологических проблем, которые предстоить решить человечеству на пути к multi-planet species (http://www.theverge.com/2016/9/28/13086980/spacex-elon-musk-mars-plan-problems-breathing-radiation-death).
Nature News & Comment
UK bioethicists eye designer babies and CRISPR cows
Panel will focus on the implications of gene editing in human reproduction and livestock.
В последнее время кругом много нейрофизиологии. Вот в последнем Nature про сон (http://www.nature.com/nature/journal/v538/n7623/full/nature19773.html), пластичность сенсорных путей (http://www.nature.com/nature/journal/v538/n7623/full/nature19770.html), BDNF (http://www.nature.com/nature/journal/v538/n7623/full/nature19766.html) и ещё раз про BDNF (http://www.nature.com/nature/journal/v538/n7623/full/nature19784.html).
А у последнего выпуска Science очень интересная тематика: Genes & Environment.
Вот некоторые обзоры:
- A review of recent human adaptation (http://science.sciencemag.org/content/354/6308/54)
- Models and mechanisms of non–DNA sequence–based inheritance (http://science.sciencemag.org/content/354/6308/59)
- Genomic dissection of the effect of cellular environment on immune response (http://science.sciencemag.org/content/354/6308/64)
Вот некоторые обзоры:
- A review of recent human adaptation (http://science.sciencemag.org/content/354/6308/54)
- Models and mechanisms of non–DNA sequence–based inheritance (http://science.sciencemag.org/content/354/6308/59)
- Genomic dissection of the effect of cellular environment on immune response (http://science.sciencemag.org/content/354/6308/64)
Science
Going global by adapting local: A review of recent human adaptation
The spread of modern humans across the globe has led to genetic adaptations to diverse local environments. Recent developments in genomic technologies, statistical analyses, and expanded sampled populations have led to improved identification and fine-mapping…
Статья в Nature от DeepMind:
- http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature20101.html
- https://deepmind.com/blog/differentiable-neural-computers/
- https://news.ycombinator.com/item?id=12694779
- https://news.ycombinator.com/item?id=12698872
- http://www.readcube.com/articles/10.1038/nature20101?shared_access_token=3UerOr1f0fy3oL_CytWdxtRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0MggmpDmwljGswxVdeocYSujsARxGW1q2qxK0cTqi1Bup-nSH200cGUW_ET9MIG_6rvvXTcoxOnAX6B4E8dQs4FQ-yScxXe8EB0XnzqbUw3Qw%3D%3D
- http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature20101.html
- https://deepmind.com/blog/differentiable-neural-computers/
- https://news.ycombinator.com/item?id=12694779
- https://news.ycombinator.com/item?id=12698872
- http://www.readcube.com/articles/10.1038/nature20101?shared_access_token=3UerOr1f0fy3oL_CytWdxtRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0MggmpDmwljGswxVdeocYSujsARxGW1q2qxK0cTqi1Bup-nSH200cGUW_ET9MIG_6rvvXTcoxOnAX6B4E8dQs4FQ-yScxXe8EB0XnzqbUw3Qw%3D%3D
Deepmind
Differentiable neural computers
In a recent study in Nature, we introduce a form of memory-augmented neural network called a differentiable neural computer, and show that it can learn to use its memory to answer questions about complex, structured data, including artificially generated…
23andMe не стали делать ставку на NGS: https://www.buzzfeed.com/stephaniemlee/23andme-anne-wojcicki-next-generation-sequencing
BuzzFeed
23andMe Has Abandoned The Genetic Testing Tech Its Competition Is Banking On
Genetics startup 23andMe has let go of a team of scientists and a top executive as it has stopped pursuing one of the biggest technological advancements in DNA testing, BuzzFeed News has learned.
Интересная история «Brain implants allow paralysed monkeys to walk» и, как всегда, интересное обсуждение:
- http://www.nature.com/news/brain-implants-allow-paralysed-monkeys-to-walk-1.20967
- https://www.reddit.com/r/science/comments/5c2ljz/brain_implant_device_enables_paralyzed_monkeys/d9trzrr/
- https://news.ycombinator.com/item?id=12930811
- http://www.nature.com/news/brain-implants-allow-paralysed-monkeys-to-walk-1.20967
- https://www.reddit.com/r/science/comments/5c2ljz/brain_implant_device_enables_paralyzed_monkeys/d9trzrr/
- https://news.ycombinator.com/item?id=12930811
Nature
Brain implants allow paralysed monkeys to walk
Nature - Swiss researchers travel to China to conduct pioneering experiment.
Про лингвистические структуры в Nature Neuroscience.
http://www.nature.com/neuro/journal/v19/n1/full/nn.4186.html
http://www.nature.com/neuro/journal/v19/n1/full/nn.4186.html
О том, что с гендерной идентификацией у воробьёв всё сложно.
http://www.nature.com/news/the-sparrow-with-four-sexes-1.21018
http://www.nature.com/news/the-sparrow-with-four-sexes-1.21018
Nature News & Comment
The sparrow with four sexes
Elaina Tuttle spent her life trying to understand the bizarre chromosome evolution of a common bird — until tragedy struck.
http://biorxiv.org/content/early/2016/08/02/055541
Название захватывающее:
A reference dataset of 5.4 million phased human variants validated by genetic inheritance from sequencing a three-generation 17-member pedigree
Название захватывающее:
A reference dataset of 5.4 million phased human variants validated by genetic inheritance from sequencing a three-generation 17-member pedigree
bioRxiv
A reference dataset of 5.4 million phased human variants validated by genetic inheritance from sequencing a three-generation 17…
Improvement of variant calling in next-generation sequence data requires a comprehensive, genome-wide catalogue of high-confidence variants called in a set of genomes for use as a benchmark. We generated deep, whole-genome sequence data of seventeen individuals…
Отличная небольшая подборка про то, какие яды животных используются в качестве лекарств. Побольше бы подобных материалов!
https://mosaicscience.com/extra/medical-menagerie-gallery-venomous-creatures
https://mosaicscience.com/extra/medical-menagerie-gallery-venomous-creatures
Wellcome
Mosaic has now closed | Wellcome
Wellcome's digital platform dedicated to long-form journalism about science and health, has now closed.
Очаровательно: сказки, которые вдохновляют заниматься наукой. От редакторов Nature.
http://www.nature.com/nature/journal/v540/n7632/full/540194a.html
(А вот перевод на русский большинства из этих книг, кажется, отсутствует.)
http://www.nature.com/nature/journal/v540/n7632/full/540194a.html
(А вот перевод на русский большинства из этих книг, кажется, отсутствует.)
Nature
Tales of wonder : Nature : Nature Research
A bedtime story can ignite a lifelong love of science. Nature editors riffle through shelves and memories for favourites old and new.