O_o
Честно говоря никогда о таком не слышал, стало интересно почитать.
Честно говоря никогда о таком не слышал, стало интересно почитать.
Forwarded from echoinside
Unconventional Computing
Когда делаешь что нравится.
* h-index 51
* Google scholar
* Wiki
Adamatzky is known for his research in unconventional computing. In particular, he has worked on chemical computers using reaction–diffusion processes.[1] He has used slime moulds to plan potential routes for roadway systems[2][3] and as components of nanorobotic systems,[4][5] and discovered that they seek out sedatives in preference to nutrients.[6] He has also shown that the billiard balls in billiard-ball computers may be replaced by soldier crabs.[7][8]
Also, интересная документалочка 2014 года "The Creeping Garden", где Эндрю засветился, показывает более подробно о жизни плесени в стиле sci-fi (но я еще не смотрела).
Когда делаешь что нравится.
* h-index 51
* Google scholar
* Wiki
Adamatzky is known for his research in unconventional computing. In particular, he has worked on chemical computers using reaction–diffusion processes.[1] He has used slime moulds to plan potential routes for roadway systems[2][3] and as components of nanorobotic systems,[4][5] and discovered that they seek out sedatives in preference to nutrients.[6] He has also shown that the billiard balls in billiard-ball computers may be replaced by soldier crabs.[7][8]
Also, интересная документалочка 2014 года "The Creeping Garden", где Эндрю засветился, показывает более подробно о жизни плесени в стиле sci-fi (но я еще не смотрела).
Когда я первый раз прочел такой термин как “Unconventional Computing” то не придал этому значения, думая что речь идет о каких то странных языках программирования или типа того. Я ошибался. Речь идет о вычислениях на основе химических реакций(в данном случае). Мне нравится полет фантазий и я бы с удовольствием прочел какой нибудь хим-панк роман по этой тематике. У трисолярцев же в "Проблеме трех тел" была потрясная концепция эвм из жителей планеты, почему бы и химическую тему не развить. Из похожих концептов приходит в ум “Трансметрополитан”, где можно было вдыхать информацию, так же там были какие то мелкомолекулярные подслушивающие устройства.
Идея построения логических схем на основе химических реакций кажется не особенно сложной, да и плавает на поверхности. Когда готовил ознакомительный семинар про молекулярные машины, читал в обзор статье что в принципе можно не только клепать вращающиеся скелеты но и простенькие логические ворота, которые щелкают в определенных условиях. В принципе, чем то похоже на людей собирающие эвм из редстоунов в майнкрафте, задача конечно увлекательная, но практический интерес весьма спорный.
Оказалось uncovential computing значительно более интересная тема, и включает себя кучу неочевидных решений и принципов. Есть и какие то хитрые энцимные механизмы, механизмы вдохновлённые биологией, нейроны там, самособирающиеся системы. Вопрос зачем - все еще не отвечен, но говорят что таки странные химические компы могут уже решать такие задачи как: image processing, path planning, robot navigation, computational geometry, logical gates, counting, memory units. И это только автоматы на основе reaction-diffusion processors от Andrew Adamatzky. Внутри такого компа лежит реакция Белоусова — Жаботинского и Billiard-ball computer(https://en.wikipedia.org/wiki/Billiard-ball_computer. Я бы тут и дальше пересказывал бы вики по этой теме, но к несчастью она на этом кончается, а интерес остается.
Каких-то более менее упрощенных обзорных статей или научпоп на эту тему я не нашел, зато в 2004 вышла замечательная книжка. “Unconvential Programming Paradigms”. Выкладываю из нее вторую главу, котора я впринципе мягко описывает что там с химкомпами и как. Третьей главой как раз идут автоматы Andrew Adamatzky и вообще книга топовая, если вторая глава зайдет, то и целую книгу вы и без меня найдете.
Идея построения логических схем на основе химических реакций кажется не особенно сложной, да и плавает на поверхности. Когда готовил ознакомительный семинар про молекулярные машины, читал в обзор статье что в принципе можно не только клепать вращающиеся скелеты но и простенькие логические ворота, которые щелкают в определенных условиях. В принципе, чем то похоже на людей собирающие эвм из редстоунов в майнкрафте, задача конечно увлекательная, но практический интерес весьма спорный.
Оказалось uncovential computing значительно более интересная тема, и включает себя кучу неочевидных решений и принципов. Есть и какие то хитрые энцимные механизмы, механизмы вдохновлённые биологией, нейроны там, самособирающиеся системы. Вопрос зачем - все еще не отвечен, но говорят что таки странные химические компы могут уже решать такие задачи как: image processing, path planning, robot navigation, computational geometry, logical gates, counting, memory units. И это только автоматы на основе reaction-diffusion processors от Andrew Adamatzky. Внутри такого компа лежит реакция Белоусова — Жаботинского и Billiard-ball computer(https://en.wikipedia.org/wiki/Billiard-ball_computer. Я бы тут и дальше пересказывал бы вики по этой теме, но к несчастью она на этом кончается, а интерес остается.
