А в Nature снова пишут про человеческие эмбрионы.
http://www.theverge.com/2016/5/4/11591318/cambridge-rockefeller-university-human-embryo-study-ethics-limit — Adi Robertson из The Verge объясняет, почему эти работы могут заставить пересмотреть запрет на изучение эмбрионов старше 14 дней после оплодотворения.
В http://www.nature.com/ncb/journal/vaop/ncurrent/full/ncb3347.html и http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17948.html описываются in vitro системы для изучения имплантации и пост-имплантационного развития эмбриона человека.
http://www.theverge.com/2016/5/4/11591318/cambridge-rockefeller-university-human-embryo-study-ethics-limit — Adi Robertson из The Verge объясняет, почему эти работы могут заставить пересмотреть запрет на изучение эмбрионов старше 14 дней после оплодотворения.
В http://www.nature.com/ncb/journal/vaop/ncurrent/full/ncb3347.html и http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17948.html описываются in vitro системы для изучения имплантации и пост-имплантационного развития эмбриона человека.
The Verge
Scientists push to reconsider human embryo research limits after new study
A new pair of studies have reported raising human embryos outside the womb for almost two weeks, longer than ever before. The studies, published today in Nature, raise questions about a...
Смотрите! В Nature опубликовали результаты большой работы лаборатории Фёдора Кондрашова про ландшафт приспособленности GFP.
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17995.html
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17995.html
Чтобы ещё больше заинтересовать — картинка.
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/fig_tab/nature17995_F1.html
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/fig_tab/nature17995_F1.html
Здорово, что новость сразу подхватили:
- http://phys.org/news/2016-05-fluorescent-jellyfish-gene-landscape.html
- https://www.sciencedaily.com/releases/2016/05/160512084907.htm
- http://phys.org/news/2016-05-fluorescent-jellyfish-gene-landscape.html
- https://www.sciencedaily.com/releases/2016/05/160512084907.htm
phys.org
Fluorescent jellyfish gene sheds light on 'fitness landscape'
By studying more than 50,000 variants of a jellyfish gene, researchers at the Centre for Genomic Regulation in Barcelona (Spain) have drawn a detailed picture of how changes in that gene affect its function. ...
Сегодня все пишут про эукариотический организм без митохондрий.
Авторы отсеквенировали (размер генома ~75 Mbs) неизученного представителя группы Metamonada — Monocercomonoides sp., — но ничего похожего на то, что должно быть в митохондриальном геноме, найти не смоги. Не обнаружили следов митохондрий в ядерном геноме. Не нашли ни транспортных систем митохондрий (TIM/TOM), ни систем биогенеза железосерных кластеров.
Генерация АТФ у Monocercomonoides происходит примерно так же, как у анаэробов с редуцированными митохондриями. А железосерные кластеры Monocercomonoides делает по пути SUF (sulfur mobilisation system). К слову, система SUF ранее была найдена и в пластидах, и в археях, и в эукариотах (Pygsuia biforma и Blastocystis sp.).
http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822%2816%2930263-9
Авторы отсеквенировали (размер генома ~75 Mbs) неизученного представителя группы Metamonada — Monocercomonoides sp., — но ничего похожего на то, что должно быть в митохондриальном геноме, найти не смоги. Не обнаружили следов митохондрий в ядерном геноме. Не нашли ни транспортных систем митохондрий (TIM/TOM), ни систем биогенеза железосерных кластеров.
