#expansion #microscopy

Вся экспансионная микроскопия основана на погружении клеток в гель, который связывается с клетками и потом, насыщаясь водой, изотропно увеличивается в размерах.

Ключевая сложность в этом самом "связывается", потому как это происходит, в основном, по аминогруппе. Таковых сколько угодно у белков, прилично у нуклеиновых кислот, а вот другие молекулы типа липидов остаются в стороне.

Проблему постарались решить авторы статьи "Landscape expansion microscopy reveals interactions between membrane and phase-separated organelles".

Проблема связывания геля с липидами никуда не делась, но они покрасили их особенным красителем у которого длинный разлапистый хвост с кучей NH2. Соответственно мы изотропно растягиваем не липиды как таковые, а краситель, который в них накопился. С довольно красивым результатом.

#фейспалм #дезинсекция

Публикационное жульничество в УрФУ: новый год - старые фокусы

Те, кто нас читает хотя бы годик, вероятно, прекрасно помнит, как наш Зоопарк внезапно обнаружил колоссальных масштабов махинацию в Уральском федеральном университете. Как совершенно однозначно следует из открытых данных, в последние годы от четверти до трети публикаций УрФУ в журналах, индексируемых Scopus - результат найма крайне сомнительных иностранных (в основном египетских и индийских) "специалистов", которые, судя по всем признакам, просто-напросто массово покупают на "биржах статей" соавторство. Речь идет о сотнях статей, и это доходит до абсурда: например, один такой "великий уральский ученый", некто А. Кумар, стал самым плодовитым "российским" автором 2025 года с 280 (!!!) статьями. Кто хочет узнать больше веселых подробностей, см. напр. тут и вот тут.

К чему мы это вспомнили? К Дню российской науки УрФУ решил похвастаться своими великими публикационными показателями, поэтому мы решили немножечко напомнить городу и миру, что стоит за этими цифрами - ну и заодно посмотреть, а как у нас дела обстоят в 2026 году, благо из него уже прошел аж месяц.

На момент написания этого поста с аффилиацией УрФУ за текущей год в Scopus находится 237 работ, из которых плюс-минус 70 имеют все те же признаки египетско-индийского происхождения, то есть никакого отношения к реально делаемой в УрФУ науке не имеющие. Нетрудно посчитать, что это все те же "от трети до четверти" публикаций, из чего мы делаем простой вывод: ничего не изменилось.

Наше отношение к этому делу мы уже формулировали: с учетом того, что за публикации в УрФУ платят, совершенно очевидна мотивация организаторов этой схемы. Не утверждаем наверняка, но имеем все основания полагать, что, помимо самих "индо-египтян", в УрФУ имеются вполне себе российские прямые бенефициары всего этого бардака.

Своими действиями УрФУ наносит нашей стране двойной вред. Во-первых, за рубеж каким-то непонятным мутным "тоже ученым" уходят миллионы российских бюджетных рублей, которые могли бы быть потрачены на настоящие исследования (или на что-нибудь другое общеполезное).
Во-вторых, все это бьет по репутации российской науки на мировой арене: публикационное жульничество в таких масштабах встречается, конечно, не только у нас, но каждый такой случай - жирный минус в карму всем нам.

Вопрос во всей этой ситуации у нас как минимум один - к новоявленному ректору УрФУ: г-н Обабков, вы и правда не в курсе, что у вас там творится? Или в курсе, но вас все устраивает? Или вам просто наплевать?

На картинке: топ-10 ученых УрФУ по числу публикаций. Выводы делайте сами

#Ствижжено у индийского астронавта Shubhanshu Shukla
#space

В космосе многие рутиные процессы становятся неожиданно сложными. Здесь, внизу, мы даже не осознаем насколько привыкли использовать гравитацию.

Простая задача, отобрать из контейнера жидкость, не забрав пузыри воздуха. Всего лишь нужно перевернуть контейнер и... Ага. Не всплывут.

Приходится использовать самого себя как центрифугу.

Два набора пробников штампов для изготовления сфероидов в агарозных микроячейках уехали в два разных места в Москве.

Надо как-то посчитать, сколько их там уже скопилось..

#WUT

Человек выкашлял четыре чашки мочи, после этого умер и у него в грудной клетке нашли почку.

Именно этому уникальному случаю посвящен #case_report, опубликованный аж в 1923 году в голландском журнале Nederlands Tijdschrift voor Geneeskunde (Dutch Journal of Medicine). Как выяснилось это был прикол студентов медиков и их профессора, которым было интересно, насколько дикую фигню можно опубликовать.

Статья была ретрактнута из журнала в 2003, что делает её абсолютным чемпионом в сомнительном соревновании на самый долгий ретракт.

Красивая история о том как новые технологии в микроскопии постепенно двигают медицину.

В 2018 году коллектив под руководством Ali Ertürk опубликовали методику полного просветления, окрашивания и визуализации животного с клеточным разрешением (vDISCO). В этой статье они не просто наделали красивых картинок, но ещё и обнаружили новую штуку. Сосуды, соединяющие мозговые оболочки с черепным костным мозгом, заполненные иммунными клетками. Вероятно это новая, не описанная ранее, часть глимфатической системы ГМ.

