и тебя отсеквенируем
31 subscribers
80 photos
3 videos
14 files
237 links
Журнальный клуб по современной биологии.

https://xn--r1a.website/compbio?boost

Про single cell, геномику, биоинформатику и не только.
Download Telegram
Channel name was changed to «CompBio»
Чтобы отправздновать двадцатипятилетие Wellcome Trust Sanger Institute, отсеквенируют 25 видов животных.
Вот как нужно отмечать юбилеи!

http://www.sanger.ac.uk/news/view/25-species-revealed-25-genomes-project

http://www.sanger.ac.uk/science/collaboration/25-genomes-25-years
Forwarded from addmeto
Невероятно интересный лонгрид про применение систем ИИ к здравоохранению и вообще к теме персонального здоровья. Не буду коментировать, обязательно прочитайте если вам интересна тема здоровья, медицины, ИИ и (что тоже важно) государственного регулирования совмещения этих тем.

По сути это статья, показывающая как из фейла одного интересного проекта в этой области человечество может извлечь много плюсов. Но читайте сами. Если не в состоянии - прочитайте хотяб конклюжн.

https://link.springer.com/article/10.1007/s12553-017-0179-1
Потрясающая статья в Scientific American под названием «In Silico Flurries: Computing a world of snowflakes».

https://blogs.scientificamerican.com/sa-visual/in-silico-flurries/
Тут даже сделали браузер по снежинкам: http://mkweb.bcgsc.ca/snowflakes/
И это, если вы не заметили, от Martin'а Krzywinski — автора Circos и Hive Plot.
Под конец года в Nature Reviews Genetics опубликовали заметку про новый метод в spatial single-cell transcriptomics.
Интерес в spatial transcriptomics состоит в том, чтобы сохранять информацию о положении каждой клетки в пространстве.
Авторы NICHE-seq совместили в новом методе двухфотонную микроскопию, флуоресцентные репортёры, flow cytometry и scRNA-seq и показали, что с помощью него можно изучать субпопуляции, например, имунных клеток.

Заголовок Single-cell transcriptomes in space немного смущает правда (в космосе? в пространстве?).

Заметка в Nature | Статья в Science | Обзор Nature Reviews Genetics по теме
Google Brain Team обупликовала в бложике краткий обзор исследований за 2017 год.
И выглядит это более чем впечатляюще.

Часть 1: https://research.googleblog.com/2018/01/the-google-brain-team-looking-back-on.html
Часть 2: https://research.googleblog.com/2018/01/the-google-brain-team-looking-back-on_12.html

В области здравоохранения, конечно же, упомянули сетки, натренированные распознавать на фотографиях опухоль.
https://research.googleblog.com/2017/03/assisting-pathologists-in-detecting.html