Каких-то более менее упрощенных обзорных статей или научпоп на эту тему я не нашел, зато в 2004 вышла замечательная книжка. “Unconvential Programming Paradigms”. Выкладываю из нее вторую главу, котора я впринципе мягко описывает что там с химкомпами и как. Третьей главой как раз идут автоматы Andrew Adamatzky и вообще книга топовая, если вторая глава зайдет, то и целую книгу вы и без меня найдете.
Forwarded from SciСай (quantum forest)
Вводный семинар по python
Коллеги, в субботу 08.08.2020 в 18:00 по мск мы в зуме проводим семинар, на котором накатим анаконду и построим несколько спектров.
Соответственно, ведем себя как хорошие котики, и разносим эту новость по всем знакомым химикам как чуму и СПИД.
Если ты еще не был на наших семинарах, то мы ждем тебя!
Коллеги, в субботу 08.08.2020 в 18:00 по мск мы в зуме проводим семинар, на котором накатим анаконду и построим несколько спектров.
Соответственно, ведем себя как хорошие котики, и разносим эту новость по всем знакомым химикам как чуму и СПИД.
Если ты еще не был на наших семинарах, то мы ждем тебя!
Forwarded from SciСай (quantum forest)
Самый простой и универсальный способ подготовить свою windows-машинку к семинару - поставить анаконду, т.к. она уже имеет в себе питон+нужные либы: https://www.anaconda.com/products/individual
Для тех кто уже умеет, или просто работает с мака/линукса, можно ограничиться установкой питоновских либ NumPy и matplotlib любым удобным способом.
Еще желательно принести своих данных для простройки спектров, либо скачать тестовый набор: https://github.com/LebedevV/Optical-Data-Examples
Для тех кто уже умеет, или просто работает с мака/линукса, можно ограничиться установкой питоновских либ NumPy и matplotlib любым удобным способом.
Еще желательно принести своих данных для простройки спектров, либо скачать тестовый набор: https://github.com/LebedevV/Optical-Data-Examples
Anaconda
Download Anaconda Distribution | Anaconda
Download Anaconda's open-source Distribution today. Discover the easiest way to perform Python/R data science and machine learning on a single machine.
Тут ученые из Беларуси выступили открыто против тирании Лукашенко. Это очень мощно, особенно учитывая то, что обычно наука в снг очень близко сращена с гос аппаратом, где царит коррупция и несвобода. Тем более круто видеть свободных людей выступающих без страха и поступающих по совести.
https://people.onliner.by/2020/08/13/uchenye-podpisyvayut-obrashhenie-protiv-nasiliya-uzhe-bolee-1000-chelovek
https://people.onliner.by/2020/08/13/uchenye-podpisyvayut-obrashhenie-protiv-nasiliya-uzhe-bolee-1000-chelovek
Onliner
Ученые подписывают обращение против насилия — уже более 1000 человек
Об этом письме сообщил Владимир Гусаков, председатель президиума НАН Беларуси на встрече с директорами институтов (запись встречи есть в редакции). По его словам, около 500 молодых ученых составляют какую-то петицию против насилия и всего прочего. После этого…
Timur Madschidow подготовили сборник практических занятий по хемоинформатике на основе того, что преподает в магистратуре.
https://vk.com/chemoinformatics?w=wall-107190233_3032
https://vk.com/chemoinformatics?w=wall-107190233_3032
VK
Хемоинформатика и Молекулярное Моделирование
Тьюториал по хемоинформатике #хемоинформатика #LBDD #тьюториал Второй подарок (на этот раз от нашей лаборатории) в связи с достижением отметки в 2000 подписчиков. Мы с Рамилем Нугмановым, Тимуром Гимадиевым, Валентиной Афониной и Асимой Рахимбековой подготовили…
Peter_J_Feibelman_A_PhD_Is_Not_Enough!_A_Guide_to_Survival_in_Science.pdf
733.6 KB
Peter J. Feibelman - A PhD Is Not Enough!_ A Guide to Survival in Science (2011, Basic Books) - libgen.lc.pdf
На венере нашли фосфин, и предположили существование жизни! https://www.nature.com/articles/s41550-020-1174-4
Время перепоступать на экзобиологию.
Время перепоступать на экзобиологию.
Nature
Phosphine gas in the cloud decks of Venus
Nature Astronomy - The detection of ~20 ppb of phosphine in Venus clouds by observations in the millimetre-wavelength range from JCMT and ALMA is puzzling, because according to our knowledge...
Der Junge ist zurück. Und er ist wütend wie nie. Добро пожаловатьв новый сезон "Ноль по Хиршу"!
