Google Brain Team обупликовала в бложике краткий обзор исследований за 2017 год.
И выглядит это более чем впечатляюще.
Часть 1: https://research.googleblog.com/2018/01/the-google-brain-team-looking-back-on.html
Часть 2: https://research.googleblog.com/2018/01/the-google-brain-team-looking-back-on_12.html
В области здравоохранения, конечно же, упомянули сетки, натренированные распознавать на фотографиях опухоль.
https://research.googleblog.com/2017/03/assisting-pathologists-in-detecting.html
И выглядит это более чем впечатляюще.
Часть 1: https://research.googleblog.com/2018/01/the-google-brain-team-looking-back-on.html
Часть 2: https://research.googleblog.com/2018/01/the-google-brain-team-looking-back-on_12.html
В области здравоохранения, конечно же, упомянули сетки, натренированные распознавать на фотографиях опухоль.
https://research.googleblog.com/2017/03/assisting-pathologists-in-detecting.html
Research Blog
The Google Brain Team — Looking Back on 2017 (Part 1 of 2)
Posted by Jeff Dean, Google Senior Fellow, on behalf of the entire Google Brain Team The Google Brain team works to advance the state of ...
Другое близкое к современной биологии направление исследований — drug discovery.
Про это подробнее тут https://research.googleblog.com/2017/04/predicting-properties-of-molecules-with.html.
Про это подробнее тут https://research.googleblog.com/2017/04/predicting-properties-of-molecules-with.html.
Research Blog
Predicting Properties of Molecules with Machine Learning
Posted by George Dahl, Research Scientist, Google Brain Team Recently there have been many exciting applications of machine learning (ML) ...
Маленький шаг: магазин будущего от Amazon открыли для всех.
Пока что будущее наступило только в Сиэтле.
https://thenextweb.com/us/2018/01/22/amazons-cashier-less-grocery-store-opens-to-the-public-today/
Пока что будущее наступило только в Сиэтле.
https://thenextweb.com/us/2018/01/22/amazons-cashier-less-grocery-store-opens-to-the-public-today/
The Next Web
Amazon’s cashier-less grocery store opens to the public today
Amazon is throwing open the doors to its first cashier-less grocery store, dubbed Amazon Go, in Seattle on Monday, January 22.
“People told us we should have waited to publish until we knew what they did. Now I’m like, dude, it took 14 years to figure this out”.
https://www.nature.com/articles/d41586-018-00920-x
https://doi.org/10.1016/j.cell.2017.12.017
https://www.nature.com/articles/d41586-018-00920-x
https://doi.org/10.1016/j.cell.2017.12.017
Nature
‘Dark matter’ DNA influences brain development
'Dark matter' DNA influences brain development in mice
Одна из особенных, интересных заметок об истории молекулярной биологии и её развитии в Европе.
EMBL
Molecular biology as a force for peace | EMBL
Historian Soraya de Chadarevian explores how EMBL’s first Director General John Kendrew shaped molecular biology
Forwarded from завали ебальничек
Глобальное потепление заставляет голодать белых медведей, потому что таяние льдов затрудняет доступ к их основной пище: тюлешам. Чтобы поддерживать вес, здоровье и быть красивыми пупсиками, медведям необходимо потреблять около 12 000 калорий в день. Для этого нужно каждый 10-12 дней съедать взрослого тюленя или 220 увесистых бигмаков, но с последними на Северной полюсе, очевидно, есть проблемы. Теперь там всё сложнее найти и вкусного жирного ластоногого — им стало намного проще прятаться. Нырк в воду и нет тюленя, а в море он чувствует себя, ну... как тюлень в воде.