В 2023 году этот же коллектив подтвердил существование аналогичных анатомических структур у человека и описал изменения в них при инсульте.

И наконец в январе 2026 года они же опубликовали работу, где показали использование этих самых сосудов для доставки лекарств прямо в головной мозг. Такой метод доставки они назвали intracalvariosseous (ICO) иньекция. В своей работе они использовали альбуминовые наночастицы, которые захватывались имунными клетками и уже с ними шли в мозг.

Эти самые short skull meninges connections (SMCs) из статьи 2019 года

И вот ещё они, только чуть лучше показаны окружающие ткани

#spheroids
Иногда людям нужны полноценные органоиды, для того чтобы исследовать на них всякие штуки, иногда достаточно маленького, но правдоподобного кусочка органа. В данном случае речь идёт о криптах кишечника - крохотных ямках, наполненых специальными клетками. Чтобы такие сделать нужно поместить правильные клетки в скаффолд с маленькими ямками, где сама механика вынуждает их формировать крипты, вполне похожие по свойствам на настоящие.

Так вот, в свежей работе люди использовали двухфотонную 3d печать, чтобы сделать микроштампики, благодаря которым они смогли сделать в матригель-коллагеновом геле микроячейки разного диаметра, в которых сформировались вполне себе правдоподобные крипты (криптоиды?).

И да, в своей диссертации, я пытаюсь сделать примерно белковые мембраны с подобными структурами. Не ради крипт, а просто ради фана научного интереса. Но теперь есть убедительное объяснение "зачем". Разрешение у меня, конечно, далеко не двухфотонное, самая маленькая ямка порядка 300 мкм, но тем не менее.

Уважаемые читатели, при нажатии на картинку в недавнием репосте (про пчёл и члены) телефон пытался скачивать что-то.
Пост был снесен, прошу прощения, надеюсь никто никакую гадость не подцепил.

#spheroids

Когда слышишь слово киборг, разумеется думаешь о Мотоко Кусанаги! Ну ладно, по крайней мере о создании, где биология перемешана с электроникой до неразделимости, способном перепрыгивать небоскрёбы и видеть в темноте.

До этого осталось недолго. А пока нате вам панкреатические кибер-островки (препринт)! Коллектив из США вырастил органоиды островков (часть поджелудочной, которая выделяет инсулин и всякие другие гормоны) на сетке контактов, которые обычно применяют для исследований в нейрофизиолгии и изучали электрическую активность островков.

Первое открытие: она (электрическая активность) там есть! Второе: в островке существуют циркадные ритмы, как среди альфа, так и среди бета-клеток, которые определяют кто и когда выделяет гормоны.

Хотите увидеть пенис черепах?

Оказывается зоологи тоже не чужды современным методам услад! В работе Donald McKnigh с соавторами Good vibrations: a novel method for sexing turtles (Acta Herpetologica, 2017) поставил задачу разработать и оценить новый, простой и неинвазивный метод определения пола черепах. Оказалось, для этого отлично подходит простой советский вибратор!

Вместо традиционных методов (внешние признаки, измерения морфологии, анализ крови или инвазивные процедуры) авторы использовали вибрацию на определенных участках тела черепах, чтобы стимулировать выведение наружу пениса самцов. А если пенис выводится - значит самец!

Метод тестировали на 4 видах пресноводных черепах. Этот подход конечно не универсальный, точность варьировала от 55 до 100%. Но зато простой и веселый.

Энжойте! Теперь вы знаете, как увидеть сокрытое у черепах!

#ИИжаб
#Ствижжено у Andy Hall


P-hacking - народная забава ученых. Если не вдаваться в хтонические глубины статистики - p-критерий показывает насколько наш результат достоверен. Если наш результат нам не нравится, можно использовать черную магию и деликатный массаж данных таким образом, чтобы все, в итоге, подтвердило нашу гипотезу. Это грешно, не делайте так. Я̶̧͚̖̩͉̘҇͊́̚ в̷̧͚̪̫̥͉̝̭̭͗̄͗͗̽̽͛̕а̵͚̲͎͍͋͐̉͊̎͆̕̚͢с̵̧̛̫͓̜͓̂̃ н҉̢̟͓̜̟́͌͗͞а̴̡̭͚̲͚͈̫̅̏̉̓͑͞й̶̪̫͕͙̈́͛͢͞д̸̨͉̰͈͓͍̤̰͍́̂̓̕у҉̧̛̱͉͇̥̞̯̤̋̅̐̆́ͅ

Так вот, ученых из Стэнфорда заинтересовало, насколько LLMки склонны к p-хакингу. Они взяли данные из нескольких статей по политологии (там и так воспроизводимость сомнительная) и попытались убедить ИИшку в том, что гипотезу там все таки надо подтвердить. Надо сказать LLMки (Claude Opus 4.6 и GPT-5.2-Codex) отчаянно сопротивлялись. Но, в итоге, ученые, смогли уломать компьютер на мошенничество.

Выводы: С одной стороны LLM не делает это сам по себе. С другой - он может это делать.

