А также ежемесячная — или еженедельная?.. — рубрика в Science про work-life balance в академии: Taking a break is hard work, too.

Тем временем по планете шагает Deep Learning, а Fabian Theis со своими мюнхенскими коллегами опубликовал довольно подробное ревью про то, для каких задач Deep Learning уже используется в геномике.

https://www.nature.com/articles/s41576-019-0122-6

Пока все возбуждены фотографией чёрной дыры, любопытные статьи, конечно же, не перестают выходить.

NASA Twins Study
Исследование с размером выборки n=1, в котором один из монозиготных близнецов пробыл на орбите год. Идея состояла в том, чтобы собрать много параметров — от экспрессии генов, метилирования ДНК и длины теломер до когнитивных способностей.
Исследование интересно и уникально само по себе, — несмотря на весь скепсис про размер выборки в твиттере, — и один из прикладных выводов состоит в том, что долгое пребывание в космосе — это непросто для человеческого тела. Это включает в себя и изменение паттернов экспрессии генов, и увеличение числа хромосомных инверсий и числа коротких теломерных повторов, и ослабление когнитивных способностей — даже спустя 6 месяцев пребывания на Земле после полёта.
Актуально всё это в том числе и для полётов на Марс (которые, вероятно, будут занимать не меньше чем полгода в одну сторону).

Статья в Science | Обсуждение на HackerNews | Обсуждение на Reddit


CD22
Ингибирование CD22 — одного из рецепторов на поверхности B-клеток — восстанавливает фагоцитоз, который менее активен в мозге старых мышей, что в итоге приводит к улучшению когнитивных функций. Авторы описывают результаты CRISPR–Cas9 нокаута CD22 на клеточной линии BV2 (клетках микроглии) и блокировке CD22 антителами — специфично в центральной нервной системе, для чего мышкам в течение месяца вводили антитела в цереброспинальную жидкость.

Статья в Nature | Обсуждение на Reddit


Denisovans
Про 161 геном из Индонезии и Новой Гвинеи, в которых (в геномах, а не в островах) нашли следы целых двух новых групп Денисовских людей.

Статья в Cell | Обсуждение на Reddit


Ссылки на r/science служат очередным напоминанием о том, что это может быть одним из немногих мест в интернете, способным поддерживать веру в человечество. 🙂

Очередной совет спать больше — с щепоткой интересных наблюдений про случаи, когда всего один полиморфизм, например в гене DEC2, позволяет спать на пару часов меньше.

The New Yorker | HN

‍«Математические прогулки» — так называет­ся проект, который когда-то запустил Институт проблем передачи информации им. А. А. Харкевича РАН совместно со Сколковским ­институтом науки и технологий (Сколтех). Учёные в непринуждённом формате рассказывают, чем они занимаются и где мы можем встретить результаты их исследований. «КШ» решил прогуляться с Григорием Кабатянским, советником по науке ректора Сколтеха, профессором НИУ ВШЭ и главным научным сотрудником ИППИ РАН.

https://kot.sh/statya/3805/progulki-s-matematikoy

Продолжаем традиционную рубрику про сон статьёй из Journal of Research in Personality.

В изложении Британского Психологического Общества это звучит как минимум как повод задуматься.

По традиции — оживлённая дискуссия (и очередь из несогласных) на HN.

Твит Hadley Wickham’а, которого не понаслышке знают дата-сайентисты и R коммьюнити, напомнил о том, что будущее — вместе с WebAssembly — наступает семимильными шагами.

Mozilla активно участвует в разработке решений для того, чтобы в браузере работал код, написанный на разных языках, в первую очередь C, C++ и Rust.

Уже сейчас можно компилировать код под WebAssembly.

https://twitter.com/hadleywickham/status/1126978852763439104

Фокус последнего выпуска журнала «Природа» — наука в Европе.

Тут интересны и детали, которые затронуты в интервью с девятью европейцами из академии, и глобальный взгляд на факты (и деньги) в виде инфографики.
В последнем случае грустно только, что всё, что смогли в Nature, это слепить шесть графиков и поместить их на одну веб-страницу друг за другом.

Кажется, Андрей Карпатый ударился в современную биологию:

https://twitter.com/karpathy/status/1134889095585386496

Познавательное с ISMB/ECCB 2019:
https://twitter.com/jcengelmann/status/1154025161898778624

Пару заметок про бактерии, которые (заметки) залежались в черновиках:

- Marisa из Babraham Institute (это тот, что рядом с Кэмбриджем, который в UK) отвечала на Reddit’е на вопросы пользователей. Интересно, какой популярностью воспользовался этот пост с AMA: 1.2k комментариев!

- Статья на The Verge про фагов, перспективы фаговой терапии и исследователей, которые занимаются этим в Грузии.