Генерация АТФ у Monocercomonoides происходит примерно так же, как у анаэробов с редуцированными митохондриями. А железосерные кластеры Monocercomonoides делает по пути SUF (sulfur mobilisation system). К слову, система SUF ранее была найдена и в пластидах, и в археях, и в эукариотах (Pygsuia biforma и Blastocystis sp.).
http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822%2816%2930263-9
Удивительно здорово: много материалов про рак на главной странице The New York Times. Вот несколько:
- Классификация раковых заболеваний с небольшой справкой по каждому из них: http://www.nytimes.com/interactive/2016/05/11/magazine/100000004400763.mobile.html
- История про мальчика с редким типом лейкемии: http://mobile.nytimes.com/2016/05/15/magazine/childhood-cancer-treatment.html
- Про лечение рака в наши дни: http://mobile.nytimes.com/2016/05/15/magazine/oncologist-improvisation.html
- Про лечение рака, основанное на воздействии на метаболизм: http://mobile.nytimes.com/2016/05/15/magazine/warburg-effect-an-old-idea-revived-starve-cancer-to-death.html
- Про обнадёживающие случаи улучшения состояния некоторых раковых больных: http://mobile.nytimes.com/2016/05/15/magazine/exceptional-responders-cancer-the-lazarus-effect.html
- Классификация раковых заболеваний с небольшой справкой по каждому из них: http://www.nytimes.com/interactive/2016/05/11/magazine/100000004400763.mobile.html
- История про мальчика с редким типом лейкемии: http://mobile.nytimes.com/2016/05/15/magazine/childhood-cancer-treatment.html
- Про лечение рака в наши дни: http://mobile.nytimes.com/2016/05/15/magazine/oncologist-improvisation.html
- Про лечение рака, основанное на воздействии на метаболизм: http://mobile.nytimes.com/2016/05/15/magazine/warburg-effect-an-old-idea-revived-starve-cancer-to-death.html
- Про обнадёживающие случаи улучшения состояния некоторых раковых больных: http://mobile.nytimes.com/2016/05/15/magazine/exceptional-responders-cancer-the-lazarus-effect.html
Nytimes
The Cancer Almanac
For decades, science has classified cancers by the organ or system in which they begin. That taxonomy is slowly being replaced — but it’s still the indispensable way to understand the odds.
Репликация и транскрипция в зазеркалье.
Новость в Nature News: http://www.nature.com/news/mirror-image-enzyme-copies-looking-glass-dna-1.19918?WT.mc_id=TWT_NatureNews#/b1
Статья в Nature Chemistry: http://www.nature.com/nchem/journal/vaop/ncurrent/full/nchem.2517.html
Новость в Nature News: http://www.nature.com/news/mirror-image-enzyme-copies-looking-glass-dna-1.19918?WT.mc_id=TWT_NatureNews#/b1
Статья в Nature Chemistry: http://www.nature.com/nchem/journal/vaop/ncurrent/full/nchem.2517.html
Противораковая терапия, разрабатываемая в Noxxon Pharma AG (Берлин), использует в том числе L-RNA.
http://www.noxxon.com/index.php?option=com_content&view=article&id=13&Itemid=466
http://www.fiercebiotech.com/biotech/noxxon-pharma-announces-intention-to-launch-an-initial-public-offering-on-euronext
http://www.noxxon.com/index.php?option=com_content&view=article&id=13&Itemid=466
http://www.fiercebiotech.com/biotech/noxxon-pharma-announces-intention-to-launch-an-initial-public-offering-on-euronext
Nature. Быстрый синтез макролидов (антибиотиков).
http://www.nature.com/nature/journal/v533/n7603/full/nature17967.html
http://www.theverge.com/2016/5/18/11686268/new-antibiotic-drug-candidates-resistance-harvard-macrolide
http://www.nature.com/nature/journal/v533/n7603/full/nature17967.html
http://www.theverge.com/2016/5/18/11686268/new-antibiotic-drug-candidates-resistance-harvard-macrolide
А вот с Mitochondrial replacement therapy всё может быть не так просто. Её более года назад одобрили в UK [1]. Теперь в Cell опубликовали исследования [2, 3], согласно которым при развитии организма тот малый процент (<2%) проблемных митохондрий, которые всё-таки захватываются вместе с материнским ядром, может «завоевать» всю популяцию митохондрий. То, что митохондрии с более короткой mtDNA начинают превалировать в клетке, известно довольно давно. Теперь есть основания беспокоиться об этом в приложении к заместительной терапии. Хотя эти работы [2, 3] вряд ли показательны: нужно выяснить, как будет обстоять дело в исследованиях на эмбрионах.