Ученые из США и Канады в течение трех лет следили за девятью белыми медведицами, нацепив на животных ошейники с GPS и видеокамерами, а также каждую весну брали у них кровь для анализа, что позволило оценить метаболизм хищников. Оказалось, что они тратят калории быстрее, чем считалось ранее, а для поиска пищи медведям приходится проходить всё большую дистанцию. Половине самок не удавалось часто ловить хитрых тюленей, отчего 4 из них потеряли не меньше 10% веса (он составляет около 350 кг). Если всё так пойдет и дальше, белым мишкам придется прикладывать еще больше усилий для поиска пищи, что ставит под угрозу само существование вида.
http://science.sciencemag.org/content/359/6375/568
Ученые из США и Канады в течение трех лет следили за девятью белыми медведицами, нацепив на животных ошейники с GPS и видеокамерами, а также каждую весну брали у них кровь для анализа, что позволило оценить метаболизм хищников. Оказалось, что они тратят калории быстрее, чем считалось ранее, а для поиска пищи медведям приходится проходить всё большую дистанцию. Половине самок не удавалось часто ловить хитрых тюленей, отчего 4 из них потеряли не меньше 10% веса (он составляет около 350 кг). Если всё так пойдет и дальше, белым мишкам придется прикладывать еще больше усилий для поиска пищи, что ставит под угрозу само существование вида.
http://science.sciencemag.org/content/359/6375/568
Science
High-energy, high-fat lifestyle challenges an Arctic apex predator, the polar bear
Polar bears appear to be well adapted to the extreme conditions of their Arctic habitat. Pagano et al. , however, show that the energy balance in this harsh environment is narrower than we might expect (see the Perspective by Whiteman). They monitored the…
Структура H3K9me3 с гетерохроматиновым белком HP1: статья в Molecular Cell, пресс-релиз от OIST.
Cryo-EM FTW!
Cryo-EM FTW!
Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University OIST
The Nanoscopic Structure that Locks Up Our Genes
For decades, scientists could only speculate about the shape of heterochromatin.
Forwarded from завали ебальничек
Российские ученые выяснили, о чем на самом деле говорят линии на руках приматов — те самые, по которым хироманты «предсказывают» судьбу. Мэллин Новикова из МГУ и Александр Кузнецов из Палеонтологического института РАН исследовали ладошки южноамериканских обезьян. Биологи подошли к хиромантии научно и изучили линии жизни, судьбы, сердца, головы и т. д. Встретит ли в этом сезоне мартышка свою любовь, предсказать с их помощью довольно проблематично, но оказалось, что по характерным складкам можно буквально читать эволюционный сценарий, по которому происходило совершенствование хватательной функции. К примеру, линия жизни, связанная с обособлением большого пальца, является самой древней и есть у всех обезьян. Продольные складки также появились в начале эволюции приматов — они есть и у лемуров, и у мартышек, и у некоторых обезьян Старого Света. Позже из-за развития функции силового прижимания объектов к ладони тремя или четырьмя пальцами стали формироваться поперечные линии. Линия сердца появилась у южноамериканских обезьян и человека независимо друг от друга, а вот линия головы есть только у человека.
Исследование было опубликовано в новом номере научного журнала СПбГУ Biological Communications.
https://biocomm.spbu.ru/article/view/75
Исследование было опубликовано в новом номере научного журнала СПбГУ Biological Communications.
https://biocomm.spbu.ru/article/view/75
biocomm.spbu.ru
Biological Communications
Biological Communications is a rebranded new title of the former journal «Vestnik of Saint Petersburg University. Series 3. Biology». Biological Communications publishes research in all areas of the biological sciences from classical disciplines botany and…
Интересная статья из Nature Neuroscience про транскриптомы клеток зрительной коры. Мышек держали в темноте неделю, а затем включали свет на час или на четыре часа, после чего секвенировали транскриптомы клеток зрительной коры. Интересующей исследователей особенностью зрительной коры была активация генов раннего ответа (early-response genes, ERG). Но в биологии просто никогда не бывает: так, чтобы сохранить подобное in vivo состояние, при пробоподготовке добавляли коктель из ингибиторов (активности нейронов, кальциевых каналов, транскрипции, трансляции).
Любопытно, что стимуляция светом вызвала транскрипционный ответ не только в нейронах, но и клетках эндотелия, гладкомышечных клетках, астроцитах, перицитах и макрофагах.
