Привет!
Попробуем писать тут про биоинформатику. И не только.

В Science и в Cell на прошлой неделе вышли статьи по single-cell транскриптомике.

Статья в Science посвящена профилям экспрессии в меланоме. 4645 клеток из 19 пациентов — это немало.
http://science.sciencemag.org/content/352/6282/189

Статья в Cell — про эмбрионы человека. 1529 single-cell транскриптомов из 88 эмбрионов.
http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(16)30280-X
Кстати, статья в открытом доступе, а данные уже доступны (https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-3929/) — вот это «Open Science»!

А вот авторы статьи в Nature Biotechnology намекают, что неполная пенетрантность может оказаться более распространённым явлением среди менделевских болезней, нежели считалось ранее. Проанализировали 874 гена в 589306 геномах (из 12 разных источников), нашли 13 людей, несущих мутации, которые предположительно придают устойчивость к 8 менделевским заболеваниям.

http://www.nature.com/nbt/journal/vaop/ncurrent/full/nbt.3514.html

Смотрите, новое древо жизни опубликовали.
Спросили Кунина, он сказал, что это очень важно (http://www.nytimes.com/2016/04/12/science/scientists-unveil-new-tree-of-life.html).

http://www.nature.com/articles/nmicrobiol201648

Figure 2: A reformatted view of the tree in Fig. 1in which each major lineage represents the same amount of evolutionary distance.

Figure 1: A current view of the tree of life, encompassing the total diversity represented by sequenced genomes.

Science Advances порадовал любопытной статьёй про эволюцию тРНК, ферменты ADAT (adenosine deaminases acting on tRNAs) и вот это всё.

ADAT — эукариот-специфичные ферменты, которые дезаминируют аденозин 34 (A34) в инозин (I34) в первом положении антикодона тРНК. Кроме одного случая — тРНК для глицина (tRNA Gly): tRNA Gly с антикодоном ACC отсутствует в геномах эукариот, а наиболее представленный изоакцептор tRNA Gly — tRNA Gly с антикодоном GCC.
Замена в последней тРНК GCC на ACC не вызывает проблем и не мешает работе глицил-тРНК синтетаза (GlyRS). Замена на ICC тоже не мешает аминоацилированию. (А вообще замена A34 на I34 позволяет одному антикодону тРНК узнавать кодоны, оканчивающиеся на C, на U или на A.)
А вот ADAT дезаминирует аденозин в tRNA Gly (с антикодоном ACC) крайне медленно (медленнее, чем контрольная tRNA Ala). Происходит это из-за структурного контекста антикодона (антикодоновой петли).

Частота нуклеотидных замен в последовательностях тРНК оказалась выше в видах с меньшим количеством генов тРНК, что, вероятно, является проявлением эффекта насыщения сигнала в эволюции тРНК. Здесь можно сравнивать разные виды бактерий (например, Ehrlichia с 36 генами тРНК в геноме и Escherichia с 89), а можно обратиться за примером к митохондриям: некоторые элемены для распознавания тРНК, консервативные для цитозольных тРНК (G73 в tRNA Asp), отсутствуют в митохондриальных тРНК животных.

http://advances.sciencemag.org/content/2/4/e1501860

А в Nature снова пишут про человеческие эмбрионы.

http://www.theverge.com/2016/5/4/11591318/cambridge-rockefeller-university-human-embryo-study-ethics-limit — Adi Robertson из The Verge объясняет, почему эти работы могут заставить пересмотреть запрет на изучение эмбрионов старше 14 дней после оплодотворения.

В http://www.nature.com/ncb/journal/vaop/ncurrent/full/ncb3347.html и http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17948.html описываются in vitro системы для изучения имплантации и пост-имплантационного развития эмбриона человека.

Смотрите! В Nature опубликовали результаты большой работы лаборатории Фёдора Кондрашова про ландшафт приспособленности GFP.
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17995.html

Чтобы ещё больше заинтересовать — картинка.
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/fig_tab/nature17995_F1.html

Здорово, что новость сразу подхватили:
- http://phys.org/news/2016-05-fluorescent-jellyfish-gene-landscape.html
- https://www.sciencedaily.com/releases/2016/05/160512084907.htm