Популярно об этом написано в Nature News [4].
1: http://www.nature.com/news/scientists-cheer-vote-to-allow-three-person-embryos-1.16843
2: http://www.cell.com/cell-reports/abstract/S2211-1247(14)00395-7
3: http://www.cell.com/cell-stem-cell/fulltext/S1934-5909(16)30044-3
4: http://www.nature.com/news/three-person-embryos-may-fail-to-vanquish-mutant-mitochondria-1.19948
Популярно об этом написано в Nature News [4].
1: http://www.nature.com/news/scientists-cheer-vote-to-allow-three-person-embryos-1.16843
2: http://www.cell.com/cell-reports/abstract/S2211-1247(14)00395-7
3: http://www.cell.com/cell-stem-cell/fulltext/S1934-5909(16)30044-3
4: http://www.nature.com/news/three-person-embryos-may-fail-to-vanquish-mutant-mitochondria-1.19948
Сегодня пятница. И подборка всяких статей и новостей не по теме.
1. В Science рассказывают про то, как с помощью магнитного пинцета можно изучать веретено деления, которое специально выравнивается по центру клетки во время деления. http://science.sciencemag.org/content/352/6289/1124
2. Про ГМ горчицу в Индии. Есть надежда, что её разрешат, но окончательного решения ещё не вынесено. http://science.sciencemag.org/content/352/6289/1043
3. К раку бывает предрасположенность, и вот краткая заметка про историю этого вопроса и синдром Ли-Фраумени (обусловленый поломкой в гене TP53, кодирующем p53) в Science. http://science.sciencemag.org/content/352/6289/1052
4. С каждым днём жить становится всё интереснее: кот Шрёдингера может жить одновременно в двух коробках. http://science.sciencemag.org/content/352/6289/1087
5. CRIPR-систему можно использовали для того, чтобы маркировать клетки эмбрионов и следить за процессами развития. Авторы называют это GESTALT — genome editing of synthetic target arrays for lineage tracing.
Заметка: http://www.sciencemag.org/news/2016/05/genome-editor-crispr-helps-trace-growth-embryos-and-maybe-cancer-next
Статья: http://science.sciencemag.org/content/early/2016/05/25/science.aaf7907
6. Про рак и образ жизни. Сразу несколько статей:
- http://oncology.jamanetwork.com/article.aspx?articleid=2522371
- http://archinte.jamanetwork.com/article.aspx?articleid=2521822
- http://archinte.jamanetwork.com/article.aspx?articleid=2521826
И новостная заметка по теме: http://yodnews.ru/2016/05/27/profilaktika
7. Опять про рак и мобильные телефоны. Черновик на biorXiv’е (http://biorxiv.org/content/early/2016/05/26/055699, http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2016/05/26/055699.full.pdf) и дискуссия на Hacker News (https://news.ycombinator.com/item?id=11784160).
8. Проблемы с антибиотиками становятся всё острее. Обнаружили E. coli с плазмидой, несущей ген устойчивости к колистину, в США:
- статья http://aac.asm.org/content/early/2016/05/25/AAC.01103-16.abstract
- заметка https://www.washingtonpost.com/news/to-your-health/wp/2016/05/26/the-superbug-that-doctors-have-been-dreading-just-reached-the-u-s/
- заметка (из которой понятно, что даже в статьях крупных издательств по этой теме много ошибок) http://arstechnica.com/science/2016/05/everybody-be-cool-a-nightmare-superbug-has-not-heralded-the-apocalypse-yet/
- обсуждение https://news.ycombinator.com/item?id=11780457
1. В Science рассказывают про то, как с помощью магнитного пинцета можно изучать веретено деления, которое специально выравнивается по центру клетки во время деления. http://science.sciencemag.org/content/352/6289/1124
2. Про ГМ горчицу в Индии. Есть надежда, что её разрешат, но окончательного решения ещё не вынесено. http://science.sciencemag.org/content/352/6289/1043
3. К раку бывает предрасположенность, и вот краткая заметка про историю этого вопроса и синдром Ли-Фраумени (обусловленый поломкой в гене TP53, кодирующем p53) в Science. http://science.sciencemag.org/content/352/6289/1052
4. С каждым днём жить становится всё интереснее: кот Шрёдингера может жить одновременно в двух коробках. http://science.sciencemag.org/content/352/6289/1087
5. CRIPR-систему можно использовали для того, чтобы маркировать клетки эмбрионов и следить за процессами развития. Авторы называют это GESTALT — genome editing of synthetic target arrays for lineage tracing.
