Медтех
#oncotech #pathology #ai #google Сегодня новость по моей любимой теме — AI в онкологии. На ежегодной конференции AACR (American Association for Cancer Research) команда Google AI представила 🔬 с дополненной реальностью для патологов. https://research.…
YouTube
Detecting cancer in real-time with machine learning
Learn more about our research efforts to create a machine learning and augmented reality-powered microscope for real-time detection of cancer, helping to make pathologists more efficient and ultimately to save patient lives.
Learn more: https://research…
Learn more: https://research…
Очень правильная статья со взешенным взглядом на будущее AI. В ней же — про IA и II.
https://medium.com/@mijordan3/artificial-intelligence-the-revolution-hasnt-happened-yet-5e1d5812e1e7
And, while one can foresee many problems arising such a system — involving privacy issues, liability issues, security issues, etc — these problems should properly be viewed as challenges, not show-stoppers.
https://medium.com/@mijordan3/artificial-intelligence-the-revolution-hasnt-happened-yet-5e1d5812e1e7
Medium
Artificial Intelligence — The Revolution Hasn’t Happened Yet
Artificial Intelligence (AI) is the mantra of the current era. The phrase is intoned by technologists, academicians, journalists and…
Теперь Teardrop в ДНК!
https://knife.media/dna-album/
https://www.ethz.ch/content/dam/ethz/news/eth-news/2018/04/180420-mezzanine-on-dna/teardrop-short.mp3
https://knife.media/dna-album/
https://www.ethz.ch/content/dam/ethz/news/eth-news/2018/04/180420-mezzanine-on-dna/teardrop-short.mp3
Нож
Massive Attack к 20-летию альбома Mezzanine закодировали его в ДНК
Mezzanine — третий студийный и самый успешный альбом бристольского трио. В этом году пластинке исполнилось 20 лет — теперь она будет храниться практически вечно.
Всем биологии, господа! И сна.
http://www.pnas.org/content/early/2018/05/01/1720719115
http://www.pnas.org/content/early/2018/05/01/1720719115
PNAS
Simulated night shift work induces circadian misalignment of the human peripheral blood mononuclear cell transcriptome
Night shift work is associated with adverse health effects, including diabetes, cardiovascular disease, and cancer. Understanding the molecular mechanisms that underlie this association is instrumental in advancing the diagnosis, prevention, and treatment…
Очень приятно видеть, как точные науки вроде современной генетики и биологии вообще подбираются ближе к самому обществу. А у NYT приятные лонгриды!
https://www.nytimes.com/2018/04/23/health/genes-mutation-foxg1-brain.html
https://www.nytimes.com/2018/04/23/health/genes-mutation-foxg1-brain.html
Nytimes
Infinitesimal Odds: A Scientist Finds Her Child’s Rare Illness Stems From the Gene She Studies
When it comes to studying the genetics of the brain, Soo-Kyung Lee is a star, yet she was stunned to discover the cause of her daughter’s devastating disabilities.
Сразу две забавных статьи за последнее время: про механизмы памяти и про внеземное происхождение жизни (или части жизни).
Несколько дней назад в журнале eNeuro вышла статья, в которой авторы заявляют о передаче памяти между улитками с помощью инъекции РНК. Её осветили много изданий, например The Guardian. Прекрасный повод для оживлённых дискуссий!
А вот здесь авторы говорят о том, что головоногие на самом деле пришельцы! В обсуждении на HN есть ссылки на освещение статьи в новостных изданиях.
Обе статьи так или иначе связаны с проблемой разума и интеллекта, обеим статьям читатели не очень-то и поверили, но обе напоминают о том, что в этой важной и интригующей области биологии есть широкий простор для великих открытий.
Несколько дней назад в журнале eNeuro вышла статья, в которой авторы заявляют о передаче памяти между улитками с помощью инъекции РНК. Её осветили много изданий, например The Guardian. Прекрасный повод для оживлённых дискуссий!
А вот здесь авторы говорят о том, что головоногие на самом деле пришельцы! В обсуждении на HN есть ссылки на освещение статьи в новостных изданиях.
Обе статьи так или иначе связаны с проблемой разума и интеллекта, обеим статьям читатели не очень-то и поверили, но обе напоминают о том, что в этой важной и интригующей области биологии есть широкий простор для великих открытий.
eNeuro
RNA from Trained Aplysia Can Induce an Epigenetic Engram for Long-Term Sensitization in Untrained Aplysia
The precise nature of the engram, the physical substrate of memory, remains uncertain. Here, it is reported that RNA extracted from the central nervous system of Aplysia given long-term sensitization (LTS) training induced sensitization when injected into…
Товарищи из Salk'а дифференцируют фибробласты в нейроны и ухитряются находить в них следы старения. И возрастные изменения в митохондриях тоже сохраняются.