Датасет состоит из 47209 клеток, в среднем 3234 транскриптов на клетку. Всего 8 типов (и 30 подтипов) клеток. Данные доступны в GEO, а экспрессию отдельных генов можно посмотреть на сайте лаборатории.
Любопытно, что стимуляция светом вызвала транскрипционный ответ не только в нейронах, но и клетках эндотелия, гладкомышечных клетках, астроцитах, перицитах и макрофагах.
Датасет состоит из 47209 клеток, в среднем 3234 транскриптов на клетку. Всего 8 типов (и 30 подтипов) клеток. Данные доступны в GEO, а экспрессию отдельных генов можно посмотреть на сайте лаборатории.
Nature
Single-cell analysis of experience-dependent transcriptomic states in the mouse visual cortex
Nature Neuroscience - Using single-cell RNA-sequencing, the authors record snapshots of the dynamic sensory-experience-dependent transcriptome across all cell types of the visual cortex in mice...
Не менее интересен геном планарии Schmidtea mediterranea.
Забавно, что в статье есть фотографии эппендорфа (спойлер: при выделении ДНК авторы дополнительно избавлялись от пигмента).
Забавно, что в статье есть фотографии эппендорфа (спойлер: при выделении ДНК авторы дополнительно избавлялись от пигмента).
Nature
The genome of Schmidtea mediterranea and the evolution of core cellular mechanisms
The flatworm Schmidtea mediterranea is an important model for regeneration. Jochen Rink, Eugene Myers and colleagues report an improved genome assembly for the planarian S. mediterranea using long-read sequencing and a new genome assembler called MARVEL.…
Forwarded from The Batrachospermum Magazine via @like
Что это за карапуз преклонил колено перед сестрой Катериной, держа в руках горшок с растеньем? Это Чарли Дарвин, у которого сегодня день рожденья! 🎈
Несколько разработок в области бионики и протезов.
Конечно же, без AI и Darpa не обходится.
https://www.wired.com/story/ai-is-fueling-smarter-prosthetics-than-ever-before/
Конечно же, без AI и Darpa не обходится.
https://www.wired.com/story/ai-is-fueling-smarter-prosthetics-than-ever-before/
WIRED
AI Is Fueling Smarter Prosthetics Than Ever Before
Thanks to advances in batteries, brain-controlled robotics, and AI, today’s mechanical limbs can do everything from twist and point to grab and lift.
Forwarded from addmeto
Гугл ресерч отчитались, что проводят исследования по определению сердечных заболеваний по снимку сетчатки. Тема, безусловно, важная и интересная, но пока малопродуктивная - очень уж пока низкая точность. Причем причина низкой точности тоже понятна - недостаток данных.
Вот скажем цифра: нынешняя их система может отличить сетчатку курильщика от некурильщика с точностью 71%. Т.е. ошибается она в 3 из 10 случаев, что для медицинского применения очень много. Более того, я уверен что на самом деле они отличают не курилищьика, а человека который недавно употребил никотин. Разница этих сущностей, как вы понимаете, довольно большая.
Но все равно очень круто, что они этим занялись - в теме анализа изображений с помощью ИИ очень много потенциальных открытий, работа с сетчаткой это как раз одна из таких областей. https://research.googleblog.com/2018/02/assessing-cardiovascular-risk-factors.html
Вот скажем цифра: нынешняя их система может отличить сетчатку курильщика от некурильщика с точностью 71%. Т.е. ошибается она в 3 из 10 случаев, что для медицинского применения очень много. Более того, я уверен что на самом деле они отличают не курилищьика, а человека который недавно употребил никотин. Разница этих сущностей, как вы понимаете, довольно большая.
Но все равно очень круто, что они этим занялись - в теме анализа изображений с помощью ИИ очень много потенциальных открытий, работа с сетчаткой это как раз одна из таких областей. https://research.googleblog.com/2018/02/assessing-cardiovascular-risk-factors.html
Googleblog
Assessing Cardiovascular Risk Factors with Computer Vision