В новом выпуске подкаста мы с @quantum_forest поговорили о психологических проблемах в академии. Для того что бы не звучать полными лопухами мы позвали Марину Ветрову, психиатр-нарколог, научный сотрудник из Перовго Меда. Разговор получился классный, а Марина здорово заобьясняла нам, где в рамках позитивной ментал хелф тусовки булшит, а где правильные слова и действия. (Спойлер: получается что почти нигде не булшит).
/Soundcloud: https://soundcloud.com/user-863019305/mental-health
/ApplePodcasts https://podcasts.apple.com/ru/podcast/%D0%BC%D0%B5%D0%B4%D0%B0%D1%87-%D0%BF%D0%BE%D0%B4%D0%BA%D0%B0%D1%81%D1%82%D1%8B/id1391549843#episodeGuid=tag%3Asoundcloud%2C2010%3Atracks%2F934071955
/ЯндексМузыка https://music.yandex.ru/album/10656095/track/74004697
/Castbox https://castbox.fm/app/castbox/player/id1304490/id330182655
В новом выпуске подкаста мы с @quantum_forest поговорили о психологических проблемах в академии. Для того что бы не звучать полными лопухами мы позвали Марину Ветрову, психиатр-нарколог, научный сотрудник из Перовго Меда. Разговор получился классный, а Марина здорово заобьясняла нам, где в рамках позитивной ментал хелф тусовки булшит, а где правильные слова и действия. (Спойлер: получается что почти нигде не булшит).
/Soundcloud: https://soundcloud.com/user-863019305/mental-health
/ApplePodcasts https://podcasts.apple.com/ru/podcast/%D0%BC%D0%B5%D0%B4%D0%B0%D1%87-%D0%BF%D0%BE%D0%B4%D0%BA%D0%B0%D1%81%D1%82%D1%8B/id1391549843#episodeGuid=tag%3Asoundcloud%2C2010%3Atracks%2F934071955
/ЯндексМузыка https://music.yandex.ru/album/10656095/track/74004697
/Castbox https://castbox.fm/app/castbox/player/id1304490/id330182655
SoundCloud
Ноль по Хиршу #9 | гость: Марина Ветрова – ментальное здоровье, психика, депрессия в академии
Открываем новый сезон "Ноль по Хиршу" с подкаста, посвященного ментальному здоровью и психике. Сегодня у нас в гостях Марина Ветрова, психиатр-нарколог, научный сотрудник Санкт-Петербургского государс
Но это еще не все! В рамках подкаста мы затронули тему того, что вся доступная нам на данный момент информация о ментальных проблемах в академии характерна для западных студентов и ученых. Поэтому создали опросник на тему проблем ученых и студентов характерных для СНГ и постсоветского простравнства, что бы собрать побольше данных. Его можно заполнить тут: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLScuNj--GAU7N5gwwYJMV5GY9yxCoG01SN5w-PIp_sbZyq_6pQ/viewform
Google Docs
Мини-исследование постсоветской Академии
Здравствуйте!
В разговоре мы (ведущие подкаста "Ноль по Хиршу", Ростислав и Quantum Forest, и гость подкаста Марина Ветрова) затронули вопрос об устройстве академии в постсоветсвом пространстве и как у нас дела с психическим здоровьем людей в академии в России…
В разговоре мы (ведущие подкаста "Ноль по Хиршу", Ростислав и Quantum Forest, и гость подкаста Марина Ветрова) затронули вопрос об устройстве академии в постсоветсвом пространстве и как у нас дела с психическим здоровьем людей в академии в России…
Audio
А вот отдельным файлом, для тех, кто слушает в телеге
Forwarded from Гриша Тагильцев
Дойная корова
Давайте на секунду забудем про высокие цели и обсудим академическую карьеру с утилитарной точки зрения.
В науке есть устоявшаяся лестница карьерного роста: студент -> аспирант -> постдок -> временный профессор -> постоянный профессор (tenured). После постдока могут быть всякие пертурбации типа инструктора или senior research associate. Но, как правило, постдоки, которые хотят остаться в академии, метят в профессора. Эту ступень и обсудим.
При поиске профессорской позиции и создании лаборатории важно грамотно выбрать тему. Если из вас как из рога изобилия валят гениальные идеи, или вы прост забираете тему с постдока в свою лабу, то все хорошо. Если темы нет, то нужно ее искать.
Как вариант можно сделать лабу, основанную на каком-то методе и превратиться в часть инфраструктуры универа. Про этот вариант я уже рассказывал (тык).
Если это не для вас, то надо искать тему исследования. Как вариант можно почитать ревью. Обычно в конце авторы пишут, что именно в данной области еще не известно, и на какие вопросы предстоит ответить. Если ничего не нашли, можно самому почитать статьи и сложить из них общую картину — по-любому найдутся пробелы.