И пресс-релизы у Salk'а замечательные.
И пресс-релизы у Salk'а замечательные.
Взгляд на биосенсоры от The Verge.
Сенсор из бактерий для определения кровотечений в желудке или кишечнике? Check.
Биодеградируемый имплант для измерения биомеханических показателей ткани после операции? Check.
Наклейка на зуб, анализирующая слюну? Check.
What a wonderful time to live in!
#bionics
Сенсор из бактерий для определения кровотечений в желудке или кишечнике? Check.
Биодеградируемый имплант для измерения биомеханических показателей ткани после операции? Check.
Наклейка на зуб, анализирующая слюну? Check.
What a wonderful time to live in!
#bionics
The Verge
How sensors are giving us another way to peek inside our bodies
Scientists have engineered sensors that can be swallowed and sensors that disappear
Forwarded from Медуза — LIVE (Медуза)
В Помпеях в этом сезоне было сделано уже несколько интересных открытий — в частности, останки хромого человека, который не успел уйти из гибнущего города, и взнузданную лошадь. Подробно о находках рассказывает журналистка Юлия Штутина
https://meduza.io/feature/2018/06/02/v-pompeyah-snova-nachalis-raskopki-tam-nashli-ostanki-cheloveka-hromogo-i-s-dengami-loshad-dom-i-dazhe-ulitsu?utm_source=telegram&utm_medium=live&utm_campaign=live
https://meduza.io/feature/2018/06/02/v-pompeyah-snova-nachalis-raskopki-tam-nashli-ostanki-cheloveka-hromogo-i-s-dengami-loshad-dom-i-dazhe-ulitsu?utm_source=telegram&utm_medium=live&utm_campaign=live
Meduza
В Помпеях снова начались раскопки. Там нашли останки человека (хромого и с деньгами), лошадь, дом и даже улицу
Археологический сезон 2018 года в Помпеях — юбилейный: первые научные раскопки древнеримского города, погибшего из-за извержения Везувия в I веке нашей эры, состоялись в 1748-м. В этом сезоне ученые сделали уже несколько любопытных открытий — например, нашли…
Spencer: How long do you have?
Thirteen: Maybe a little more than you. Maybe a little less. I'll race you.
Тринадцатая — персонаж популярного сериала «Доктор Хаус». У Реми Хедли (много ли поклонников сериала помнят полное имя Тринадцатой?) диагностируют заболевание, унесшее жизни её матери и брата, — хорею Гентингтона. И хотя с момента выхода последней серии House M.D. прошло уже шесть лет, как справляться с болезнью Гентингтона, всё ещё не ясно.
Болезнь Гентингтона имеет определённую генетическую причину. Если в гене HTT, кодирующем белок гентингтин, мутаций в виде повтора CAG, кодирующего глутамин, слишком много (>35 повторов), некоторые типы нейронов умирают быстрее, чем в норме. Гантингтин выполняет различные функции, включая участие в транскрипции, клеточных взаимодействиях, внутриклеточном транспорте, синаптической передаче и контроле клеточной смерти, — неудивительно, что молекулярные основы заболевания остаются загадкой.
... Newnham concluded that he needed to know his status with respect to Huntington’s disease. “We didn’t want to have a child without that certainty,” he says. The result was not what he had hoped for. Like his father, he carries the mutated gene.
Один из потенциальных способов лечения болезни Гентингтона основан на использовании антисмысловых олигонуклеотидов (АСО). В клинических испытаниях синтезированную цепь из 15 – 25 нуклеотидов вводят пациентам в цереброспинальную жидкость. Лекарство затем проникает в головной мозг и уменьшает содержание белка гентингтина в нейронах, не вызывая при этом побочных эффектов. Третью фазу клинических испытаний Roche начнёт проводить уже в этом году.
Дизайн АСО нетривиален: последовательность нуклеотидов для синтеза задаётся такой, чтобы она была комлементарна мРНК нужного гена. Связываясь с мишенью, АСО подавляют трансляцию и способствуют деградации мРНК. Чтобы использовать АСО как лекарство, связывание с мишенью должно быть специфичным, а сами олигонуклеотиды должны избежать деградации нуклеазами. Поэтому лекарства на основе АСО представляют собой не просто цепочку нуклеотидов, но цепочку модифицированных нуклеотидов. В случае болезни Гентингтона нужно подавить экспрессию копии гена с большим количеством повторов CAG, что усложняет задачу. Одно из возможных решений — использовать различия между копиями гена: если во вредной копии гена есть хотя бы один полиморфизм (SNP), можно синтезировать олигонуклеотид, который будет связываться именно с ней. В 30% случаев, однако, такого полиморфизма у пациентов найти не удаётся. На этом трудности использования АСО не заканчиваются: так, нужно регулярно, возможно, на протяжении десятилетий, доставлять АСО в цереброспинальную жидкость...
