и тебя отсеквенируем
33 subscribers
80 photos
3 videos
14 files
237 links
Журнальный клуб по современной биологии.

https://tttttt.me/compbio?boost

Про single cell, геномику, биоинформатику и не только.
Download Telegram
Science продолжает радовать своими Special Issues. На этот раз это современная нейробиология, и в нескольких статьях освещены те вопросы, на которые мы не первое десятилетие пытаемся найти ответы.
Channel name was changed to «CompBio»
Чтобы отправздновать двадцатипятилетие Wellcome Trust Sanger Institute, отсеквенируют 25 видов животных.
Вот как нужно отмечать юбилеи!

http://www.sanger.ac.uk/news/view/25-species-revealed-25-genomes-project

http://www.sanger.ac.uk/science/collaboration/25-genomes-25-years
Forwarded from addmeto
Невероятно интересный лонгрид про применение систем ИИ к здравоохранению и вообще к теме персонального здоровья. Не буду коментировать, обязательно прочитайте если вам интересна тема здоровья, медицины, ИИ и (что тоже важно) государственного регулирования совмещения этих тем.

По сути это статья, показывающая как из фейла одного интересного проекта в этой области человечество может извлечь много плюсов. Но читайте сами. Если не в состоянии - прочитайте хотяб конклюжн.

https://link.springer.com/article/10.1007/s12553-017-0179-1
Потрясающая статья в Scientific American под названием «In Silico Flurries: Computing a world of snowflakes».

https://blogs.scientificamerican.com/sa-visual/in-silico-flurries/
Тут даже сделали браузер по снежинкам: http://mkweb.bcgsc.ca/snowflakes/
И это, если вы не заметили, от Martin'а Krzywinski — автора Circos и Hive Plot.
Под конец года в Nature Reviews Genetics опубликовали заметку про новый метод в spatial single-cell transcriptomics.
Интерес в spatial transcriptomics состоит в том, чтобы сохранять информацию о положении каждой клетки в пространстве.
Авторы NICHE-seq совместили в новом методе двухфотонную микроскопию, флуоресцентные репортёры, flow cytometry и scRNA-seq и показали, что с помощью него можно изучать субпопуляции, например, имунных клеток.

Заголовок Single-cell transcriptomes in space немного смущает правда (в космосе? в пространстве?).

Заметка в Nature | Статья в Science | Обзор Nature Reviews Genetics по теме