Комментарий от читателя

Плацебо-операции делают! Ну, знаете, когда с больного слупили денег за все анализы по подготовке, сделали ЭКГ, заставили постоять в очереди с утра голодным в приёмном покое, наорали за забытый анализ по антителам оспы, провели пугающую консультацию вынужденно трезвого сонного анестезиолога, покатали на каталке, дали общий наркоз и сделали разрезы.

И потом их почти сразу зашили.

Это, если что, офигенный способ проконтролировать как работают обычные протоколы операций, примерно как плацебо-таблетки. Проблема в том, что там есть риски с тем же наркозом и инфекциями от разрезов. Но каждый раз это оказывается ужасно познавательно.

Поехали!

2002-й год — тогда только в США делали 650 тысяч артроскопических операций на коленном суставе при остеоартрите. Каждая стоит около 5 тысяч долларов. В колено через разрезы пихают камеру и инструменты. Хирург либо просто промывает сустав, либо удаляет ошметки хряща и мениска, шлифует неровности.

Взяли 180 пациентов с остеоартритом колена и болями, которые не снимались таблетками.
— 59 человек прошли полноценную операцию.
— 61 только промывку (им ничего не отрезали и не шлифовали).
— 60 человек просто художественно порезали — делали три операционных раны на коже, как при обычной артроскопии.

Делали под местной анестезией, чтобы не рисковать наркозом, но давали подышать веществами для вертолётов. И хирург устраивал театр: просил инструменты, двигал коленом, как при настоящей операции, плескал воду на пол, промывание сустава. Матерился ли анестезилог, неизвестно.

Результат — плацебо так же эффективно, как операция. Или лучше по некоторым показателям. После расчёта статзначимости — разницы между подходами нет. Под конец замеров пациентов спрашивали, какую операцию, по их мнению, им сделали. Группа плацебо угадывала не чаще других.

Тут удаляли часть потрёпанного возрастом мениска. Таких операций только в США 700 тысяч в год. 146 пациентов, у всех на МРТ разрыв внутреннего мениска. В театральной части ещё прикладывали вибратор к колену, чтобы пациент прям проникся, как ему пилят кость. Удивительно, но этический комитет одобрил даже это. Терапевты, которые потом год вели пациентов, не знали, у кого была операция, у кого — нет.

Результат — разницы с плацебо нет!

В 1950-х годах врачи перевязывали внутреннюю грудную артерию, чтобы направить больше крови к сердцу при стенокардии. Это было первое строгое исследование с плацебо-группой в хирургии. Пациенты с плацебо-операцией чувствовали себя как с настоящей, прям лучше. Всего 17 человек, выборки кривые, но по тем временам это было нормально.

А вот современная работа по кардиологии и Ланцет. Проверяли эффективность стентирования (установки расширителя в сосуд) при стабильной стенокардии. Пациентам в плацебо-группе проводили процедуру ангиографии, но стент не ставили. Разницы нет, но мерили через 6 недель. Это вызвало огромный скандал и дискуссии в кардиологическом сообществе. Полыхает там до сих пор.

Тут переломы позвоночника из-за остеопороза — там часто вводят костный цемент. В этом исследовании плацебо-группе просто имитировали иглу и запах цемента в операционной. 131 человек.

Снова разницы нет, но есть нюансы:
— После тем, кто ещё чувствовал боль, сделали настоящую вертебропластику.
— В плацебо-группе 51% пациентов захотел настоящую операцию, а в обычной группе 13%. Возможно, у них были шкалы, которые не улавливали разницу, либо театр где-то провалился.
— В плацебо-группе доигрались до серьёзных осложнений — была тахикардия и озноб.

И ещё болезнь Паркинсона, 40 человек, частично работает, но есть нюансы.

Напоследок мета — 156 испытаний плацебо-хирургии. В 51% этих исследований настоящая операция оказалась не эффективнее плацебо. Подчёркивают, что без таких испытаний мы продолжаем делать тысячи бесполезных операций ежегодно. Но тут в обзор попали только опубликованные статьи. Возможно, скучное, где плацебо не срабатывало, не публиковали.

Про эту историю напомнил @DGNLTD.

--
Вступайте в ряды Фурье! | Плацебо-посты
— Девушка, позвольте, я вам помогу!
— Спасибо, но сумка не тяжёлая.
— А я не про сумку. Я пластический хирург.

#пост_по_регламенту

Итак, начинаем выкладывать трудолюбиво собранные нашим Зоопарком папки, которые, как нам кажется, уже более или менее готовы. Если кто еще хочет в них добавиться - пишите ЛС нашего Зоопарка или в комменты (но не затягивайте, максимум в течение пары часов, иначе теряется смысл).

Встречайте, смотрите, выбирайте на свой вкус и добавляйтесь - тематические подборки:

Биология и сельское хозяйство (40 каналов)

Науки о Земле (37 каналов)

В процессе сборки:

-физика
-химия
-гуманитарные науки
-медицина
-инженеры-технари
-"научно-общеполезное"

Как и раньше, собираем отдельно "мегапапку" - самые крупные, избранные каналы о науке и образовании (или просто особо понравившиеся нам).