Конечно же, для лечения хореи тестируют и CRISPR/Cas9, точнее KamiCas9 — с инактивацией через короткое время. (И здесь есть свои проблемы.)
- Nature Outlook: Huntington’s disease
- How the gene behind Huntington’s disease could be neutralized
- CRISPR takes on Huntington’s disease
- Improved metrics for Huntington’s disease trials
- Living under the shadow of Huntington’s disease
- When Huntington’s disease comes early
Nature
CRISPR takes on Huntington’s disease
Gene editing offers the prospect of curing the inherited neurodegenerative condition in a single dose.
Напоминание, что у The New York Times приятные заметки: https://www.nytimes.com/2018/06/11/health/men-y-chromosome.html
Forwarded from как они растут /
Вышел мой текст на @knifemedia о том, как гены могут определять исход лекарственной терапии. Это такой небольшой занимательный дайджест из истории фармакогенетики: как в 50-ых всё начиналось с введения в клиническую практику миорелаксанта суксаметония и у некоторых людей он вызывал паралич дыхательных мышц на несколько часов, что было чревато смертельным исходом; а ещё история про препарат дебризохин и последующее открытие роли ферментов-цитохромов в метаболизме лекарственных средств.
Пожалуй, ярче всего суть фармакогенетики раскрывается на примере историй про неконтролируемый приём психоактивных веществ. Поэтому за основу текста взята история парня Курта, которому в 96-ом году был назначен новый и очень популярный в то время антидепрессант прозак (он же флуоксетин). На фоне приёма прозака Курт без каких-либо мотивов расстрелял отца и был осуждён на 60 лет строго режима. Но на этом дело не получило своей финальной точки и в свете новых клинических исследований и фармакогенетических открытий в нулевых лишь приобрело большую этическую сложность и неоднозначность.
https://knife.media/dark-alleles/
Пожалуй, ярче всего суть фармакогенетики раскрывается на примере историй про неконтролируемый приём психоактивных веществ. Поэтому за основу текста взята история парня Курта, которому в 96-ом году был назначен новый и очень популярный в то время антидепрессант прозак (он же флуоксетин). На фоне приёма прозака Курт без каких-либо мотивов расстрелял отца и был осуждён на 60 лет строго режима. Но на этом дело не получило своей финальной точки и в свете новых клинических исследований и фармакогенетических открытий в нулевых лишь приобрело большую этическую сложность и неоднозначность.
https://knife.media/dark-alleles/
Нож
Темные аллели: как гены определяют исход лекарственной терапии и может ли антидепрессант заставить человека убивать?
Как не стать убийцей, лечась от депрессии, почему кратковременный наркоз может привести к смерти и в каких случаях для назначения лекарств нужны генетические тесты.
Изумительно прекрасное уже сегодня: John Oliver рассказывает о том, что CRISPR значит для человечества и какие проблемы может нести.
https://www.youtube.com/watch?v=AJm8PeWkiEU
Конечно же, больше упора на социальный аспект и этику, чем на биологию, но качество сторителлинга и адекватность на высоте.
https://www.youtube.com/watch?v=AJm8PeWkiEU
Конечно же, больше упора на социальный аспект и этику, чем на биологию, но качество сторителлинга и адекватность на высоте.
YouTube
Gene Editing: Last Week Tonight with John Oliver (HBO)
Scientists are developing new ways to alter the genetic code of living organisms. John Oliver explores the risks, rewards, and wolf-related hazards of gene editing.
Connect with Last Week Tonight online...
Subscribe to the Last Week Tonight YouTube channel…
Connect with Last Week Tonight online...
Subscribe to the Last Week Tonight YouTube channel…
В верном направлении движемся: препринты теперь индексируются в Europe PMC.
http://blog.europepmc.org/2018/07/preprints.html
http://blog.europepmc.org/2018/07/preprints.html
blog.europepmc.org
Preprints in Europe PMC: reducing friction for discoverability
From July 2018, the Europe PMC repository will start indexing preprints. Making preprin...
Forwarded from Denis Sexy IT 🤖
Тут в Nature пишут интересное: ⚡️Осталось всего ~10 лет, чтобы найти какую-то замену литий-ионным аккумуляторам перед началом заметного кризиса в этой индустрии, так как редкие ресурсы вроде кобальта и никеля которые в них используются — ограничены и исчезнут в 2030+ году.