Но есть и читерский ход — заглянуть в базу данных грантов. Например у NIH — одного из крупнейших источников финансирования биомеда в США — есть система грантов NIH RePORTER. Там есть все: институты и фамилии исследователей, сколько им дали денег, и на какую тему. Даже абстракты прилагаются. Подобные базы данных есть во многих странах.
Допустим, вы хотите заниматься структурой рецепторов, но не знаете, какой именно рецептор выбрать для исследований. Ищете несколько разных рецепторов в NIH RePORTER. При первом же поиске можно оценить востребованность темы по количеству грантов в целом, и в каждом институте по отдельности. Если вас не берут в условный Гарвард, где вся поляна занята, то через несколько минут поиска можно найти, что криоэлектронный микроскоп для исследования структуры рецепторов есть и в далеком университете Монтаны, где конкуренция гораздо ниже.
Также можно прикинуть конкуренцию по количеству выпавших фамилий. Возможно многих вы уже знаете, если вы раньше крутились в этой области. Скорее всего эти же люди будут оценивать ваши заявки на гранты и давать отзывы на научные статьи.
И здесь надо найти золотую середину: чтобы ваша работа была востребована, но не захлебнуться в конкуренции. Многие профессора, которые удачно выбрали тему и смогли хорошо опубликоваться в первые годы, потом могут десятилетиями доить ее как корову, обновляя гранты раз за разом. Знаю таких лично, и в базе данных грантов их не сложно отследить.
Ну и надо отметить, что я сам еще аспирант: до профессора мне пахать и пахать. Умозаключения выше основаны на личных наблюдениях за карьерами старших знакомых: кто как делал, и у кого как получилось.
Снизу статистика по выдачам очень популярного гранта для профессоров — NIH-RO1. Больше статистики по грантам NIH на NIH Data Book.
Всем добра,
Тг
#научпоп
Давайте на секунду забудем про высокие цели и обсудим академическую карьеру с утилитарной точки зрения.
В науке есть устоявшаяся лестница карьерного роста: студент -> аспирант -> постдок -> временный профессор -> постоянный профессор (tenured). После постдока могут быть всякие пертурбации типа инструктора или senior research associate. Но, как правило, постдоки, которые хотят остаться в академии, метят в профессора. Эту ступень и обсудим.
При поиске профессорской позиции и создании лаборатории важно грамотно выбрать тему. Если из вас как из рога изобилия валят гениальные идеи, или вы прост забираете тему с постдока в свою лабу, то все хорошо. Если темы нет, то нужно ее искать.
Как вариант можно сделать лабу, основанную на каком-то методе и превратиться в часть инфраструктуры универа. Про этот вариант я уже рассказывал (тык).
Если это не для вас, то надо искать тему исследования. Как вариант можно почитать ревью. Обычно в конце авторы пишут, что именно в данной области еще не известно, и на какие вопросы предстоит ответить. Если ничего не нашли, можно самому почитать статьи и сложить из них общую картину — по-любому найдутся пробелы.
Но есть и читерский ход — заглянуть в базу данных грантов. Например у NIH — одного из крупнейших источников финансирования биомеда в США — есть система грантов NIH RePORTER. Там есть все: институты и фамилии исследователей, сколько им дали денег, и на какую тему. Даже абстракты прилагаются. Подобные базы данных есть во многих странах.
Допустим, вы хотите заниматься структурой рецепторов, но не знаете, какой именно рецептор выбрать для исследований. Ищете несколько разных рецепторов в NIH RePORTER. При первом же поиске можно оценить востребованность темы по количеству грантов в целом, и в каждом институте по отдельности. Если вас не берут в условный Гарвард, где вся поляна занята, то через несколько минут поиска можно найти, что криоэлектронный микроскоп для исследования структуры рецепторов есть и в далеком университете Монтаны, где конкуренция гораздо ниже.
Также можно прикинуть конкуренцию по количеству выпавших фамилий. Возможно многих вы уже знаете, если вы раньше крутились в этой области. Скорее всего эти же люди будут оценивать ваши заявки на гранты и давать отзывы на научные статьи.
И здесь надо найти золотую середину: чтобы ваша работа была востребована, но не захлебнуться в конкуренции. Многие профессора, которые удачно выбрали тему и смогли хорошо опубликоваться в первые годы, потом могут десятилетиями доить ее как корову, обновляя гранты раз за разом. Знаю таких лично, и в базе данных грантов их не сложно отследить.
Ну и надо отметить, что я сам еще аспирант: до профессора мне пахать и пахать. Умозаключения выше основаны на личных наблюдениях за карьерами старших знакомых: кто как делал, и у кого как получилось.
Снизу статистика по выдачам очень популярного гранта для профессоров — NIH-RO1. Больше статистики по грантам NIH на NIH Data Book.
Всем добра,
Тг
#научпоп