molecular porn
316 subscribers
154 photos
118 videos
1 file
54 links
сублимирую тоску по тихому океану в структурную биоинформатику, научную иллюстрацию и разработку лекарств
Download Telegram
#sciart

Two sets of segregated chromatids during telophase are depicted as cats cuddled up comfortably beside spindle poles.

наткнулась на чудеснейшие иллюстрации к обложкам не очень популярного журнала Gene to Cells (Molecular Biology Society of Japan). С 2011 года все каверы выполнены в духе japanese-style painting (направление называется укиё-э, если не ошибаюсь).
#learn #ml
Материалы по машинному обучению 🚗📚

▫️Курсы/лекции

- https://mlcourse.ai/ - an open Machine Learning course by OpenDataScience
- https://sebastianraschka.com/resources/
- https://github.com/ugapanyuk/ml_course/wiki/COURSE_MMO

▫️Обзоры статей

- https://xn--r1a.website/gonzo_ML
- https://xn--r1a.website/loss_function_porn

▫️etc

- Homemade Machine Learning - воспроизведение алгоритмов ML с нуля, без библиотек, для лучшего понимания их работы.
- https://vk.com/mashinnoe_obuchenie_ai_big_data/ - ссылки на полезные материалы
- Семинары по машинному обучению JetBrains Research
Ну а для тех, кому многомерные оси совсем безразличны, напишу про английскую художницу Элин Томас, которая делает из войлока и шерсти поделки в виде чашек Петри с плесенью.

Ну или почитайте стандарт на компьютерную мышь от Xerox Palo Alto Research Center 1981 года, или как организовать стеганографию с помощью шести невидимых unicode-символов
#learn #drugdesign
Материалы по разработке лекарств 💊💻

- TeachOpenCADD - a teaching platform for computer-aided drug design.
- Open Drug Discovery Toolkit - a modular and comprehensive toolkit for use in cheminformatics, molecular modeling etc.
- RDKit Cheatsheet - полезная шпаргалка по пандасу для драг дизайна.
- Structure-based drug design of an inhibitor of the SARS-CoV-2 - real science туториал по разработке лекарств с бесплатным ПО.
- Хемоинформатика и Молекулярное Моделирование - ссылки на материалы, софт, статьи, конференции от хемоинформатиков КФУ. Лайк, подписка.
👍1
#sciart
organometallica🤘
#coldwaterswimming

Любопытны исследования эффектов воздействия холодной воды на организм человека. В 1801 году доктор Currie докладывает об успешном применении обливания холодной водой в лечении сыпного тифа. Когда стандартными методами не удалось остановить лихорадку, больных облили пятью галлонами холодной морской воды, и они пошли на поправку. Самым увлекательным в этой истории показалось описание стандартных методов лечения тифа в Англии начала 19 века.

Сначала пару дней кормили рвотными средствами (соединениями сурьмы), затем ежедневно назначали вино, в тяжелых случаях доходило до трех бутылок в день, и 40-50 капель опиума на ночь. Если вино не помогало, то повышали градус - давали шерри с бренди. Больных хорошо кормили и поили ячменной водой или лимонадом. В комнаты помещали чаши с каломелью и ревенем (слабительные).
#sciart #molvis

Как прародители делали визуализацию трехмерной структуры белка (вернее физикализацию) до появления молекулярной компьютерной графики. В 70-80х годах трёхмерную модель структуры белка создавали из металлической проволоки, сгибая её на гибочном станке, который изобрел кристаллограф Байрон Рубин. Этот прибор (Byron's Bender) позволял "быстро, просто и дешево" создать трёхмерную модель углеродного скелета белка по его кристаллографическим координатам. Позже Рубин разработал устройство для создания крупноразмерных молекулярных скульптур, взяв за основу станок для сгибания выхлопных труб.
казалось бы...

#learn #bioinf
Материалы по обработке омиксных данных 🧬💻

▫️
Почитать

- methylation (RRBS)
- ATAC-seq
- мокрые протоколы и обработка данных

▫️Курсы с практикой

- RNA-seq
- scRNA-seq
- RNA-seq, DGE, Chip-seq, scRNA-seq + R, bash
- всё подряд

links credit to Khrameeva lab <3
А пока я ничего не пишу, за что себя очень корю, вот вам результаты крупнейшей в России студенческой олимпиады "Я профессионал".

Обратите внимание на 6 строчку – сразу следом за великими.
Помимо вредных советов типа получения хлора в домашних условиях у открытого окошка, умиляет глава о таблице Менделеева, известной на западе, как Periodic table of elements. В повествовании Дмитрий Иванович скромно затесался где-то между "многими учёными", которые заметили периодичность изменения химических свойств, и Генри Мозли с атомным номером.
Мы же привыкли, что курс химии до того, как все полимеры проспали и пломбир стал невкусным неотъемлемо сопровождается воспитанием национальной гордости. Юный химик начинает свой путь со знакомства с Михайло Васильевичем и Дмитрием Ивановичем. Позже он узнаёт, что и органическая химия стоит на теории и правилах, развитых русскими учеными! А сколько именных реакций в органическом синтезе! Коновалова, Зинина, Кучерова, Меншуткина to name just a few. И легко нам запомнить имя изобретателя хроматографии, Михаила Семёновича Цвета.

Этот пост по-хорошему надо было приурочить ко дню химика (последнее воскресенье мая). В общем, с прошедшим праздником!
Forwarded from Cognitae (AUF1)
The_Golden_Book_of_Chemistry_Experiments_by_Robert_Brent_z_lib_org.pdf
27.9 MB
Сегодня я поделюсь с вами замечательной книгой. Это детская книжка по химии 1960 года. Она полна чудесной наивности и мечт о светлом будущем, достижимом при помощи науки. Эта книжка очень примечательна предлагаемыми двумястами химическими опытами, описанием того, как сделать домашнюю химическую лабораторию, а еще тем, что по ней учился Дэвид Хан, "атомный бойскаут". Мы не одобряем безрассудные эксперименты и делимся этой книгой лишь как интересной научной книгой из безвозвратно ушедшей эры.

#старые_книги
#sciart

И снова кото-японский арт. Пара трёхцветных котиков олицетворяют Х-хромосомы. Черепаховая и трёхцветная окраска котиков, точнее кошечек, это типичный пример инактивации X-хромосомы. Свернувшийся котик изображает конденсированную инактивированную Х-хромосому, а вытянувшийся котик - активную.

https://www.global.hokudai.ac.jp/blog/research-originating-from-the-laboratory-of-obuse-and-nagao-makes-the-cover-of-journal-nature-structural-molecular-biology/
- Cтажировки, гранты, учебка в IT и около @computerscienceabroad
- Работа в биотехе @blastim
- Работа в науке и около-науке @sci_career
- Работа в IT @sberlogajobs
- Работа в Сколково @jobskolkovo
- Вкатиться в датасаентизм (курсы, разбор вопросов на собесах и прочее) @mommyscience