За последние несколько десятков лет, литий-ионные батареи стали в 3 раза вместимее и в 30 раз дешевле — несмотря на это, темпы развития технологии замедляются, поскольку приблизились к фундаментальным ограничениям — к законам физики. Количество заряда, который может храниться в кристаллических структурах электродных материалов, приближается к теоретическому максимуму.
И это при том, что с каждым годом спрос на аккумуляторы растет, так как устройств которые их используют с каждым годом становится всё больше.
Хуже того, материалы, используемые в аккумуляторах — редкие металлы, такие как кобальт и никель, становятся все дороже и реже. За последние два года производство аккумуляторных батарей увеличилось почти в четыре раза, что сказалось на цене за килограмм кобальта — за те же два года цена выросла с 22$ до 81$, никель хоть и дешевле — но с 2015 года тоже подорожал с 9$ долларов до 14$.
Как утверждают авторы статьи на Nature, необходимо срочно разработать альтернативные типы электродов на основе дешевых, обычных металлов, таких как железо и медь, а так же повысить приоритет таким исследованиям.
Статья читается легко, но оставляет легкий привкус паники — так как срочно нужно что-то делать и хоть и есть уже какие-то примеры аккумуляторов где используются обычное железо и медь, пока они уступают технологии на кобальте и стоят в 2 раза дороже, поэтому исследователи просят государства и компании-производителей электрокаров спонсировать разработку нового вида аккумуляторов.
Мое обывательское мнение такое, что аккумуляторы нового типа, это буквально то, что дало бы новый качественный скачок технологическому прогрессу, они ведь сейчас повсюду и все что нужно пользователю, постоянный рост емкости.
https://www.nature.com/articles/d41586-018-05752-3
За последние несколько десятков лет, литий-ионные батареи стали в 3 раза вместимее и в 30 раз дешевле — несмотря на это, темпы развития технологии замедляются, поскольку приблизились к фундаментальным ограничениям — к законам физики. Количество заряда, который может храниться в кристаллических структурах электродных материалов, приближается к теоретическому максимуму.
И это при том, что с каждым годом спрос на аккумуляторы растет, так как устройств которые их используют с каждым годом становится всё больше.
Хуже того, материалы, используемые в аккумуляторах — редкие металлы, такие как кобальт и никель, становятся все дороже и реже. За последние два года производство аккумуляторных батарей увеличилось почти в четыре раза, что сказалось на цене за килограмм кобальта — за те же два года цена выросла с 22$ до 81$, никель хоть и дешевле — но с 2015 года тоже подорожал с 9$ долларов до 14$.
Как утверждают авторы статьи на Nature, необходимо срочно разработать альтернативные типы электродов на основе дешевых, обычных металлов, таких как железо и медь, а так же повысить приоритет таким исследованиям.
Статья читается легко, но оставляет легкий привкус паники — так как срочно нужно что-то делать и хоть и есть уже какие-то примеры аккумуляторов где используются обычное железо и медь, пока они уступают технологии на кобальте и стоят в 2 раза дороже, поэтому исследователи просят государства и компании-производителей электрокаров спонсировать разработку нового вида аккумуляторов.
Мое обывательское мнение такое, что аккумуляторы нового типа, это буквально то, что дало бы новый качественный скачок технологическому прогрессу, они ведь сейчас повсюду и все что нужно пользователю, постоянный рост емкости.
https://www.nature.com/articles/d41586-018-05752-3
Nature
Ten years left to redesign lithium-ion batteries
Nature - Reserves of cobalt and nickel used in electric-vehicle cells will not meet future demand. Refocus research to find new electrodes based on common elements such as iron and silicon, urge...
Denis Sexy IT 🤖
Тут в Nature пишут интересное: ⚡️Осталось всего ~10 лет, чтобы найти какую-то замену литий-ионным аккумуляторам перед началом заметного кризиса в этой индустрии, так как редкие ресурсы вроде кобальта и никеля которые в них используются — ограничены и исчезнут…
В продолжение истории.
https://www.theverge.com/2018/8/15/17685634/germany-car-industry-battery-cells
https://www.theverge.com/2018/8/15/17685634/germany-car-industry-battery-cells
The Verge
Germany’s car industry can’t build its own battery cells
Angela Merkel gets impatient with VW, Daimler and BMW
Forwarded from The Batrachospermum Magazine
Иллюстрация из исследования чешских зоологов, которые решили проверить, будут ли синички больше бояться ястреба-перепелятника, если поменять ему расположение головы относительно туловища и хвоста 🤷♀️