Сфероиды и ствижженое
2.05K subscribers
878 photos
171 videos
3 files
686 links
Хаотичные научные картинки и анимации. Свои и ворованные из твиттера и других мест. Иногда обсуждение всратых научных фейков.
Download Telegram
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Поющие мыши!

Исследование из Cold Spring Harbor Laboratory. Изучали чем поющие мыши отличаются от обычных и как далеко им до человеческого уровня разговоров (не очень)
👍27❤‍🔥8🔥2
#Фотожаб блотов в статьях это дело, конечно, понятное. Но на сайте, собственно, производителя антител? Термо, ты офигел.

Нашел Sholto David
😭38👏16😁6😱5🎉1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Глаза паука очень-очень не похожи на наши, например у них нет аккомодации. Как же восьминогому хищнику тогда наводиться на вкусную добычу? Ну.. аккомодации нет, зато есть саккады - движения глаз туда-сюда, позволяющие фокусироваться.

#Ствижжено у Lana the Bug
👍3714🤯4❤‍🔥1
Сфероиды и ствижженое
#Фотожаб блотов в статьях это дело, конечно, понятное. Но на сайте, собственно, производителя антител? Термо, ты офигел. Нашел Sholto David
Я часто говорю, что #фотожаб один не ходит. Если в статье есть один, наверняка где-то спрятались и остальные.

Так вот, антител Термо Сайнтифик это, видимо, тоже касается. Ещё одно нашёл Johan Duchen

3 и 4 это одно и то же пятно, но перевернутое
😢26😁63
#microscopy #image_processing

Мультиплексность - это когда мы красим в клетке в разные цвета разные части и можем наблюдать их независимо. И с самого начала это было одной из самых ценных фич флуоресцентной микроскопии. Ядро синее, митохондрии красные, лизосомы зелёные и смотрим как они все шебуршат относительно друг друга.

Но есть сложности - каждый отдельный канал это отдельный источник света и светофильтр, дополнительное время на сьемку (если надо менять что-то в процессе) и множество лишних сложностей.

В наш век ИИ естественно приходят в головы и другие решения. Весьма впечатляющий коллектив авторов из Италии предлагает алгоритм Micro𝕊plit (да, именно с такой 𝕊), который позволяет по морфологии и интенсивности окрашивания выделить в клетке отдельные органеллы, пусть даже все окрашено одним цветом.

Естественно вызывает скепсис, но весь код открыт и мануал очень подробный, надо попробовать

PS. А ещё из за этой понтовой 𝕊 оно даже нормально не отображается в гугле><
🥰94🤔2
Микроскопическая радость

Посмотрите на эту «ткань» материи. Присмотритесь внимательно! Не кажется ли вам, что в этом узоре есть какая-то ошибка, некий дефект? Словно опытная вязальщица где-то просчиталась в своей атомной схеме и попыталась скрыть эту досадную ошибку.

Не так давно я вам рассказывал про Дислокации, которые в середине прошлого века человек увидел в электронный микроскоп – те самые дефекты, благодаря которым все металлы могут деформироваться. В хороший добротный микроскоп мы такие дефекты наблюдаем в виде тонких ниточек. Но если вам повезло работать на микроскопе «с ума сойти, на что он способен!», то такие дислокации можно рассмотреть настолько близко, что вы сможете пересчитать каждый атом, составляющий дислокацию. Когда я сделал этот снимок, то следующие 3 часа именно этим я и занимался – считал атомы, в деталях разбирая ошибку природы-вязальщицы. И ещё я подумал, что этот снимок непременно должна увидеть общественность.

И спустя 14 месяцев, как я сделал сей снимок, это случилось. На этой неделе журнал Ultramicroscopy опубликовал нашу с коллегой столь долгожданную статью!!! Конечно на одном красивом снимке статью не напишешь (у многих сейчас есть «с ума сойти…» микроскопы) – поэтому этот снимок выступил в статье в качестве эдакой "вишенки на торте». Сама работа посвящена методическим хитростям подготовки объектов для подобного рода исследований при помощи электронно-ионного микроскопа (мне больше нравится его называть «электронный микроскоп с ионной пушкой»).

Что же до дислокации – на последних двух картинках я сделал небольшое пояснение, в чём заключается дефект решетки. Дело в том, что в правой части картинки на две атомных плоскости меньше, чем в левой. Как результат совмещения левой и правой части вы видите эдакий стежок – ядро дислокации. Но здесь этой дислокации не рады (кроме меня, естественно), потому что выросла она в структуре микроэлектронного устройства – транзистора с высокой подвижностью электронов (HEMT). Технологи-микроэлектронщики всеми силами стараются, чтобы их устройства были свободны от дислокаций, а мы в этом деле им помогаем, показывая, что у них получается.

Приятно, когда задуманное свершается. Именно этого я вам и желаю – чтобы ваши самые смелые идеи воплощались в жизнь!

На снимке: ядро краевой дислокации в AlGaN гетероструктуре, HAADF HRSTEM

Статью можно найти тут: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0304399126000835
🔥429❤‍🔥6🤔1🤩1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#сфероиды #image_processing

Контрольный сфероид из MCF-7, полученный методом агарозных микроячеек (кому ещё нужны штампы ,чтобы делать таких ребят самим, пишите).

В ходе обработки картинок пришла в голову идея покрасить клетки в зависимости от того, насколько им там тесно. Почему-то мне не попадалась в статьях такая визуализация, хотя мне кажется красиво.

Красный - ядра очень близки друг к другу, синий, соответственно, далеко.
🔥23❤‍🔥2
Сфероиды и ствижженое
Photo
Нашли уже больше сотни #фотожаб в антителах Термо и список продолжает расти.

Любой желающий может подключиться.
🤬34🙈10🔥82👌1
Фоточки белков в оптический микроскоп

Я использую для визуализации больших и плотных сфероидов 4x экспансионную микроскопию: т.е. клетки изотропно раздуваются примерно в 4 раза. Когда нужно визуализировать всякие органеллы используют 10x и подобные же подходы для крупных белковых структур.

Однако что если хочется большего? Абсолютно никто не мешает растянуть образец, а потом снова залить его в гель и снова растянуть. Так работает итеративная экспансионная микроскопия и здесь пределов уже нет (ну, кроме того, что при каждом растяжении объекты неизбежно страдают и теряется интенсивность окрашивания).

И вот только что вышел препринт, который исчерпывающе озаглавлен Thousandfold Expansion Microscopy.

Это уже не для клеточек, а для отдельных белков, как методика, конкурирующая с крио-ТЕМ. Подходы, при этом, сходные именно с этой методикой, потому что красивую картинку одиночной молекулы получить нельзя, картинка статистически строится из изображений сотен молекул в разной ориентации.

#microscopy #expansion
🔥233
Розовая секс игрушка силиконовая форма для молдов, сами молды с клетками, их микроскопия и молды в гистологической кассете.

Попытка сделать сфероидов прямо в агарозном молде номер 463. Переработал формат молдов так, чтобы агарозы было минимально возможное количество, потому как в литературе, вроде, у людей это получается без особых сложностей. Возможно моя проблема как раз в избытке геля, плохо совместимого с парафином.
14🔥8💯4