Заметка: http://www.sciencemag.org/news/2016/05/genome-editor-crispr-helps-trace-growth-embryos-and-maybe-cancer-next
Статья: http://science.sciencemag.org/content/early/2016/05/25/science.aaf7907
6. Про рак и образ жизни. Сразу несколько статей:
- http://oncology.jamanetwork.com/article.aspx?articleid=2522371
- http://archinte.jamanetwork.com/article.aspx?articleid=2521822
- http://archinte.jamanetwork.com/article.aspx?articleid=2521826
И новостная заметка по теме: http://yodnews.ru/2016/05/27/profilaktika
7. Опять про рак и мобильные телефоны. Черновик на biorXiv’е (http://biorxiv.org/content/early/2016/05/26/055699, http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2016/05/26/055699.full.pdf) и дискуссия на Hacker News (https://news.ycombinator.com/item?id=11784160).
8. Проблемы с антибиотиками становятся всё острее. Обнаружили E. coli с плазмидой, несущей ген устойчивости к колистину, в США:
- статья http://aac.asm.org/content/early/2016/05/25/AAC.01103-16.abstract
- заметка https://www.washingtonpost.com/news/to-your-health/wp/2016/05/26/the-superbug-that-doctors-have-been-dreading-just-reached-the-u-s/
- заметка (из которой понятно, что даже в статьях крупных издательств по этой теме много ошибок) http://arstechnica.com/science/2016/05/everybody-be-cool-a-nightmare-superbug-has-not-heralded-the-apocalypse-yet/
- обсуждение https://news.ycombinator.com/item?id=11780457
Science
A force-generating machinery maintains the spindle at the cell center during mitosis
As a cell divides, the mitotic spindle segregates chromosomes to daughter cells. It does so while maintaining a centralized position; however, the mechanism for spindle placement is unclear. Garzon-Coral et al. used magnetic tweezers to show that the dynamical…
А как насчёт кожи, создаваемой в лаборатории, (http://www.modernmeadow.com/our-technology/, http://www.fastcoexist.com/3061337/world-changing-ideas/real-leather-grown-in-a-lab-is-moving-closer-to-you-closet, https://science.dirty.ru/innovatsii-v-kozhevennom-proizvodstve-1127445/) и робота с крысиными кардиомиоцитами (http://science.sciencemag.org/content/353/6295/158)? XXI век всё-таки.
Modern Meadow
Our Technology - Modern Meadow
Biofabrication is Modern Meadow’s way of building with biology—a means for making materials inspired by nature and grown of life’s essential elements.
Работа из лаборатории Джорджа Чёрча интересна с точки зрения потециальных возможностей синтетической биологии.
А когда генетический код сделают неизбыточным, можно будет создавать штаммы, использующие нестандартные аминокислоты, закодированные у них в геноме.
http://science.sciencemag.org/content/353/6301/819
А когда генетический код сделают неизбыточным, можно будет создавать штаммы, использующие нестандартные аминокислоты, закодированные у них в геноме.
http://science.sciencemag.org/content/353/6301/819
Science
Design, synthesis, and testing toward a 57-codon genome
By recoding bacterial genomes, it is possible to create organisms that can potentially synthesize products not commonly found in nature. By systematic replacement of seven codons with synonymous alternatives for all protein-coding genes, Ostrov et al. recoded…